Strukturna klasifikacija proteina
From Wikipedia, the free encyclopedia
Strukturna klasifikacija proteina, engleski: (SCOP), je baza podataka koja prvenstveno sadrži manualnu klasifikacija proteinskih strukturnih domena. Ona je bazirana na sličnosti njihovih aminokiselinskih sekvenci i tri-dimenzionih struktura. Originalno je objavljena 1995.[1] i obično se ažurira jednom godišnje. Održavaju je Alexej Murzin i njegove kolege,[2][3].
Hijerarhijska struktura
SCOP sadrži četiri nivoa hijerarhijske strukturne klasifikacije:
- klasa - generalna "strukturna arhitektura" domena
- nabor - slična organizacija regularne sekundarne strukture ali bez evidencije o evolucionoj povezanosti
- superfamilija - dovoljna strukturna i funkciona sličnost da se izvede zaključak o divergentnoj evolucijskoj vezi, mada homologija sekvenci ne postoji
- familija - sličnost sekvenci se može detektovati
Povezano
- CATH
- FSSP
- SUPERFAMILY
Referenc
Vanjske veze
Wikiwand - on
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.