நாகர்கோவில் கிருஷ்ணன் கோயில் என்பது தமிழ்நாடு மாநிலத்தில் கன்னியாகுமரி மாவட்டத்தின் நாகர்கோவில் பகுதியின், கிருஷ்ணன்கோவில் புறநகர்ப் பகுதியில் அமையப் பெற்றுள்ள ஒரு பெருமாள் கோயில் ஆகும். குமரியின் குருவாயூர் என்றும் இக்கோயில் அழைக்கப்படுகிறது.