APOBEC2

APOBEC2 (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот, а молекулярна маса — 25 703^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQKEEAAVA		TEAASQNGED		LENLDDPEKL		KELIELPPFE		IVTGERLPAN
FFKFQFRNVE		YSSGRNKTFL		CYVVEAQGKG		GQVQASRGYL		EDEHAAAHAE
EAFFNTILPA		FDPALRYNVT		WYVSSSPCAA		CADRIIKTLS		KTKNLRLLIL
VGRLFMWEEP		EIQAALKKLK		EAGCKLRIMK		PQDFEYVWQN		FVEQEEGESK
AFQPWEDIQE		NFLYYEEKLA		DILK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

APOBEC2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NYT
Ідентифікатори
Символи	APOBEC2, ARCD1, ARP1, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604797 MGI: 1343178 HomoloGene: 4941 GeneCards: APOBEC2
Онтологія гена Молекулярна функція • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines • zinc ion binding • каталітична активність • hydrolase activity • зв’язування з іоном металу • RNA binding • cytidine deaminase activity • identical protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • DNA demethylation • mRNA processing • mRNA modification • cytidine deamination • cytidine to uridine editing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10930	11811
Ensembl	ENSG00000124701	ENSMUSG00000040694
UniProt	Q9Y235	Q9WV35
RefSeq (мРНК)	NM_006789	NM_009694
RefSeq (білок)	NP_006780	NP_033824
Локус (UCSC)	Хр. 6: 41.05 – 41.06 Mb	Хр. 17: 48.73 – 48.74 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain. Cell. 145: 423—434. PMID 21496894 doi:10.1016/j.cell.2011.03.022
• Prochnow C., Bransteitter R., Klein M.G., Goodman M.F., Chen X.S. (2007). The APOBEC-2 crystal structure and functional implications for the deaminase AID. Nature. 445: 447—451. PMID 17187054 doi:10.1038/nature05492