CASP1

CASP1 (англ. Caspase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 404 амінокислот, а молекулярна маса — 45 159^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADKVLKEKR		KLFIRSMGEG		TINGLLDELL		QTRVLNKEEM		EKVKRENATV
MDKTRALIDS		VIPKGAQACQ		ICITYICEED		SYLAGTLGLS		ADQTSGNYLN
MQDSQGVLSS		FPAPQAVQDN		PAMPTSSGSE		GNVKLCSLEE		AQRIWKQKSA
EIYPIMDKSS		RTRLALIICN		EEFDSIPRRT		GAEVDITGMT		MLLQNLGYSV
DVKKNLTASD		MTTELEAFAH		RPEHKTSDST		FLVFMSHGIR		EGICGKKHSE
QVPDILQLNA		IFNMLNTKNC		PSLKDKPKVI		IIQACRGDSP		GVVWFKDSVG
VSGNLSLPTT		EEFEDDAIKK		AHIEKDFIAF		CSSTPDNVSW		RHPTMGSVFI
GRLIEHMQEY		ACSCDVEEIF		RKVRFSFEQP		DGRAQMPTTE		RVTLTRCFYL
FPGH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

CASP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BMQ, 1IBC, 1ICE, 1RWK, 1RWM, 1RWN, 1RWO, 1RWP, 1RWV, 1RWW, 1RWX, 1SC1, 1SC3, 1SC4, 2FQQ, 2H48, 2H4W, 2H4Y, 2H51, 2H54, 2HBQ, 2HBR, 2HBY, 2HBZ, 3D6F, 3D6H, 3D6M, 3E4C, 3NS7, 5FNA
Ідентифікатори
Символи	CASP1, ICE, IL1BC, P45, caspase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 147678 MGI: 96544 HomoloGene: 133272 GeneCards: CASP1
шифр КФ	3.4.22.36
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • endopeptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • kinase binding • cysteine-type endopeptidase activity • CARD domain binding • identical protein binding • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway Клітинна компонента • NLRP3 inflammasome complex • цитоплазма • гіалоплазма • NLRP1 inflammasome complex • extracellular region • AIM2 inflammasome complex • мітохондрія • IPAF inflammasome complex • protease inhibitor complex • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • cellular response to organic substance • response to ATP • response to hypoxia • response to bacterium • membrane hyperpolarization • Піроптоз • protein processing • toxin transport • протеоліз • cellular response to mechanical stimulus • response to lipopolysaccharide • regulation of autophagy • interleukin-1 beta production • mitochondrial depolarization • programmed necrotic cell death • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • regulation of apoptotic process • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • regulation of inflammatory response • execution phase of apoptosis • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to interferon-gamma • protein autoprocessing • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • positive regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • cytokine-mediated signaling pathway • cellular response to cytokine stimulus • apoptotic signaling pathway • positive regulation of interleukin-1 beta production Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	834	12362
Ensembl	ENSG00000137752	ENSMUSG00000025888
UniProt	P29466	P29452
RefSeq (мРНК)	NM_001223 NM_001257118 NM_001257119 NM_033292 NM_033293 NM_033294 NM_033295	NM_009807
RefSeq (білок)	NP_001214 NP_001244047 NP_001244048 NP_150634 NP_150635 NP_150636 NP_150637	NP_033937
Локус (UCSC)	Хр. 11: 105.03 – 105.04 Mb	Хр. 9: 5.3 – 5.31 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Alnemri E.S., Fernandes-Alnemri T., Litwack G. (1995). Cloning and expression of four novel isoforms of human interleukin-1 beta converting enzyme with different apoptotic activities. J. Biol. Chem. 270: 4312—4317. PMID 7876192 doi:10.1074/jbc.270.9.4312
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Feng Q., Li P., Leung P.C.K., Auersperg N. (2004). Caspase-1 zeta, a new splice variant of caspase-1 gene. Genomics. 84: 587—591. PMID 15498465 doi:10.1016/j.ygeno.2004.06.005
• Humke E.W., Shriver S.K., Starovasnik M.A., Fairbrother W.J., Dixit V.M. (2000). ICEBERG: a novel inhibitor of interleukin-1beta generation. Cell. 103: 99—111. PMID 11051551 doi:10.1016/S0092-8674(00)00108-2
• Romanowski M.J., Scheer J.M., O'Brien T., McDowell R.S. (2004). Crystal structures of a ligand-free and malonate-bound human caspase-1: implications for the mechanism of substrate binding. Structure. 12: 1361—1371. PMID 15296730 doi:10.1016/j.str.2004.05.010