CASP2

CASP2 (англ. Caspase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 452 амінокислот, а молекулярна маса — 50 685^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPSAGSWS		TFQHKELMAA		DRGRRILGVC		GMHPHHQETL		KKNRVVLAKQ
LLLSELLEHL		LEKDIITLEM		RELIQAKVGS		FSQNVELLNL		LPKRGPQAFD
AFCEALRETK		QGHLEDMLLT		TLSGLQHVLP		PLSCDYDLSL		PFPVCESCPL
YKKLRLSTDT		VEHSLDNKDG		PVCLQVKPCT		PEFYQTHFQL		AYRLQSRPRG
LALVLSNVHF		TGEKELEFRS		GGDVDHSTLV		TLFKLLGYDV		HVLCDQTAQE
MQEKLQNFAQ		LPAHRVTDSC		IVALLSHGVE		GAIYGVDGKL		LQLQEVFQLF
DNANCPSLQN		KPKMFFIQAC		RGDETDRGVD		QQDGKNHAGS		PGCEESDAGK
EKLPKMRLPT		RSDMICGYAC		LKGTAAMRNT		KRGSWYIEAL		AQVFSERACD
MHVADMLVKV		NALIKDREGY		APGTEFHRCK		EMSEYCSTLC		RHLYLFPGHP
PT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

CASP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1PYO, 2P2C, 3R5J, 3R6G, 3R6L, 3R7B, 3R7N, 3R7S, 3RJM
Ідентифікатори
Символи	CASP2, CASP-2, ICH1, NEDD-2, NEDD2, PPP1R57, caspase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600639 MGI: 97295 HomoloGene: 7254 GeneCards: CASP2
Реагує на сполуку
emricasan[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • protein domain specific binding • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • hydrolase activity • identical protein binding • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • мітохондрія • клітинне ядро Біологічний процес • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • execution phase of apoptosis • protein processing • GO:0010260 старіння людини • positive regulation of apoptotic signaling pathway • luteolysis • cellular response to mechanical stimulus • positive regulation of neuron apoptotic process • brain development • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • positive regulation of apoptotic process • ectopic germ cell programmed cell death • apoptotic signaling pathway • neural retina development • GO:0097285 апоптоз • regulation of apoptotic process • протеоліз • negative regulation of apoptotic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	835	12366
Ensembl	ENSG00000106144	ENSMUSG00000029863
UniProt	P42575	P29594
RefSeq (мРНК)	NM_032983 NM_001224 NM_032982 NM_032984	NM_007610
RefSeq (білок)	NP_001215 NP_116764 NP_116765	NP_031636
Локус (UCSC)	Хр. 7: 143.29 – 143.31 Mb	Хр. 6: 42.24 – 42.26 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• Wang L., Miura M., Bergeron L., Zhu H., Yuan J. (1994). Ich-1, an Ice/ced-3-related gene, encodes both positive and negative regulators of programmed cell death. Cell. 78: 739—750. PMID 8087842 doi:10.1016/S0092-8674(94)90422-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Xue D., Shaham S., Horvitz H.R. (1996). The Caenorhabditis elegans cell-death protein CED-3 is a cysteine protease with substrate specificities similar to those of the human CPP32 protease. Genes Dev. 10: 1073—1083. PMID 8654923 doi:10.1101/gad.10.9.1073
• Koseki T., Inohara N., Chen S., Nunez G. (1998). ARC, an inhibitor of apoptosis expressed in skeletal muscle and heart that interacts selectively with caspases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 5156—5160. PMID 9560245 doi:10.1073/pnas.95.9.5156
• Tinel A., Tschopp J. (2004). The PIDDosome, a protein complex implicated in activation of caspase-2 in response to genotoxic stress. Science. 304: 843—846. PMID 15073321 doi:10.1126/science.1095432
• Vakifahmetoglu H., Olsson M., Orrenius S., Zhivotovsky B. (2006). Functional connection between p53 and caspase-2 is essential for apoptosis induced by DNA damage. Oncogene. 25: 5683—5692. PMID 16652156 doi:10.1038/sj.onc.1209569