CASP4

CASP4 (англ. Caspase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 377 амінокислот, а молекулярна маса — 43 262^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEGNHRKKP		LKVLESLGKD		FLTGVLDNLV		EQNVLNWKEE		EKKKYYDAKT
EDKVRVMADS		MQEKQRMAGQ		MLLQTFFNID		QISPNKKAHP		NMEAGPPESG
ESTDALKLCP		HEEFLRLCKE		RAEEIYPIKE		RNNRTRLALI		ICNTEFDHLP
PRNGADFDIT		GMKELLEGLD		YSVDVEENLT		ARDMESALRA		FATRPEHKSS
DSTFLVLMSH		GILEGICGTV		HDEKKPDVLL		YDTIFQIFNN		RNCLSLKDKP
KVIIVQACRG		ANRGELWVRD		SPASLEVASS		QSSENLEEDA		VYKTHVEKDF
IAFCSSTPHN		VSWRDSTMGS		IFITQLITCF		QKYSWCCHLE		EVFRKVQQSF
ETPRAKAQMP		TIERLSMTRY		FYLFPGN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

CASP4
Ідентифікатори
Символи	CASP4, ICE(rel)II, ICEREL-II, ICH-2, Mih1/TX, TX, Mih1, caspase 4
Зовнішні ІД	OMIM: 602664 MGI: 107700 HomoloGene: 136493 GeneCards: CASP4
Реагує на сполуку
emricasan[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • cysteine-type endopeptidase activity • CARD domain binding • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • NLRP3 inflammasome complex • цитоплазма • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • extracellular region • AIM2 inflammasome complex • IPAF inflammasome complex • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • inflammasome complex • гіалоплазма • клітинна мембрана • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • regulation of apoptotic process • GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть • процес імунної системи • протеоліз • intrinsic apoptotic signaling pathway • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress • regulation of inflammatory response • вроджений імунітет • inflammatory response • cellular response to amyloid-beta • GO:0097285 апоптоз • execution phase of apoptosis • positive regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	837	12363
Ensembl	ENSG00000196954	ENSMUSG00000033538
UniProt	P49662	P70343
RefSeq (мРНК)	NM_001225 NM_033306 NM_033307	NM_007609
RefSeq (білок)	NP_001216 NP_150649	NP_031635 NP_001366247 NP_001366248 NP_001366249 NP_001366250 NP_001366251 NP_001366252
Локус (UCSC)	Хр. 11: 104.94 – 104.97 Mb	Хр. 9: 5.31 – 5.34 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Lin X.Y., Choi M.S., Porter A.G. (2000). Expression analysis of the human caspase-1 subfamily reveals specific regulation of the CASP5 gene by lipopolysaccharide and interferon-gamma. J. Biol. Chem. 275: 39920—39926. PMID 10986288 doi:10.1074/jbc.M007255200
• Sollberger G., Strittmatter G.E., Kistowska M., French L.E., Beer H.D. (2012). Caspase-4 is required for activation of inflammasomes. J. Immunol. 188: 1992—2000. PMID 22246630 doi:10.4049/jimmunol.1101620