CD40LG

CD40LG (англ. CD40 ligand) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 261 амінокислот, а молекулярна маса — 29 274^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIETYNQTSP		RSAATGLPIS		MKIFMYLLTV		FLITQMIGSA		LFAVYLHRRL
DKIEDERNLH		EDFVFMKTIQ		RCNTGERSLS		LLNCEEIKSQ		FEGFVKDIML
NKEETKKENS		FEMQKGDQNP		QIAAHVISEA		SSKTTSVLQW		AEKGYYTMSN
NLVTLENGKQ		LTVKRQGLYY		IYAQVTFCSN		REASSQAPFI		ASLCLKSPGR
FERILLRAAN		THSSAKPCGQ		QSIHLGGVFE		LQPGASVFVN		VTDPSQVSHG
TGFTSFGLLK		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

CD40LG
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ALY, 1I9R, 3LKJ, 3QD6
Ідентифікатори
Символи	CD40LG, CD154, CD40L, HIGM1, IGM, IMD3, T-BAM, TNFSF5, TRAP, gp39, hCD40L, CD40 ligand
Зовнішні ІД	OMIM: 300386 MGI: 88337 HomoloGene: 56 GeneCards: CD40LG
Пов'язані генетичні захворювання
CD40 ligand deficiency[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • cytokine activity • CD40 receptor binding • tumor necrosis factor receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • external side of plasma membrane • внутрішньоклітинний • cell surface • міжклітинний простір Біологічний процес • leukocyte cell-cell adhesion • positive regulation of interleukin-12 production • negative regulation of apoptotic process • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • platelet activation • positive regulation of endothelial cell apoptotic process • B cell proliferation • Перемикання класу імуноглобулінів • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • regulation of immune response • B cell differentiation • inflammatory response • T cell costimulation • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of interleukin-4 production • positive regulation of interleukin-10 production • positive regulation of T cell proliferation • regulation of signaling receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	959	21947
Ensembl	ENSG00000102245	ENSMUSG00000031132
UniProt	P29965	P27548
RefSeq (мРНК)	NM_000074	NM_011616
RefSeq (білок)	NP_000065	NP_035746
Локус (UCSC)	Хр. X: 136.65 – 136.66 Mb	Хр. X: 56.26 – 56.27 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Graf D., Korthaeuer U., Mages H.W., Senger G., Kroczek R.A. (1992). Cloning of TRAP, a ligand for CD40 on human T cells. Eur. J. Immunol. 22: 3191—3194. PMID 1280226 doi:10.1002/eji.1830221226
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Disanto J.P., Bonnefoy J.-Y., Gauchat J.-F., Fischer A., de Saint Basile G. (1993). CD40 ligand mutations in X-linked immunodeficiency with hyper-IgM. Nature. 361: 541—543. PMID 8094231 doi:10.1038/361541a0
• Blotta M.H., Marshall J.D., DeKruyff R.H., Umetsu D.T. (1996). Cross-linking of the CD40 ligand on human CD4+ T lymphocytes generates a costimulatory signal that up-regulates IL-4 synthesis. J. Immunol. 156: 3133—3140. PMID 8617933