EXOSC2

EXOSC2 (англ. Exosome component 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 32 789^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAMEMRLPVA		RKPLSERLGR		DTKKHLVVPG		DTITTDTGFM		RGHGTYMGEE
KLIASVAGSV		ERVNKLICVK		ALKTRYIGEV		GDIVVGRITE		VQQKRWKVET
NSRLDSVLLL		SSMNLPGGEL		RRRSAEDELA		MRGFLQEGDL		ISAEVQAVFS
DGAVSLHTRS		LKYGKLGQGV		LVQVSPSLVK		RQKTHFHDLP		CGASVILGNN
GFIWIYPTPE		HKEEEAGGFI		ANLEPVSLAD		REVISRLRNC		IISLVTQRMM
LYDTSILYCY		EASLPHQIKD		ILKPEIMEEI		VMETRQRLLE		QEG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

EXOSC2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NN6
Ідентифікатори
Символи	EXOSC2, RRP4, Rrp4p, hRrp4p, p7, Exosome component 2, SHRF
Зовнішні ІД	OMIM: 602238 MGI: 2385133 HomoloGene: 6095 GeneCards: EXOSC2
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • 3'-5'-exoribonuclease activity • exoribonuclease activity • 7S RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • Екзосома • nuclear exosome (RNase complex) • cytoplasmic exosome (RNase complex) • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце Біологічний процес • nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process • nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process • regulation of mRNA stability • exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5' • CUT catabolic process • positive regulation of cell growth • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • rRNA processing • U4 snRNA 3'-end processing • polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23404	227715
Ensembl	ENSG00000130713	ENSMUSG00000039356
UniProt	Q13868	Q8VBV3
RefSeq (мРНК)	NM_001282708 NM_001282709 NM_014285	NM_144886
RefSeq (білок)	NP_001269637 NP_001269638 NP_055100	NP_659135
Локус (UCSC)	Хр. 9: 130.69 – 130.71 Mb	Хр. 2: 31.56 – 31.57 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.

Література

• Mitchell P., Petfalski E., Shevchenko A., Mann M., Tollervey D. (1997). The exosome: a conserved eukaryotic RNA processing complex containing multiple 3'-->5' exoribonucleases. Cell. 91: 457—466. PMID 9390555 doi:10.1016/S0092-8674(00)80432-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Mitchell P., Petfalski E., Tollervey D. (1996). The 3' end of yeast 5.8S rRNA is generated by an exonuclease processing mechanism. Genes Dev. 10: 502—513. PMID 8600032 doi:10.1101/gad.10.4.502
• Lykke-Andersen J., Wagner E. (2005). Recruitment and activation of mRNA decay enzymes by two ARE-mediated decay activation domains in the proteins TTP and BRF-1. Genes Dev. 19: 351—361. PMID 15687258 doi:10.1101/gad.1282305
• van Dijk E.L., Schilders G., Pruijn G.J. (2007). Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome, which is involved in various mRNA decay pathways. RNA. 13: 1027—1035. PMID 17545563 doi:10.1261/rna.575107
• Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome. Cell. 127: 1223—1237. PMID 17174896 doi:10.1016/j.cell.2006.10.037