GPATCH8

GPATCH8 (англ. G-patch domain containing 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 502 амінокислот, а молекулярна маса — 164 197^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADRFSRFNE		DRDFQGNHFD		QYEEGHLEIE		QASLDKPIES		DNIGHRLLQK
HGWKLGQGLG		KSLQGRTDPI		PIVVKYDVMG		MGRMEMELDY		AEDATERRRV
LEVEKEDTEE		LRQKYKDYVD		KEKAIAKALE		DLRANFYCEL		CDKQYQKHQE
FDNHINSYDH		AHKQRLKDLK		QREFARNVSS		RSRKDEKKQE		KALRRLHELA
EQRKQAECAP		GSGPMFKPTT		VAVDEEGGED		DKDESATNSG		TGATASCGLG
SEFSTDKGGP		FTAVQITNTT		GLAQAPGLAS		QGISFGIKNN		LGTPLQKLGV
SFSFAKKAPV		KLESIASVFK		DHAEEGTSED		GTKPDEKSSD		QGLQKVGDSD
GSSNLDGKKE		DEDPQDGGSL		ASTLSKLKRM		KREEGAGATE		PEYYHYIPPA
HCKVKPNFPF		LLFMRASEQM		DGDNTTHPKN		APESKKGSSP		KPKSCIKAAA
SQGAEKTVSE		VSEQPKETSM		TEPSEPGSKA		EAKKALGGDV		SDQSLESHSQ
KVSETQMCES		NSSKETSLAT		PAGKESQEGP		KHPTGPFFPV		LSKDESTALQ
WPSELLIFTK		AEPSISYSCN		PLYFDFKLSR		NKDARTKGTE		KPKDIGSSSK
DHLQGLDPGE		PNKSKEVGGE		KIVRSSGGRM		DAPASGSACS		GLNKQEPGGS
HGSETEDTGR		SLPSKKERSG		KSHRHKKKKK		HKKSSKHKRK		HKADTEEKSS
KAESGEKSKK		RKKRKRKKNK		SSAPADSERG		PKPEPPGSGS		PAPPRRRRRA
QDDSQRRSLP		AEEGSSGKKD		EGGGGSSSQD		HGGRKHKGEL		PPSSCQRRAG
TKRSSRSSHR		SQPSSGDEDS		DDASSHRLHQ		KSPSQYSEEE		EEEDSGSEHS
RSRSRSGRRH		SSHRSSRRSY		SSSSDASSDQ		SCYSRQRSYS		DDSYSDYSDR
SRRHSKRSHD		SDDSDYASSK		HRSKRHKYSS		SDDDYSLSCS		QSRSRSRSHT
RERSRSRGRS		RSSSCSRSRS		KRRSRSTTAH		SWQRSRSYSR		DRSRSTRSPS
QRSGSRKRSW		GHESPEERHS		GRRDFIRSKI		YRSQSPHYFR		SGRGEGPGKK
DDGRGDDSKA		TGPPSQNSNI		GTGRGSEGDC		SPEDKNSVTA		KLLLEKIQSR
KVERKPSVSE		EVQATPNKAG		PKLKDPPQGY		FGPKLPPSLG		NKPVLPLIGK
LPATRKPNKK		CEESGLERGE		EQEQSETEEG		PPGSSDALFG		HQFPSEETTG
PLLDPPPEES		KSGEATADHP		VAPLGTPAHS		DCYPGDPTIS		HNYLPDPSDG
DTLESLDSSS		QPGPVESSLL		PIAPDLEHFP		SYAPPSGDPS		IESTDGAEDA
SLAPLESQPI		TFTPEEMEKY		SKLQQAAQQH		IQQQLLAKQV		KAFPASAALA
PATPALQPIH		IQQPATASAT		SITTVQHAIL		QHHAAAAAAA		IGIHPHPHPQ
PLAQVHHIPQ		PHLTPISLSH		LTHSIIPGHP		ATFLASHPIH		IIPASAIHPG
PFTFHPVPHA		ALYPTLLAPR		PAAAAATALH		LHPLLHPIFS		GQDLQHPPSH
GT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

GPATCH8
Ідентифікатори
Символи	GPATCH8, GPATC8, KIAA0553, G-patch domain containing 8
Зовнішні ІД	OMIM: 614396 MGI: 1918667 HomoloGene: 46117 GeneCards: GPATCH8
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • компонент клітини Біологічний процес • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23131	237943
Ensembl	ENSG00000186566	ENSMUSG00000034621
UniProt	Q9UKJ3	A2A6A1
RefSeq (мРНК)	NM_001002909 NM_001304939 NM_001304940 NM_001304941 NM_001304942 NM_001304943	NM_001159492
RefSeq (білок)	NP_001002909 NP_001291868 NP_001291869 NP_001291870 NP_001291871 NP_001291872	NP_001152964
Локус (UCSC)	Хр. 17: 44.4 – 44.5 Mb	Хр. 11: 102.48 – 102.56 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504