HIF1A

HIF1A (англ. Hypoxia inducible factor 1 alpha subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 826 амінокислот, а молекулярна маса — 92 670^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGAGGANDK		KKISSERRKE		KSRDAARSRR		SKESEVFYEL		AHQLPLPHNV
SSHLDKASVM		RLTISYLRVR		KLLDAGDLDI		EDDMKAQMNC		FYLKALDGFV
MVLTDDGDMI		YISDNVNKYM		GLTQFELTGH		SVFDFTHPCD		HEEMREMLTH
RNGLVKKGKE		QNTQRSFFLR		MKCTLTSRGR		TMNIKSATWK		VLHCTGHIHV
YDTNSNQPQC		GYKKPPMTCL		VLICEPIPHP		SNIEIPLDSK		TFLSRHSLDM
KFSYCDERIT		ELMGYEPEEL		LGRSIYEYYH		ALDSDHLTKT		HHDMFTKGQV
TTGQYRMLAK		RGGYVWVETQ		ATVIYNTKNS		QPQCIVCVNY		VVSGIIQHDL
IFSLQQTECV		LKPVESSDMK		MTQLFTKVES		EDTSSLFDKL		KKEPDALTLL
APAAGDTIIS		LDFGSNDTET		DDQQLEEVPL		YNDVMLPSPN		EKLQNINLAM
SPLPTAETPK		PLRSSADPAL		NQEVALKLEP		NPESLELSFT		MPQIQDQTPS
PSDGSTRQSS		PEPNSPSEYC		FYVDSDMVNE		FKLELVEKLF		AEDTEAKNPF
STQDTDLDLE		MLAPYIPMDD		DFQLRSFDQL		SPLESSSASP		ESASPQSTVT
VFQQTQIQEP		TANATTTTAT		TDELKTVTKD		RMEDIKILIA		SPSPTHIHKE
TTSATSSPYR		DTQSRTASPN		RAGKGVIEQT		EKSHPRSPNV		LSVALSQRTT
VPEEELNPKI		LALQNAQRKR		KMEHDGSLFQ		AVGIGTLLQQ		PDDHAATTSL
SWKRVKGCKS		SEQNGMEQKT		IILIPSDLAC		RLLGQSMDES		GLPQLTSYDC
EVNAPIQGSR		NLLQGEELLR		ALDQVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

HIF1A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1H2K, 1H2L, 1H2M, 1L3E, 1L8C, 1LM8, 1LQB, 2ILM, 3HQR, 3HQU, 4AJY, 4H6J
Ідентифікатори
Символи	HIF1A, HIF-1-alpha, HIF-1A, HIF-1alpha, HIF1, HIF1-ALPHA, MOP1, PASD8, bHLHe78, hypoxia inducible factor 1 alpha subunit, hypoxia inducible factor 1 subunit alpha, HIF-1α
Зовнішні ІД	OMIM: 603348 MGI: 106918 HomoloGene: 1171 GeneCards: HIF1A
Онтологія гена Молекулярна функція • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding • transcription factor binding • enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • protein kinase binding • Hsp90 protein binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • ubiquitin protein ligase binding • protein heterodimerization activity • E-box binding • p53 binding • protein domain specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • nuclear speck • motile cilium • transcription regulator complex • RNA polymerase II transcription regulator complex • axon cytoplasm • нуклеоплазма • ядерні тільця • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • B-1 B cell homeostasis • regulation of transforming growth factor beta2 production • muscle cell cellular homeostasis • outflow tract morphogenesis • negative regulation of ossification • heart looping • negative regulation of TOR signaling • blood vessel development • hemoglobin biosynthetic process • Ангіогенез • positive regulation of chemokine-mediated signaling pathway • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • positive regulation of hormone biosynthetic process • negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process • regulation of aerobic respiration • positive regulation of neuroblast proliferation • dopaminergic neuron differentiation • lactate metabolic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • blood vessel morphogenesis • positive regulation of erythrocyte differentiation • glucose homeostasis • vascular endothelial growth factor production • regulation of thymocyte apoptotic process • positive regulation of epithelial cell migration • negative regulation of thymocyte apoptotic process • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • axonal transport of mitochondrion • positive regulation of macroautophagy • cartilage development • positive regulation of nitric-oxide synthase activity • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • лактація • negative regulation of oxidative stress-induced neuron intrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • digestive tract morphogenesis • диференціація клітин • neural fold elevation formation • positive regulation of autophagy • retina vasculature development in camera-type eye • collagen metabolic process • embryonic placenta development • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of angiogenesis • regulation of glycolytic process • Епітеліально-мезенхімальний перехід • cerebral cortex development • регуляція експресії генів • positive regulation of chemokine production • intestinal epithelial cell maturation • GO:0048552 regulation of catalytic activity • positive regulation of autophagy of mitochondrion • cardiac ventricle morphogenesis • response to muscle activity • epithelial cell differentiation involved in mammary gland alveolus development • Візуальне навчання • positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of bone mineralization • negative regulation of growth • response to hypoxia • positive regulation of endothelial cell proliferation • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress • iris morphogenesis • mRNA transcription by RNA polymerase II • hypoxia-inducible factor-1alpha signaling pathway • vasculature development • regulation of cell population proliferation • neural crest cell migration • embryonic hemopoiesis • connective tissue replacement involved in inflammatory response wound healing • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process • positive regulation of vascular endothelial growth factor production • elastin metabolic process • positive regulation of glycolytic process • oxygen homeostasis • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular iron ion homeostasis • camera-type eye morphogenesis • cellular response to hypoxia • cellular response to interleukin-1 • transcription by RNA polymerase II • protein deubiquitination • посттрансляційна модифікація • response to iron ion • negative regulation of gene expression • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration • GO:1901313 positive regulation of gene expression • cytokine-mediated signaling pathway • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3091	15251
Ensembl	ENSG00000100644	ENSMUSG00000021109
UniProt	Q16665	Q61221
RefSeq (мРНК)	NM_181054 NM_001243084 NM_001530	NM_010431 NM_001313919 NM_001313920
RefSeq (білок)	NP_001230013 NP_001521 NP_851397 NP_001521.1	NP_001300848 NP_001300849 NP_034561
Локус (UCSC)	Хр. 14: 61.7 – 61.75 Mb	Хр. 12: 73.95 – 73.99 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Є основним фактором, індукованим гіпоксією.

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Wang G.L., Jiang B.-H., Rue E.A., Semenza G.L. (1995). Hypoxia-inducible factor 1 is a basic-helix-loop-helix-PAS heterodimer regulated by cellular O2 tension. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 5510—5514. PMID 7539918 doi:10.1073/pnas.92.12.5510
• Iyer N.V., Leung S.W., Semenza G.L. (1998). The human hypoxia-inducible factor 1alpha gene: HIF1A structure and evolutionary conservation. Genomics. 52: 159—165. PMID 9782081 doi:10.1006/geno.1998.5416
• Lukashev D., Sitkovsky M. (2008). Preferential expression of the novel alternative isoform I.3 of hypoxia-inducible factor 1alpha in activated human T lymphocytes. Hum. Immunol. 69: 421—425. PMID 18638657 doi:10.1016/j.humimm.2008.05.004
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Jiang B.H., Zheng J.Z., Leung S.W., Roe R., Semenza G.L. (1997). Transactivation and inhibitory domains of hypoxia-inducible factor 1alpha. Modulation of transcriptional activity by oxygen tension. J. Biol. Chem. 272: 19253—19260. PMID 9235919 doi:10.1074/jbc.272.31.19253
• Huang L.E., Gu J., Schau M., Bunn H.F. (1998). Regulation of hypoxia-inducible factor 1alpha is mediated by an O2-dependent degradation domain via the ubiquitin-proteasome pathway. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 7987—7992. PMID 9653127 doi:10.1073/pnas.95.14.7987