ITGAV

ITGAV (англ. Integrin subunit alpha V) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 048 амінокислот, а молекулярна маса — 116 038^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAFPPRRRLR		LGPRGLPLLL		SGLLLPLCRA		FNLDVDSPAE		YSGPEGSYFG
FAVDFFVPSA		SSRMFLLVGA		PKANTTQPGI		VEGGQVLKCD		WSSTRRCQPI
EFDATGNRDY		AKDDPLEFKS		HQWFGASVRS		KQDKILACAP		LYHWRTEMKQ
EREPVGTCFL		QDGTKTVEYA		PCRSQDIDAD		GQGFCQGGFS		IDFTKADRVL
LGGPGSFYWQ		GQLISDQVAE		IVSKYDPNVY		SIKYNNQLAT		RTAQAIFDDS
YLGYSVAVGD		FNGDGIDDFV		SGVPRAARTL		GMVYIYDGKN		MSSLYNFTGE
QMAAYFGFSV		AATDINGDDY		ADVFIGAPLF		MDRGSDGKLQ		EVGQVSVSLQ
RASGDFQTTK		LNGFEVFARF		GSAIAPLGDL		DQDGFNDIAI		AAPYGGEDKK
GIVYIFNGRS		TGLNAVPSQI		LEGQWAARSM		PPSFGYSMKG		ATDIDKNGYP
DLIVGAFGVD		RAILYRARPV		ITVNAGLEVY		PSILNQDNKT		CSLPGTALKV
SCFNVRFCLK		ADGKGVLPRK		LNFQVELLLD		KLKQKGAIRR		ALFLYSRSPS
HSKNMTISRG		GLMQCEELIA		YLRDESEFRD		KLTPITIFME		YRLDYRTAAD
TTGLQPILNQ		FTPANISRQA		HILLDCGEDN		VCKPKLEVSV		DSDQKKIYIG
DDNPLTLIVK		AQNQGEGAYE		AELIVSIPLQ		ADFIGVVRNN		EALARLSCAF
KTENQTRQVV		CDLGNPMKAG		TQLLAGLRFS		VHQQSEMDTS		VKFDLQIQSS
NLFDKVSPVV		SHKVDLAVLA		AVEIRGVSSP		DHVFLPIPNW		EHKENPETEE
DVGPVVQHIY		ELRNNGPSSF		SKAMLHLQWP		YKYNNNTLLY		ILHYDIDGPM
NCTSDMEINP		LRIKISSLQT		TEKNDTVAGQ		GERDHLITKR		DLALSEGDIH
TLGCGVAQCL		KIVCQVGRLD		RGKSAILYVK		SLLWTETFMN		KENQNHSYSL
KSSASFNVIE		FPYKNLPIED		ITNSTLVTTN		VTWGIQPAPM		PVPVWVIILA
VLAGLLLLAV		LVFVMYRMGF		FKRVRPPQEE		QEREQLQPHE		NGEGNSET

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

ITGAV
Наявні структури PDB Пошук ортологів: H0WK80%20or%20H7BZG1 PDBe H0WK80,H7BZG1 RCSB Список кодів PDB 1JV2, 1L5G, 1M1X, 1U8C, 3IJE, 4G1E, 4G1M, 4MMX, 4MMY, 4MMZ, 4O02, 4UM8, 4UM9
Ідентифікатори
Символи	ITGAV, CD51, MSK8, VNRA, VTNR, integrin subunit alpha V
Зовнішні ІД	OMIM: 193210 MGI: 96608 HomoloGene: 20510 GeneCards: ITGAV
Реагує на сполуку
cilengitide[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • transforming growth factor beta binding • зв’язування з іоном металу • voltage-gated calcium channel activity • virus receptor activity • protein kinase C binding • protease binding • extracellular matrix protein binding • extracellular matrix binding • fibronectin binding • opsonin binding • insulin-like growth factor I binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • fibroblast growth factor binding • neuregulin binding • coreceptor activity • C-X3-C chemokine binding • signaling receptor binding • пептидний зв'язок • integrin binding Клітинна компонента • lamellipodium membrane • integrin alphav-beta3 complex • екзосома • alphav-beta3 integrin-IGF-1-IGF1R complex • integral component of membrane • integrin alphav-beta5 complex • мембрана • integrin alphav-beta8 complex • ruffle membrane • integrin complex • microvillus membrane • filopodium membrane • external side of plasma membrane • phagocytic vesicle • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • cell surface • гіалоплазма • focal adhesion • міжклітинні контакти • specific granule membrane • integrin alphav-beta6 complex • alphav-beta3 integrin-PKCalpha complex • alphav-beta3 integrin-HMGB1 complex Біологічний процес • regulation of phagocytosis • apoptotic cell clearance • endodermal cell differentiation • apolipoprotein A-I-mediated signaling pathway • negative chemotaxis • negative regulation of lipid storage • extracellular matrix organization • heterotypic cell-cell adhesion • positive regulation of cell migration • regulation of apoptotic cell clearance • substrate adhesion-dependent cell spreading • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • cell-matrix adhesion • GO:0022415 viral process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • blood vessel development • negative regulation of entry of bacterium into host cell • integrin-mediated signaling pathway • calcium ion transmembrane transport • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • leukocyte migration • cell-substrate adhesion • negative regulation of lipoprotein metabolic process • negative regulation of lipid transport • extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • positive regulation of cell adhesion • ERK1 and ERK2 cascade • cell growth • positive regulation of osteoblast proliferation • адгезія клітин • Ангіогенез • васкулогенез • cellular calcium ion homeostasis • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • positive regulation of cell population proliferation • cell migration • neutrophil degranulation • positive regulation of MAPK cascade • cell adhesion mediated by integrin • viral entry into host cell • regulation of transforming growth factor beta activation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3685	16410
Ensembl	ENSG00000138448	ENSMUSG00000027087
UniProt	P06756	P43406
RefSeq (мРНК)	NM_001144999 NM_001145000 NM_002210	NM_008402 NM_001398691
RefSeq (білок)	NP_001138471 NP_001138472 NP_002201	NP_032428 NP_001385620
Локус (UCSC)	Хр. 2: 186.59 – 186.68 Mb	Хр. 2: 83.55 – 83.64 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Donahue J.P., Sugg N., Hawiger J. (1994). The integrin alpha v gene: identification and characterization of the promoter region. Biochim. Biophys. Acta. 1219: 228—232. PMID 7522056 doi:10.1016/0167-4781(94)90278-X
• Cheresh D.A., Smith J.W., Cooper H.M., Quaranta V. (1989). A novel vitronectin receptor integrin (alpha v beta x) is responsible for distinct adhesive properties of carcinoma cells. Cell. 57: 59—69. PMID 2467745 doi:10.1016/0092-8674(89)90172-4
• Joki-Korpela P., Marjomaki V., Krogerus C., Heino J., Hyypia T. (2001). Entry of human parechovirus 1. J. Virol. 75: 1958—1967. PMID 11160695 doi:10.1128/JVI.75.4.1958-1967.2001
• Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 doi:10.1038/nbt827
• Vallon M., Essler M. (2006). Proteolytically processed soluble tumor endothelial marker (TEM) 5 mediates endothelial cell survival during angiogenesis by linking integrin alpha(v)beta3 to glycosaminoglycans. J. Biol. Chem. 281: 34179—34188. PMID 16982628 doi:10.1074/jbc.M605291200