MYOD1

MYOD1 (англ. Myogenic differentiation 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 320 амінокислот, а молекулярна маса — 34 501^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MELLSPPLRD		VDLTAPDGSL		CSFATTDDFY		DDPCFDSPDL		RFFEDLDPRL
MHVGALLKPE		EHSHFPAAVH		PAPGAREDEH		VRAPSGHHQA		GRCLLWACKA
CKRKTTNADR		RKAATMRERR		RLSKVNEAFE		TLKRCTSSNP		NQRLPKVEIL
RNAIRYIEGL		QALLRDQDAA		PPGAAAAFYA		PGPLPPGRGG		EHYSGDSDAS
SPRSNCSDGM		MDYSGPPSGA		RRRNCYEGAY		YNEAPSEPRP		GKSAAVSSLD
CLSSIVERIS		TESPAAPALL		LADVPSESPP		RRQEAAAPSE		GESSGDPTQS
PDAAPQCPAG		ANPNPIYQVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

MYOD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1MDY
Ідентифікатори
Символи	MYOD1, MYF3, MYOD, PUM, bHLHc1, myogenic differentiation 1, MYODRIF
Зовнішні ІД	OMIM: 159970 MGI: 97275 HomoloGene: 7857 GeneCards: MYOD1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • enzyme binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • chromatin DNA binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • promoter-specific chromatin binding Клітинна компонента • transcription regulator complex • нуклеоплазма • міофібрила • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • диференціація клітин • myotube differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to starvation • muscle cell fate commitment • cellular response to estradiol stimulus • skeletal muscle fiber adaptation • muscle organ development • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • myotube cell development • positive regulation of skeletal muscle fiber development • negative regulation of myoblast proliferation • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • protein phosphorylation • regulation of RNA splicing • positive regulation of myoblast fusion • myoblast fate determination • cellular response to glucocorticoid stimulus • positive regulation of myoblast differentiation • skeletal muscle fiber development • histone H3 acetylation • myotube differentiation involved in skeletal muscle regeneration • histone H4 acetylation • skeletal muscle cell differentiation • positive regulation of skeletal muscle tissue regeneration • регуляція експресії генів • striated muscle cell differentiation • cellular response to oxygen levels • myoblast fusion • myoblast differentiation • skeletal muscle tissue development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of muscle cell differentiation • cellular response to tumor necrosis factor • positive regulation of snRNA transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4654	17927
Ensembl	ENSG00000129152	ENSMUSG00000009471
UniProt	P15172	P10085
RefSeq (мРНК)	NM_002478	NM_010866
RefSeq (білок)	NP_002469	NP_034996
Локус (UCSC)	Хр. 11: 17.72 – 17.72 Mb	Хр. 7: 46.03 – 46.03 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, міогенез, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі. Втрата контролю над цим перемикачем може стати причиною утворення рабдоміосаркоми^[5][6].

Література

• Pearson-White S.H. (1991). Human MyoD: cDNA and deduced amino acid sequence. Nucleic Acids Res. 19: 1148—1148. PMID 1850513 doi:10.1093/nar/19.5.1148
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Breitschopf K., Bengal E., Ziv T., Admon A., Ciechanover A. (1998). A novel site for ubiquitination: the N-terminal residue, and not internal lysines of MyoD, is essential for conjugation and degradation of the protein. EMBO J. 17: 5964—5973. PMID 9774340 doi:10.1093/emboj/17.20.5964
• McKinsey T.A., Zhang C.L., Olson E.N. (2001). Control of muscle development by dueling HATs and HDACs. Curr. Opin. Genet. Dev. 11: 497—504. PMID 11532390 doi:10.1016/S0959-437X(00)00224-0
• Mal A.K. (2006). Histone methyltransferase Suv39h1 represses MyoD-stimulated myogenic differentiation. EMBO J. 25: 3323—3334. PMID 16858404 doi:10.1038/sj.emboj.7601229
• Chen B., Dias P., Jenkins J.J. III, Savell V.H., Parham D.M. (1998). Methylation alterations of the MyoD1 upstream region are predictive of subclassification of human rhabdomyosarcomas. Am. J. Pathol. 152: 1071—1079. PMID 9546368