POLR2J

POLR2J (англ. RNA polymerase II subunit J) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 117 амінокислот, а молекулярна маса — 13 293^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNAPPAFESF		LLFEGEKKIT		INKDTKVPNA		CLFTINKEDH		TLGNIIKSQL
LKDPQVLFAG		YKVPHPLEHK		IIIRVQTTPD		YSPQEAFTNA		ITDLISELSL
LEERFRVAIK		DKQEGIE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

POLR2J
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5FLM, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	POLR2J, POLR2J1, RPB11, RPB11A, RPB11m, hRPB14, polymerase (RNA) II subunit J, RNA polymerase II subunit J
Зовнішні ІД	OMIM: 604150 MGI: 109582 HomoloGene: 4542 GeneCards: POLR2J
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • LRR domain binding • protein dimerization activity • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • РНК-полімераза II Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription-coupled nucleotide-excision repair • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • snRNA transcription by RNA polymerase II • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • RNA metabolic process • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • somatic stem cell population maintenance • positive regulation of viral transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5439	20022
Ensembl	ENSG00000005075	ENSMUSG00000039771
UniProt	P52435	O08740
RefSeq (мРНК)	NM_006234 NM_001371100 NM_001393919	NM_011293
RefSeq (білок)	NP_006225 NP_001358029	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 7: 102.47 – 102.48 Mb	Хр. 5: 136.15 – 136.15 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 doi:10.1074/jbc.273.51.34444