POU5F1

POU5F1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1OCP, 3L1P
Ідентифікатори
Символи	POU5F1, OCT3, OCT4, OTF-3, OTF3, OTF4, Oct-3, Oct-4, POU class 5 homeobox 1, Oct3/4
Зовнішні ІД	OMIM: 164177 MGI: 101893 HomoloGene: 8422 GeneCards: POU5F1
Пов'язані генетичні захворювання
	синдром Стівенса — Джонсона
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • miRNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • transcription factor binding; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • ubiquitin protein ligase binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • transcription regulator complex; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • мітохондрія;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • somatic stem cell population maintenance; • GO:1905617 negative regulation of gene silencing by miRNA; • cell fate commitment involved in formation of primary germ layer; • endodermal cell fate specification; • anatomical structure morphogenesis; • mRNA transcription by RNA polymerase II; • regulation of asymmetric cell division; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly; • multicellular organism development; • cardiac cell fate determination; • response to wounding; • BMP signaling pathway involved in heart induction; • регуляція експресії генів; • regulation of heart induction by regulation of canonical Wnt signaling pathway; • blastocyst development; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of SMAD protein signal transduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5460
	18999
ENSG00000230336; ENSG00000206454; ENSG00000204531; ENSG00000237582; ENSG00000229094;
	ENSG00000233911; ENSG00000235068
	ENSMUSG00000024406
	Q01860
	P20263
	NM_203289; NM_001173531; NM_001285986; NM_001285987; NM_002701
	NM_001252452; NM_013633
NP_001167002; NP_001272915; NP_001272916; NP_002692; NP_976034;
	NP_001272915.1
	NP_001239381; NP_038661
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POU5F1 (англ. POU class 5 homeobox 1), більш відомий як Oct-4 (octamer-binding transcription factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 амінокислот, а молекулярна маса — 38 571^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGHLASDFA	FSPPPGGGGD	GPGGPEPGWV	DPRTWLSFQG	PPGGPGIGPG
VGPGSEVWGI	PPCPPPYEFC	GGMAYCGPQV	GVGLVPQGGL	ETSQPEGEAG
VGVESNSDGA	SPEPCTVTPG	AVKLEKEKLE	QNPEESQDIK	ALQKELEQFA
KLLKQKRITL	GYTQADVGLT	LGVLFGKVFS	QTTICRFEAL	QLSFKNMCKL
RPLLQKWVEE	ADNNENLQEI	CKAETLVQAR	KRKRTSIENR	VRGNLENLFL
QCPKPTLQQI	SHIAQQLGLE	KDVVRVWFCN	RRQKGKRSSS	DYAQREDFEA
AGSPFSGGPV	SFPLAPGPHF	GTPGYGSPHF	TALYSSVPFP	EGEAFPPVSV
TTLGSPMHSN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Коротка інформація Наявні структури, PDB ...

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

[4]

[5]

[1]

[2]

[3]

POU5F1

Література

Примітки

Див. також

Wikiwand - on