SOX4

SOX4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3U2B
Ідентифікатори
Символи	SOX4, EVI16, SRY-box 4, SRY-box transcription factor 4, CSS10
Зовнішні ІД	OMIM: 184430 MGI: 98366 HomoloGene: 2338 GeneCards: SOX4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • нуклеоплазма; • мітохондрія; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• skeletal system development; • noradrenergic neuron differentiation; • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest; • cardiac ventricle formation; • glial cell development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • limb bud formation; • regulation of protein stability; • sympathetic nervous system development; • somatic stem cell population maintenance; • glucose homeostasis; • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; • ventricular septum morphogenesis; • protein stabilization; • ascending aorta morphogenesis; • negative regulation of cell death; • mitral valve morphogenesis; • positive regulation of translation; • transcription, DNA-templated; • neuroepithelial cell differentiation; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of Wnt signaling pathway; • negative regulation of protein ubiquitination; • heart development; • pro-B cell differentiation; • atrial septum primum morphogenesis; • T cell differentiation; • kidney morphogenesis; • positive regulation of cell population proliferation; • spinal cord development; • positive regulation of apoptotic process; • glial cell proliferation; • canonical Wnt signaling pathway; • positive regulation of N-terminal peptidyl-lysine acetylation; • spinal cord motor neuron differentiation; • cardiac right ventricle morphogenesis; • neural tube formation; • cellular response to glucose stimulus; • endocrine pancreas development; • negative regulation of cell population proliferation; • positive regulation of insulin secretion; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • диференціація клітин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	6659
	20677
	ENSG00000124766
	ENSMUSG00000076431
	Q06945
	Q06831
	NM_003107
	NM_009238
	NP_003098
	NP_033264
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SOX4 (англ. SRY-box 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 474 амінокислот, а молекулярна маса — 47 263^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVQQTNNAEN	TEALLAGESS	DSGAGLELGI	ASSPTPGSTA	STGGKADDPS
WCKTPSGHIK	RPMNAFMVWS	QIERRKIMEQ	SPDMHNAEIS	KRLGKRWKLL
KDSDKIPFIR	EAERLRLKHM	ADYPDYKYRP	RKKVKSGNAN	SSSSAAASSK
PGEKGDKVGG	SGGGGHGGGG	GGGSSNAGGG	GGGASGGGAN	SKPAQKKSCG
SKVAGGAGGG	VSKPHAKLIL	AGGGGGGKAA	AAAAASFAAE	QAGAAALLPL
GAAADHHSLY	KARTPSASAS	ASSAASASAA	LAAPGKHLAE	KKVKRVYLFG
GLGTSSSPVG	GVGAGADPSD	PLGLYEEEGA	GCSPDAPSLS	GRSSAASSPA
AGRSPADHRG	YASLRAASPA	PSSAPSHASS	SASSHSSSSS	SSGSSSSDDE
FEDDLLDLNP	SSNFESMSLG	SFSSSSALDR	DLDFNFEPGS	GSHFEFPDYC
TPEVSEMISG	DWLESSISNL	VFTY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Коротка інформація Наявні структури, PDB ...

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

[3]

[4]

[1]

[2]

SOX4

Література

Примітки

Див. також

Wikiwand - on