TOP2B

TOP2B (англ. Topoisomerase (DNA) II beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 626 амінокислот, а молекулярна маса — 183 267^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKSGGCGAG		AGVGGGNGAL		TWVTLFDQNN		AAKKEESETA		NKNDSSKKLS
VERVYQKKTQ		LEHILLRPDT		YIGSVEPLTQ		FMWVYDEDVG		MNCREVTFVP
GLYKIFDEIL		VNAADNKQRD		KNMTCIKVSI		DPESNIISIW		NNGKGIPVVE
HKVEKVYVPA		LIFGQLLTSS		NYDDDEKKVT		GGRNGYGAKL		CNIFSTKFTV
ETACKEYKHS		FKQTWMNNMM		KTSEAKIKHF		DGEDYTCITF		QPDLSKFKME
KLDKDIVALM		TRRAYDLAGS		CRGVKVMFNG		KKLPVNGFRS		YVDLYVKDKL
DETGVALKVI		HELANERWDV		CLTLSEKGFQ		QISFVNSIAT		TKGGRHVDYV
VDQVVGKLIE		VVKKKNKAGV		SVKPFQVKNH		IWVFINCLIE		NPTFDSQTKE
NMTLQPKSFG		SKCQLSEKFF		KAASNCGIVE		SILNWVKFKA		QTQLNKKCSS
VKYSKIKGIP		KLDDANDAGG		KHSLECTLIL		TEGDSAKSLA		VSGLGVIGRD
RYGVFPLRGK		ILNVREASHK		QIMENAEINN		IIKIVGLQYK		KSYDDAESLK
TLRYGKIMIM		TDQDQDGSHI		KGLLINFIHH		NWPSLLKHGF		LEEFITPIVK
ASKNKQELSF		YSIPEFDEWK		KHIENQKAWK		IKYYKGLGTS		TAKEAKEYFA
DMERHRILFR		YAGPEDDAAI		TLAFSKKKID		DRKEWLTNFM		EDRRQRRLHG
LPEQFLYGTA		TKHLTYNDFI		NKELILFSNS		DNERSIPSLV		DGFKPGQRKV
LFTCFKRNDK		REVKVAQLAG		SVAEMSAYHH		GEQALMMTIV		NLAQNFVGSN
NINLLQPIGQ		FGTRLHGGKD		AASPRYIFTM		LSTLARLLFP		AVDDNLLKFL
YDDNQRVEPE		WYIPIIPMVL		INGAEGIGTG		WACKLPNYDA		REIVNNVRRM
LDGLDPHPML		PNYKNFKGTI		QELGQNQYAV		SGEIFVVDRN		TVEITELPVR
TWTQVYKEQV		LEPMLNGTDK		TPALISDYKE		YHTDTTVKFV		VKMTEEKLAQ
AEAAGLHKVF		KLQTTLTCNS		MVLFDHMGCL		KKYETVQDIL		KEFFDLRLSY
YGLRKEWLVG		MLGAESTKLN		NQARFILEKI		QGKITIENRS		KKDLIQMLVQ
RGYESDPVKA		WKEAQEKAAE		EDETQNQHDD		SSSDSGTPSG		PDFNYILNMS
LWSLTKEKVE		ELIKQRDAKG		REVNDLKRKS		PSDLWKEDLA		AFVEELDKVE
SQEREDVLAG		MSGKAIKGKV		GKPKVKKLQL		EETMPSPYGR		RIIPEITAMK
ADASKKLLKK		KKGDLDTAAV		KVEFDEEFSG		APVEGAGEEA		LTPSVPINKG
PKPKREKKEP		GTRVRKTPTS		SGKPSAKKVK		KRNPWSDDES		KSESDLEETE
PVVIPRDSLL		RRAAAERPKY		TFDFSEEEDD		DADDDDDDNN		DLEELKVKAS
PITNDGEDEF		VPSDGLDKDE		YTFSPGKSKA		TPEKSLHDKK		SQDFGNLFSF
PSYSQKSEDD		SAKFDSNEED		SASVFSPSFG		LKQTDKVPSK		TVAAKKGKPS
SDTVPKPKRA		PKQKKVVEAV		NSDSDSEFGI		PKKTTTPKGK		GRGAKKRKAS
GSENEGDYNP		GRKTSKTTSK		KPKKTSFDQD		SDVDIFPSDF		PTEPPSLPRT
GRARKEVKYF		AESDEEEDDV		DFAMFN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

TOP2B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QX3, 4G0U, 4G0V, 4G0W, 4J3N
Ідентифікатори
Символи	TOP2B, TOPIIB, top2beta, topoisomerase (DNA) II beta, DNA topoisomerase II beta, BILU
Зовнішні ІД	OMIM: 126431 MGI: 98791 HomoloGene: 134711 GeneCards: TOP2B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0003918 DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity • nucleotide binding • DNA binding • histone deacetylase binding • chromatin binding • isomerase activity • зв’язування з іоном металу • DNA topoisomerase activity • protein C-terminus binding • protein heterodimerization activity • enzyme binding • ATP binding • protein kinase C binding • ribonucleoprotein complex binding Клітинна компонента • гіалоплазма • нуклеоплазма • GO:0035328 Гетерохроматин • ядерце • клітинне ядро • цитоплазма • Рибонуклеопротеїни • viral integration complex Біологічний процес • resolution of meiotic recombination intermediates • аксоноґенеза • DNA metabolic process • neuron migration • forebrain development • mitotic DNA integrity checkpoint signaling • sister chromatid segregation • DNA topological change • positive regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7155	21974
Ensembl	ENSG00000077097	ENSMUSG00000017485
UniProt	Q02880	Q64511
RefSeq (мРНК)	NM_001068 NM_001330700	NM_009409
RefSeq (білок)	NP_001059 NP_001317629	NP_033435
Локус (UCSC)	Хр. 3: 25.6 – 25.66 Mb	Хр. 14: 6.03 – 6.1 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, топоізомераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Austin C.A., Sng J.H., Patel S., Fisher L.M. (1993). Novel HeLa topoisomerase II is the II beta isoform: complete coding sequence and homology with other type II topoisomerases. Biochim. Biophys. Acta. 1172: 283—291. PMID 8383537 doi:10.1016/0167-4781(93)90215-Y
• Austin C.A., Fisher L.M. (1990). Isolation and characterization of a human cDNA clone encoding a novel DNA topoisomerase II homologue from HeLa cells. FEBS Lett. 266: 115—117. PMID 2163884 doi:10.1016/0014-5793(90)81520-X
• Yuwen H., Hsia C.C., Nakashima Y., Evangelista A., Tabor E. (1997). Binding of wild-type p53 by topoisomerase II and overexpression of topoisomerase II in human hepatocellular carcinoma. Biochem. Biophys. Res. Commun. 234: 194—197. PMID 9168988 doi:10.1006/bbrc.1997.6539
• Davies S.L., Jenkins J.R., Hickson I.D. (1993). Human cells express two differentially spliced forms of topoisomerase II beta mRNA. Nucleic Acids Res. 21: 3719—3723. PMID 8396237 doi:10.1093/nar/21.16.3719
• Mirski S.E., Bielawski J.C., Cole S.P. (2003). Identification of functional nuclear export sequences in human topoisomerase IIalpha and beta. Biochem. Biophys. Res. Commun. 306: 905—911. PMID 12821127 doi:10.1016/S0006-291X(03)01077-5
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240