※[注]学:学士班;硕:硕士班:博:博士班;硕在职:硕士在职专班;UST: 台联大系统合设
 图书资讯暨研究大楼
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 守仁楼
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 医学馆
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 医学二馆
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 生医工程馆(旧称:研究大楼)
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 护理馆
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 图书资讯暨研究大楼
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 牙医馆
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 守仁楼
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 知行楼(人社院)
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 传统医学大楼
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| 医学院 | ■ 医学系(学) |  - 
| ■ 临床医学研究所(硕、硕在职、博) | ■ 传统医药研究所(硕、博) |  - 
| ■ 公共卫生研究所(硕、博) | ■ 医务管理研究所(硕、硕在职) |  - 
| ■ 卫生福利研究所(硕、博) | ■ 环境与职业卫生研究所(硕、博) |  - 
| ■ 生物医学资讯研究所[与生科院合设](硕、博) | ■ 生理学研究所(硕、博) |  - 
| ■ 药理学研究所(硕、博) | ■ 解剖学及细胞生物学研究所(硕) |  - 
| ■ 急重症医学研究所(硕、博) | ■ 脑科学研究所(硕、博) |  - 
| ■ 国际卫生硕士学位学程 | ■ 公共卫生硕士学位学程 |  - 
| ■ 转译医学博士学位学程 | ■ 环境科技博士学位学程[UST] |  
 
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| 生物医学暨工程学院 | ■ 生物医学工程学系(学、硕、博) | ■ 物理治疗暨辅助科技学系(学、硕、博) |  - 
| ■ 医学生物技术暨检验学系(学、硕、博) | ■ 生物医学影像暨放射科学系(学、硕、博) |  - 
| ■ 生医光电研究所(硕、博) | ■ 生医光电暨奈米科学学士学位学程 |  - 
| ■ 生物医学暨工程科技产业博士学位学程 | ■ 光电博士学位学程[UST] |  - 
| ■ 生技产业创新创业推广教育学分班 |  
 
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| 护理学院 | ■ 护理学系(学、硕在职、博) |  - 
| ■ 临床护理研究所(硕) | ■ 社区健康照护研究所(硕) |  
 
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| 生命科学院 | ■ 生命科学系暨基因体科学研究所(学、硕、博) | ■ 神经科学研究所(硕、博) |  - 
| ■ 微生物及免疫学研究所(硕、博) | ■ 生化暨分子生物研究所(硕、博) |  - 
| ■ 生物医学资讯研究所[与医学院合设](硕、博) | ■ 分子医学博士学位学程 |  - 
| ■ 跨领域神经科学国际研究生博士学位学程 | ■ 跨领域神经科学博士学位学程[UST] |  - 
| ■ 生技医疗经营管理硕士在职学位学程 | ■ 生技医疗产业博士学位学程 |  
 
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| 牙医学院 | ■ 牙医学系(学、硕、博) | ■ 口腔生物研究所(硕、博) |  
 
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| 药物科学院 | ■ 药学系(学) |  - 
| ■ 生物药学研究所(硕、博) | ■ 食品安全及健康风险评估研究所(硕) |  
 
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| 人文与社会科学院 | ■ 科技与社会研究所(硕) | ■ 心智哲学研究所(硕) |  - 
| ■ 视觉文化研究所(硕) | ■ 亚际文化研究国际硕士学位学程[UST] |  - 
| ■ 人文与社会教育中心 |  
 
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| 学士班大一大二不分系 | ■ 大一、二:资讯科学、生医科学及基础科学 ■ 大三后分流(除医学系、牙医学系以外)
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| 共同教育中心 | ■ 通识教育:核心通识、博雅通识、语文课程 ■ 基础科学教育
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