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GenBank
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基因银行（GenBank）是一个开放获取的序列数据库，对所有公开可利用的核苷酸序列与其翻译的蛋白质进行收集并注释。
此数据库是国际协作核酸序列数据库（INSDC）的一部分，由美国国家生物技术信息中心（NCBI）主管，NCBI为美国国立卫生研究院的下属机构。GenBank和它的合作者从全球各个实验室接收了超过百万种生物的数据。
成立三十年来，GenBank数据库成为了最重要的也是最有影响力的生物全领域数据库，其数据正被全球数以百万计的研究人员获取与引用。GenBank中的数据量正以每18个月翻一番的速度持续指数增长[1][2]，在2013年2月的版本194中，数据库包含有1.62亿个序列，含有1500亿个核苷酸堿基。[3]
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历史
1979年，洛斯阿拉莫斯国家实验室（LANL）理论生物学和生物物理学小组 （页面存档备份，存于互联网档案馆）的Walter Goad等人建立了洛斯阿拉莫斯序列数据库，最终成为了公共的 GenBank数据库的前身[4]。1982年，由美国国立卫生研究院、美国国家科学基金会、美国能源部和国防部共同出资，LANL与BBN科技公司合作，成立了GenBank。到1983年底，已有超过2,000个序列被存储在GenBank。
在20世纪80年代中期，斯坦福大学的Intelligenetics bioinformatics公司与LANL合作经营着GenBank项目[5]。作为最早的互联网生物信息学社区项目，GenBank计划为生物学家打造一个开放获取的BIOSCI/Bionet消息社群。1989到1992年，GenBank被转移到新成立的美国国家生物技术信息中心[6]。
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发展
在GenBank的版本162.0（2007年8月）的发行说明中道出：“从1982年到现在，GenBank中的碱基数每隔18个月翻一番。”[7]
截至2013年7月8日[update]，GenBank的版本196.0已有165,740,164个基因座，152,599,230,112个碱基，165,740,164个报导序列[3]。 GenBank数据库还包括一些额外的数据集，不包括在这个统计内。
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另见
- Ensembl
- Human Protein Reference Database (HPRD)
- 序列分析
- UniProt
- 已测序真核生物基因组列表
- 已测序古菌基因组列表
- RefSeq — the Reference Sequence Database
- Geneious — includes a GenBank Submission Tool
参考文献
外部链接
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