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CPK配色

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CPK配色
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化学中,CPK配色是一种国际通用的原子分子模型的配色方式,也是最常用、最多人使用的分子模型上色方式,可用于各种分子模型元素标示,最常用于球棒模型空间填充模型。该配色方式由CPK模型的设计者Corey、Pauling(莱纳斯·鲍林)与Koltun提出且改进。

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一个塑料制的脯氨酸MolyMod球棒模型。 这些模型通常遵守CPK配色。
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一个依照CPK配色上色的元素周期表

历史

1952年,科里和鲍林发表了描述蛋白质和其他生物分子空间填充模型,他们已经在加州理工学院制做出一个模型[1]。他们用硬球表示原子并涂上一些代表性的鲜艳颜色,来表示相应的化学元素。他们的上色模式为:

更多信息 元素, 用色 ...

他们还建立塑料球小模型使用搭配同色系的架构。

1965年,Koltun将Corey和鲍林建模技术的改进版本申请专利获准[2]。在他的专利中,他提到了以下颜色:

更多信息 元素, 用色 ...

现在常用的CPK配色将色彩更变为:

更多信息 元素, 用色 ...
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典型的配色

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一箱球棒模型零件,相同颜色代表同一种元素

典型的CPK配色包括:

  (H) 白色
  (C) 黑色
  (N) 深蓝色
  (O) 红色
  (F)、 (Cl) 草绿
  (Br) 红棕色
  (I) 深紫罗兰色
  稀有气体HeNeArKrXe 水蓝色
  (P) 橘色
  (S) 黄色
  (B)、大多数过渡金属 桃色、 鲑鱼的颜色
  碱金属LiNaKRbCsFr 紫色
  碱土金属BeMgCaSrBaRa 深绿色
  (Ti) 灰色
  (Fe) 铁锈色
  其他元素 洋红色

有些CPK颜色是来自于纯元素的颜色或该元素的常见化合物的颜色,以便于记忆。例如,是一种无色气体木炭石墨皆是黑色;常见的黄色的;氯气是一种绿色气体溶于乙醚是一个暗红色液体罗兰色的;无定形磷红色铁锈暗橙色红色等。对于一些的颜色,如氧气氮气,则来源不可考。也许是因为氧气燃烧或含氧血液血红蛋白红色所以将氧定义成红色;地球大气层的主要组成部分,从而出现到人看到的天空天蓝色因此将氮设定成蓝色。[来源请求]

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化学键的颜色

一般化学键的颜色会依据邻近元素上色,若两端元素相同,则将键漆上邻近原子的颜色,若两端原子不同,则依照电子云可能的分布来决定两端元素在键上上色的比例。有些模型则将键统一涂上同一种颜色,常见的颜色为灰色或白色。离子键一般不会描绘,另外氢键也有人使用黄色的虚线表示[3]

其他的CPK配色方式

下表显示了一些流行的软件分配给每个元素的颜色。C列是原始由Corey和鲍林设定的CPK配色[1],K是Koltun的专利[2],J列是由分子可视化的Jmol使用的配色方案[4],R列是Rasmol使用的配色方案,其显示两种颜色,第二种表是2.7.3及以后版本所使用的颜色[4][5]。所有的颜色都很相似的,并且可能依赖于显示硬件和观看条件。

更多信息 原子序, 符号 ...
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参见

参考文献

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