Y RNA系一种短非编码RNA。它是Ro60核糖核蛋白颗粒的组分之一[1]。在全身性红斑狼疮患者体内,它是患者自身抗体的攻击目标之一[2]。Y RNA对DNA复制来说至关重要,因为它们能与染色质起始点识别复合物相互作用[3][4]

Quick Facts Y RNA, 识别符 ...
Y RNA
Thumb
Y RNA的预想二级结构以及保守序列
识别符
代号 Y_RNA
Alt.代号 Y1; Y2; Y3; Y5
Rfam RF00019
其他数据
RNA类型 基因
真核生物
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结构

推测Y RNA的5'和3'端会折叠形成一个保守的茎形结构。已确认Y RNA有一个单胞嘧啶(C)突出,这个突出对Y RNA与Ro蛋白的结合至关重要[5][6][7]

功能

目前,已知Y RNA有两大功能:一,抑制Ro60;二,作为DNA复制的一种起始因子。失去了保守的与Ro60蛋白的结合位点的突变人类Y RNA仍然能参与DNA复制[3],这说明与Ro蛋白结合以及启动DNA复制是Y RNA的两种互不相干的功能。尽管Y RNA的衍生小型RNA大小与微RNA相当,但是它们却和微RNA在功能上却毫无关系[8]

Thumb
图中,自身抗原Ro(标成白色)与Y RNA(标成红色)的双链区末端结合。另外,还有一条单链RNA(标成蓝色)(PDB: 1YVP [1]) (页面存档备份,存于互联网档案馆[5]

Ro60抑制

在自由状态下,Ro蛋白质会与一系列的折叠错误的RNA结合,比如折叠错误的5SrRNA,这被认为是(RNA)品质控制机制的一种[9]。与Y RNA或另外的RNA结合的Ro复合物的晶体结构显示,Ro蛋白质与单链RNA的3'端的结合特异性相对较低。但Y RNA与Ro蛋白质还会在另一位点发生特异性结合,且该结合能调控Ro复合物与其他RNA的结合[5]。在Deinococcus中,自由状态下的Ro蛋白亦与参与23SrRNA的成熟过程[10]。在该物种中,造成Y RNA缺失的突变并不致死,Y RNA在不与Ro蛋白结合时会不稳定[10]

启动DNA复制

人类的Y RNA对DNA复制是不可或缺的[3]。通过生物化学上的分离和重构实验,人们已证明,在体外培养(in vitro)的脊椎动物细胞的中,Y RNA对染色体DNA的复制是必不可少的[3]。如果对体外细胞或体内(in vivo)细胞中的Y RNA进行特异性降解的话,那么DNA复制会被抑制[3]。科学家认为Y RNA通过作同时与染色质和与复制启动相关的蛋白(包括起始识别复合体)结合的中间体发挥作用[4]

人类病理学中应用

Y RNA在一些人类肿瘤中处于过度表达状态,且为细胞增殖所必需[11]。Y染色体的与微RNA大小相近的小型分解产物可能与自体免疫病等病症有关[12]

分布

已在真核细胞与细菌中发现了被推定为Y RNA和Ro蛋白质的物质[6][13]。人类应有4种Y RNA,分别是hY1、hY3、hY4,以及hY5[13]。另外,人体内也有很多与Y RNA相关的假基因。秀丽隐杆线虫(C. elegans)则有1种Y RNA,名为CeY RNA。该生物体内许多sbRNA也被认为可能与Y RNA同源[14][15]抗辐射奇异球菌Deinococcus radiodurans)编码一种与Ro蛋白同源的蛋白质,名为rsr(Ro sixty related,意为第六个与Ro有关的)。用UV灯对该菌进行照射,可以诱导编码rsr的基因的表达。在该情况下,抗辐射奇异球菌的菌体内至少会出现4种短RNA,其中一种RNA似乎与Y RNA具有同源性[16]

参考

外部链接

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