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芽孢桿菌門
细菌的一门 来自维基百科,自由的百科全书
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芽孢桿菌門(學名:Bacillota),前稱為厚壁菌門(學名:Firmicutes),[3]是細菌的一個門,大多數細菌為革蘭氏陽性,具有細胞壁結構。[4] 它們有圓形細胞,稱為球菌(單數球菌),或棒狀形式(桿菌)。一些芽孢桿菌,例如來自陰性球菌綱的巨球形菌屬、梳狀菌屬、月形單胞菌屬和嗜發酵菌屬,具有多孔的偽外膜,使它們染成革蘭氏陰性。許多芽孢桿菌會產生內孢子,這種內孢子耐乾燥並能在極端條件下生存。它們存在於各種環境中,該組包括一些值得注意的病原體。屬於同一科的陽光桿菌芽孢桿菌通過不產氧光合作用 產生能量。芽孢桿菌在啤酒、葡萄酒和蘋果酒的腐敗中起着重要作用。
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分類學
2021年對厚壁菌門等門類的重新命名在微生物學家中仍然存在爭議,其中許多人繼續使用文獻中長期存在的早期名稱。[5] 「厚壁菌門」(Firmicutes)一詞源於拉丁語,意為「堅韌的皮膚」,指的是該門細菌特有的厚細胞壁。科學家曾將厚壁菌門歸類為所有革蘭氏陽性菌,但最近將其定義為一個核心相關菌群,稱為低鳥嘌呤+胞嘧啶(G+C)含量組,與高G+C含量的放線菌門相對。
該菌群通常分為厭氧梭菌綱和專性需氧或選擇性需氧芽孢桿菌綱。在系統發生樹上,前兩類菌群顯示為並系群或多系群,它們的主要屬:梭菌屬和芽孢桿菌屬亦如此。[6] 然而,一般認為芽孢桿菌門作為一個整體是單系的,或者除了柔膜菌綱之外是並系的,著名的柔膜菌綱的一個屬即支原體,因其缺乏細胞壁而不能被革蘭氏方法染色。[7]
進化
一些人認為芽孢桿菌門是古菌的來源,[8]根據那裡的模型,古菌從細菌分支出來相對較晚,而不是從細胞生命的最後共同祖先(last universal common ancestor,縮寫:LUCA)形成獨立起源的早期譜系(生命領域)。
系統發育
目前接受的分類法基於原核生物標準命名列表(LPSN)[9]和美國國家生物技術信息中心(NCBI)。[10]
基於16S rRNA LTP_01_2022[11][12][13] | GTDB 08-RS214 基因組分類學數據庫[14][15][16] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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下屬
截至2016年[update],超過274個屬被認為屬於芽孢桿菌門,芽孢桿菌門的重要屬包括:
- 丹毒絲菌屬(Erysipelothrix)
臨床意義
芽孢桿菌門占人類胃腸道菌群的11%—95%。[17]作為腸道菌群的一部分,芽孢桿菌門已被證明參與能量吸收,並可能與糖尿病和肥胖症的發展有關。[18][19][20][21] 在健康成年人的腸道中,數量最多的細菌是普氏棲糞桿菌,占腸道菌群總量的5%,屬於芽孢桿菌門。該菌種與肥胖症中低度炎症的減輕直接相關。[22] 研究發現,肥胖兒童腸道中的普氏棲糞桿菌含量高於非肥胖兒童。
多項研究發現,肥胖個體的芽孢桿菌數量高於體型較瘦的對照組。肥胖患者的乳酸桿菌(屬於芽孢桿菌門)含量較高,其中一項研究發現,進行減肥飲食的肥胖患者腸道內的芽孢桿菌數量有所減少。[23]
研究還表明,小鼠飲食的變化會促進芽孢桿菌豐度的變化。飼餵西方飲食(高脂肪/高糖)的小鼠的芽孢桿菌相對豐度高於飼餵標準低脂肪/高多糖飲食的小鼠。芽孢桿菌含量的增加也與小鼠肥胖和體重增加有關。[24] 具體來說,在肥胖小鼠中,柔膜菌綱(屬芽孢桿菌門)最為常見。當將芽孢桿菌門豐度較高的肥胖小鼠的腸道菌群移植到無菌小鼠的腸道中時,與移植了芽孢桿菌門豐度較低的瘦小鼠的腸道菌群的相比,無菌小鼠的脂肪顯著增加。[25]
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參閱
參考文獻
外部連結
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