消毒(英語:disinfection)是利用化學品或其他方法消滅大部份微生物,使常見的致病細菌數目減少到安全的水平。然而,與滅菌(sterilization)相比,部份細菌孢子、濾過性病毒、結核桿菌及真菌等都可能沒有消滅。
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消毒劑通常用於日常生活所接觸的事物,如地板、餐具,在醫療上則只可用於一些體外的工具(如探熱針)。
消毒的方式一般可使用酒精、甲醛、氨水、漂白水、環氧乙烷、碘液等常用消毒劑進行噴灑擦拭乃至清洗,甚至簡單的沸水浸洗和蒸煮,也有使用紫外光照射進行消毒等。