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化學資訊學
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化學資訊學是一門交叉學科，研究如何使用電腦與資訊科技來表示、儲存、檢索、分析和預測化學資料與分子性質。它結合了化學、電腦科學、數學與資訊學的原理，旨在從大量化學結構與實驗資料中提取有用資訊，以支援化學研究與藥物發現等應用。
歷史
術語化學資訊學（Cheminformatics）是1998年被F.K. 布朗[1][2]定義的：
化學資訊學是這些資訊資源的混合，將資料轉化為資訊和資訊轉化為知識，以便在藥物導向辨識和最佳化領域更快地做出更好的決策。
英文中，Cheminformatics和Chemoinformatics兩種拼寫均被使用，而使用更多的則是較短的變體——Cheminformatics[3]。最近成立的《化學資訊學學報》是前者的強力推動。
基礎
化學資訊學將化學，電腦科學和資訊學的科學工作領域結合在化學空間中的拓撲，化學圖論，資訊檢索和資料探勘領域[4][5][6][7]。化學資訊學也可以應用於各種行業，如紙張和紙漿，染料和相關行業的資料分析。
應用
化學資訊學的主要應用是儲存，索引和搜尋與化合物有關的資訊。這種儲存資訊的有效搜尋包括電腦科學中作為資料探勘，資訊檢索，資訊抽取和機器學習的主題。相關研究課題包括：
化學結構的電腦表示使用專門的格式，例如基於XML的化學標記式語言或簡化分子線性輸入規範（SMILES）。 這些表徵通常用於儲存在大型化學資料庫中。 雖然一些格式適用於2或3維的視覺表示，但其他格式更適合於研究物理相互作用，建模和對接研究。
化學資料可以涉及真實或虛擬分子。可以以各種方式產生化合物的虛擬化合物庫以探索化學空間，並假設具有所需性質的全新的化合物。
最近使用片段最佳化生長（fragment optimized growth）演算法生成化合物類（藥物，天然產物，多樣性合成產品）的虛擬化合物庫[8] 。這是通過使用化學資訊工具來訓練馬爾可夫鏈在真實化合物類別上的轉變概率，然後使用馬爾可夫鏈產生類似於訓練資料庫的全新化合物。
與高通量篩選相比，虛擬篩選涉及通過各種方法在化合物庫中進行計算篩選，例如蛋白質和蛋白質或多肽的對接，用於辨識可能具有所需特性（例如針對特定靶標的生物活性） 的分子。在某些情況下， 組合化學用於化合物庫的開發，以提高挖掘化學空間的效率。更常見的是，篩選多樣化的小分子或天然產物庫。
這是定量結構-活性關係和定量結構性質關係值的計算，用於預測其結構中化合物的活性。在這種情況下，化學計量學也和它有很強的關係。化學專家系統也是相關的，因為它們代表化學知識的一部分，作為電腦類比表示。有一個相對較新的匹配分子對分析或預測驅動的MMPA的概念，它與QSAR模型相結合，以便辨識活動懸崖（Activity cliffs）[9]。化學懸崖通常被定義為結構相似且對同一靶點都具有活性但藥效差異較大的化合物或化合物組。
參閱
參考資料
外部連結
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