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GenBank
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基因銀行（GenBank）是一個開放獲取的序列資料庫，對所有公開可利用的核苷酸序列與其翻譯的蛋白質進行收集並注釋。
此資料庫是國際協作核酸序列資料庫（INSDC）的一部分，由美國國家生物技術信息中心（NCBI）主管，NCBI為美國國立衛生研究院的下屬機構。GenBank和它的合作者從全球各個實驗室接收了超過百萬種生物的數據。
成立三十年來，GenBank資料庫成為了最重要的也是最有影響力的生物全領域資料庫，其數據正被全球數以百萬計的研究人員獲取與引用。GenBank中的數據量正以每18個月翻一番的速度持續指數增長[1][2]，在2013年2月的版本194中，資料庫包含有1.62億個序列，含有1500億個核苷酸堿基。[3]
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歷史
1979年，洛斯阿拉莫斯國家實驗室（LANL）理論生物學和生物物理學小組 （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）的Walter Goad等人建立了洛斯阿拉莫斯序列資料庫，最終成為了公共的 GenBank資料庫的前身[4]。1982年，由美國國立衛生研究院、美國國家科學基金會、美國能源部和國防部共同出資，LANL與BBN科技公司合作，成立了GenBank。到1983年底，已有超過2,000個序列被存儲在GenBank。
在20世紀80年代中期，史丹佛大學的Intelligenetics bioinformatics公司與LANL合作經營著GenBank項目[5]。作為最早的網際網路生物信息學社區項目，GenBank計劃為生物學家打造一個開放獲取的BIOSCI/Bionet消息社群。1989到1992年，GenBank被轉移到新成立的美國國家生物技術信息中心[6]。
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發展
在GenBank的版本162.0（2007年8月）的發行說明中道出：「從1982年到現在，GenBank中的鹼基數每隔18個月翻一番。」[7]
截至2013年7月8日[update]，GenBank的版本196.0已有165,740,164個基因座，152,599,230,112個鹼基，165,740,164個報導序列[3]。 GenBank資料庫還包括一些額外的數據集，不包括在這個統計內。
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另見
- Ensembl
- Human Protein Reference Database (HPRD)
- 序列分析
- UniProt
- 已測序真核生物基因組列表
- 已測序古菌基因組列表
- RefSeq — the Reference Sequence Database
- Geneious — includes a GenBank Submission Tool
參考文獻
外部連結
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