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戀臭假單胞菌
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戀臭假單胞菌（Pseudomonas putida）是一種營腐生的土壤桿菌，屬於革蘭氏陰性菌，根據16SrRNA基因分析結果歸為假單胞菌屬（狹義），同其他幾個物種一起併入該屬下的戀臭假單胞菌組。[1]
通過對假單胞菌屬的所有完整基因組進行系統基因組學測序，人們發現戀臭假單胞菌並不是一個單系演化支，而是包括了多個物種在內的、範圍更廣的進化群體，即戀臭假單胞菌組。[2]
戀臭假單胞菌（的一個變種）是世界上首個獲得專利的生物體，向生物頒發專利的行為引起了一些爭議。最終美國最高法院判決這一變種的發明人查克拉巴蒂勝訴，這一史無前例的判決成為美國的判例《戴蒙德訴查克拉巴蒂案》。
戀臭假單胞菌擁有豐富的代謝途徑，可以分解甲苯等有機分子[3]，應用於生物修復和污染治理中。雖然同屬的許多物種也有類似的能力，但戀臭假單胞菌最大的優點是安全無害，而不像綠膿桿菌（P. aeruginosa）是潛在的人類病原體。
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應用
戀臭假單胞菌在生物修復領域有著極為廣泛的應用，例如，它可用作土壤接種物修復受到萘污染的土地。[4] 它還能將難以被生物分解的苯乙烯轉化為可被生物分解的聚羥基烷酸酯（PHA），利於泡沫塑料的回收。[5][6]
已隱藏部分未翻譯內容，歡迎參與翻譯。
Di- to pentanucleotide usage and the list of the most abundant octa- to tetradecanucleotides are useful measures of the bacterial genomic signature. The Pseudomonas putida KT2440 chromosome is characterized by strand symmetry and intra-strand parity of complementary oligonucleotides. Each tetranucleotide occurs with similar frequency on the two strands. Tetranucleotide usage is biased by G+C content and physicochemical constraints such as base stacking energy, dinucleotide propeller twist angle or trinucleotide bendability. The 105 regions with atypical oligonucleotide composition can be differentiated by their patterns of oligonucleotide usage into categories of horizontally acquired gene islands, multidomain genes or ancient regions such as genes for ribosomal proteins and RNAs. A species-specific extragenic palindromic sequence is the most common repeat in the genome that can be exploited for the typing of P. putida strains. In the coding sequence of P. putida LLL is the most abundant tripeptide.[9]
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戀臭假單胞菌對基因編輯表現出良好的服從性，因此可用於醫藥、農業領域多種化合物的工業生產。
「Pseudomonas putida CBB5」這一野生品系可以在純咖啡因中存活，並將咖啡因分解為二氧化碳和氨。[10][11]
參考文獻
外部連結
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