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虾虎鱼科（学名：Gobiidae）物种按Larson & Murdy (2001)的分类，可分为以下的5个亚科24个属[1]：
- 近盲虾虎鱼亚科（Amblyopinae）：如鳗虾虎类（Taenioides）、狼牙虾虎鱼类（Odontamblyopus）。俗称“奶鱼”。背鳍和臀鳍与尾鳍相连，前后背鳍有鳍膜相连；穴居，体长呈鳗形，体色粉红至紫色，眼退化或消失。
- 虾虎鱼亚科（Gobiinae）
- 拟虾虎鱼亚科（Gobionellinae）
- 背眼虾虎鱼亚科（Oxudercinae）：如弹涂鱼类。中国过去称此亚科为“弹涂鱼科（Periophthalmidae）”，与虾虎鱼科并列归入虾虎鱼亚目当中。现已并入虾虎鱼科作为一亚科。 胸鳍基底发达成臂状，在陆上充当行动器官。眼背位，靠近，突出，下眼睑发达。下颌牙仅一排。
- 双盘虾虎鱼亚科（Sicydiinae）
有些文献会采用瘤虾虎鱼亚科（Benthophilinae），包括瘤虾虎鱼族、新虾虎鱼族、Ponticolini族。但Catalog of Fishes之类的主流分类仍然只承认虾虎鱼科传统的五个亚科，依然把本亚科的物种归入虾虎鱼亚科。
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阿匍虾虎鱼属（Aboma）
- 繁口阿匍虾虎鱼 Aboma etheostoma
刺虾虎鱼属（Acanthogobius）
细棘虾虎鱼属（Acentrogobius）
阿富虾虎鱼属（Afurcagobius）
明仁虾虎鱼属（Akihito）
阿科虾虎鱼属（Akko）
钝尾虾虎鱼属（Amblychaeturichthys）
钝塘鳢属（Amblyeleotris）
钝虾虎鱼属（Amblygobius）
- 白条钝虾虎鱼 Amblygobius albimaculatus
- 菲律宾钝虾虎鱼 Amblygobius buanensis
- 百瑙钝虾虎鱼 Amblygobius bynoensis
- 华丽钝虾虎鱼 Amblygobius decussatus
- 伊氏钝虾虎鱼 Amblygobius esakiae
- 林克钝虾虎鱼 Amblygobius linki
- 马氏钝虾虎鱼 Amblygobius magnusi
- 短唇钝虾虎鱼 Amblygobius nocturnus ：又称短唇钝鲨。
- 尾斑钝虾虎鱼 Amblygobius phalaena ：又称尾斑钝鲨。
- 半带钝虾虎鱼 Amblygobius semicinctus
- 西沃氏钝虾虎鱼 Amblygobius sewardii
- 蛾钝虾虎鱼 Amblygobius sphynx
- 胸眼钝虾虎鱼 Amblygobius stethophthalmus
- 泰氏钝虾虎鱼 Amblygobius tekomaji
钝孔虾虎鱼属（Amblyotrypauchen）
- 钝孔虾虎鱼 Amblyotrypauchen arctocephalus
缰虾虎鱼属（Amoya）
玻璃虾虎鱼属（Aphia）
- 微体玻璃虾虎鱼 Aphia minuta
平牙虾虎鱼属（Apocryptes）
- 棘平牙虾虎鱼 Apocryptes bato
叉牙虾虎鱼属（Apocryptodon）
网虾虎鱼属（Arcygobius baliurus）
- 网虾虎鱼 Arcygobius baliurus
砂栖虾虎鱼属（Arenigobius）
- 双砂栖虾虎鱼 Arenigobius bifrenatus
- 砂栖虾虎鱼 Arenigobius frenatus
- 莱氏砂栖虾虎鱼 Arenigobius leftwichi
阿萨虾虎鱼属（Aruma）
- 阿萨虾虎鱼 Aruma histrio
星塘鳢属（Asterropteryx）
鞍虾虎鱼属（Astrabe）
- 黑带鞍虾虎鱼 Astrabe fasciata
- 黄斑鞍虾虎鱼 Astrabe flavimaculata
- 乳斑鞍虾虎鱼 Astrabe lactisella
- 锡拉鞍虾虎鱼 Astrabe sirahamaensis
颊沟虾虎鱼属（Aulopareia）
- 泰国颊沟虾虎鱼 Aulopareia janetae
- 绿斑颊沟虾虎鱼 Aulopareia unicolor
软塘鳢属（Austrolethops）
- 沃氏软塘鳢 Austrolethops wardi ：又称华氏软塘鳢。
阿胡虾虎鱼属（Awaous）
胡虾虎鱼属（Barbulifer）
- 长须胡虾虎鱼 Barbulifer antennatus
- 短须胡虾虎鱼 Barbulifer ceuthoecus
- 墨西哥胡虾虎鱼 Barbulifer mexicanus
- 豹纹胡虾虎鱼 Barbulifer pantherinus
髯毛虾虎鱼属（Barbuligobius）
- 髯毛虾虎鱼 Barbuligobius boehlkei ：又称须虾虎鱼。
深虾虎鱼属（Bathygobius）
似深蜥虾虎鱼属（Benthophiloides）
- 布氏似深蜥虾虎鱼 Benthophiloides brauneri Beling & Iljin, 1927
瘤虾虎鱼属（Benthophilus）
- 贝氏瘤虾虎鱼 Benthophilus baeri
- 颗粒瘤虾虎鱼 Benthophilus granulosus
- 格氏瘤虾虎鱼 Benthophilus grimmi
- 小头瘤虾虎鱼 Benthophilus leptocephalus
- 细吻瘤虾虎鱼 Benthophilus leptorhynchus
- 大头瘤虾虎鱼 Benthophilus macrocephalus
- 马氏瘤虾虎鱼 Benthophilus magistri
- 深瘤虾虎鱼 Benthophilus profundorum
- 棘瘤虾虎鱼 Benthophilus spinosus
- 星瘤虾虎鱼 Benthophilus stellatus
大弹涂鱼属（Boleophthalmus）
- 北澳洲大弹涂鱼 Boleophthalmus birdsongi
- 薄氏大弹涂鱼 Boleophthalmus boddarti
- 绿斑大弹涂鱼 Boleophthalmus caeruleomaculatus
- 杜氏大弹涂鱼 Boleophthalmus dussumieri
- 细斑大弹涂鱼 Boleophthalmus maculatus
- 大弹涂鱼 Boleophthalmus pectinirostris
白睛虾虎鱼属（Bollmannia）
- 波克白睛虾虎鱼 Bollmannia boqueronensis
- 栉孔白睛虾虎鱼 Bollmannia chlamydes
- 裸吻白睛虾虎鱼 Bollmannia communis
- 艾氏白睛虾虎鱼 Bollmannia eigenmanni
- 戈氏白睛虾虎鱼 Bollmannia gomezi
- 白睛虾虎鱼 Bollmannia jeannae
- 长鳍白睛虾虎鱼 Bollmannia longipinnis
- 大盖白睛虾虎鱼 Bollmannia macropoma
- 贪婪白睛𫚥鱼 Bollmannia marginalis
- 睛斑白睛虾虎鱼 Bollmannia ocellata
- 巴拿马白睛虾虎鱼 Bollmannia pawneea
- 眼点白睛虾虎鱼 Bollmannia stigmatura
- 荫白睛虾虎鱼 Bollmannia umbrosa
盲虾虎鱼属（Brachyamblyopus）
- 短体盲虾虎鱼 Brachyamblyopus brachysoma
- 红线盲虾虎鱼 Brachyamblyopus rubrilineatus
短虾虎鱼属（Brachygobius）
- 群栖短虾虎鱼 Brachygobius aggregatus
- 阿氏短虾虎鱼 Brachygobius alcocki
- 道氏短虾虎鱼 Brachygobius doriae
- 卡比伦短虾虎鱼 Brachygobius kabiliensis
- 印度短虾虎鱼 Brachygobius nunus
- 马来短虾虎鱼 Brachygobius sabanus
- 休阿短虾虎鱼 Brachygobius sua
- 黄黑短虾虎鱼 Brachygobius xanthomelas
- 黄带短虾虎鱼 （Brachygobius xanthozonus]]
珊瑚虾虎鱼属（Bryaninops）
- 狭鳃珊瑚虾虎鱼 Bryaninops amplus
- 戴安娜珊瑚虾虎鱼 Bryaninops dianneae
- 腹盘珊瑚虾虎鱼 Bryaninops discus
- 厄尔珊瑚虾虎鱼 Bryaninops earlei
- 红眼珊瑚虾虎鱼 Bryaninops erythrops
- 等鳞珊瑚虾虎鱼 Bryaninops isis
- 宽鳃珊瑚虾虎鱼 Bryaninops loki
- 漂游珊瑚虾虎鱼 Bryaninops natans ：又称红眼珊瑚虾虎鱼。
- 单鼻珊瑚虾虎鱼 Bryaninops nexus
- 裸头珊瑚虾虎鱼 Bryaninops ridens
- 虎纹珊瑚虾虎鱼 Bryaninops tigris
- 勇氏珊瑚虾虎鱼 Bryaninops yongei ：又称颏突珊瑚虾虎鱼。
冰岛虾虎鱼属（Buenia）
- 安芬冰岛虾虎鱼 Buenia affinis
- 冰岛虾虎鱼 Buenia jeffreysii
大眼虾虎鱼属（Cabillus）
- 腹鳞大眼虾虎鱼 Cabillus lacertops
- 大眼虾虎鱼 Cabillus tongarevae
隐眼虾虎鱼属（Caecogobius）
- 隐眼虾虎鱼 Caecogobius cryptophthalmus Berti & Ercolini, 1991
卡佛虾虎鱼属（Caffrogobius）
- 斑鳍卡佛虾虎鱼 Caffrogobius agulhensis
- 横带卡佛虾虎鱼 Caffrogobius caffer
- 钝头卡佛虾虎鱼 Caffrogobius dubius
- 好望角卡佛虾虎鱼 Caffrogobius gilchristi
- 点纹卡佛虾虎鱼 Caffrogobius natalensis
- 裸头卡佛虾虎鱼 Caffrogobius nudiceps
- 点鳍卡佛虾虎鱼 Caffrogobius saldanha
硬皮虾虎鱼属（Callogobius）
头虾虎鱼属（Caragobius）
- 头虾虎鱼 Caragobius typhlops
- 无鳞鳗虾虎鱼 Caragobius urolepis
里海虾虎鱼属（Caspiosoma）
- 里海虾虎鱼 Caspiosoma caspium (Kessler, 1877)，基异名：Gobiosoma caspium Kessler, 1877
裸头虾虎鱼属（Chaenogobius）
- 长颌大口虾虎鱼 Chaenogobius annularis ：又称长颌虾虎鱼。
- 栗色裸头虾虎鱼 Chaenogobius castaneus
- 圆裸头虾虎鱼 Chaenogobius cylindricus
- 七棘裸头虾虎鱼 Chaenogobius heptacanthus
- 疣舌裸头虾虎鱼 Chaenogobius isaza
- 黄带裸头虾虎鱼 Chaenogobius laevis
- 大颌裸头虾虎鱼 Chaenogobius macrognathus
- 网纹裸头虾虎鱼 Chaenogobius mororanus
- 沟裸头虾虎鱼 Chaenogobius scrobiculatus
- 塔氏裸头虾虎鱼 Chaenogobius taranetzi
- 横带裸头虾虎鱼 Chaenogobius transversefasciatus
- 颐突裸头虾虎鱼 Chaenogobius uchidai
- 条尾裸头虾虎鱼 Chaenogobius urotaenia
矛尾虾虎鱼属（Chaeturichthys）
- 斑鳍矛尾虾虎鱼 Chaeturichthys sciistius
- 矛尾虾虎鱼 Chaeturichthys stigmatias
大口虾虎鱼属（Chasmichthys）
- 大口虾虎鱼 Chasmichthys gulosus
蹼虾虎鱼属（Chiramenu）
- 蹼虾虎鱼 Chiramenu fluviatilis
皱鳃虾虎鱼属（Chlamydogobius）
- 皱鳃虾虎鱼 Chlamydogobius eremius
- 葛氏皱鳃虾虎鱼 Chlamydogobius gloveri
- 芬河皱鳃虾虎鱼 Chlamydogobius japalpa
- 小鳍皱鳃虾虎鱼 Chlamydogobius micropterus
- 蝌蚪皱鳃虾虎鱼 Chlamydogobius ranunculus
- 颊麟皱鳃虾虎鱼 Chlamydogobius squamigenus
厚唇虾虎鱼属（Chonophorus）
- 巴氏厚唇虾虎鱼 Chonophorus bustamantei
- 大吻厚唇虾虎鱼 Chonophorus macrorhynchus
- 苍白厚唇虾虎鱼 Chonophorus pallidus
- 纤厚唇虾虎鱼 Chonophorus stamineus
双鳞塘鳢属（Chriolepis）
- 楔形双鳞塘鳢 Chriolepis cuneata
- 穹苍双鳞塘鳢 Chriolepis dialepta
- 透明双鳞塘鳢 Chriolepis fisheri
- 美丽双鳞塘鳢 Chriolepis lepidota
- 微双鳞塘鳢 Chriolepis minutillus
- 矶双鳞塘鳢 Chriolepis tagus
- 条纹双鳞塘鳢 Chriolepis zebra
柔虾虎鱼属（Chromogobius）
- 四带柔虾虎鱼 Chromogobius quadrivittatus
- 斑带柔虾虎鱼 Chromogobius zebratus
翼棘虾虎鱼属（Clariger）
- 花斑翼棘虾虎鱼 Clariger chionomaculatus
- 翼棘虾虎鱼 Clariger cosmurus
- 细翼棘虾虎鱼 Clariger exilis
- 无鳞翼棘虾虎鱼 Clariger papillosus
箭虾虎鱼属（Clevelandia）
- 箭虾虎鱼 Clevelandia ios
瞳虾虎鱼属（Corcyrogobius）
- 利氏瞳虾虎鱼 Corcyrogobius liechtensteini
- 卢氏瞳虾虎鱼 Corcyrogobius lubbocki
真盔虾虎鱼属（Coryogalops）
- 阿氏真盔虾虎鱼 Coryogalops adamsoni
- 真盔虾虎鱼 Coryogalops anomolus
- 布氏真盔虾虎鱼 Coryogalops bretti
- 巴基斯坦真盔虾虎鱼 Coryogalops bulejiensis
- 单斑真盔虾虎鱼 Coryogalops monospilus
- 沟真盔虾虎鱼 Coryogalops ochetica
- 鳞鳍真盔虾虎鱼 Coryogalops sordida
- 方斑真盔虾虎鱼 Coryogalops tessellatus
- 威廉氏真盔虾虎鱼 Coryogalops william
鲯塘鳢属（Coryphopterus）
也称植虾虎鱼属。
- 带胸鲯塘鳢 Coryphopterus alloides
- 双点鲯塘鳢 Coryphopterus dicrus
- 澳洲鲯塘鳢 Coryphopterus duospilus
- 斑柄鲯塘鳢 Coryphopterus eidolon
- 纹鲯塘鳢 Coryphopterus glaucofraenum
- 臂斑植虾虎鱼 Coryphopterus humeralis
- 巨目鲯塘鳢 Coryphopterus hyalinus
- 黄斑鲯塘鳢 Coryphopterus inframaculatus
- 脂鲯塘鳢 Coryphopterus lipernes
- 新鲯塘鳢 Coryphopterus neophytus
- 沟鲯塘鳢 Coryphopterus ocheticus
- 环肛鲯塘鳢 Coryphopterus personatus
- 斑点鲯塘鳢 Coryphopterus punctipectophorus
- 圣鲯塘鳢 Coryphopterus signipinnis
- 条鳍鲯塘鳢 Coryphopterus thrix
- 尾斑鲯塘鳢 Coryphopterus urospilus
杯虾虎鱼属（Cotylopus）
- 尖鳍杯虾虎鱼 Cotylopus acutipinnis
纵颊虾虎鱼属（Creisson）
- 绿斑纵颊虾虎鱼 Creisson chlorostigmatoides
项冠虾虎鱼属（Cristatogobius）
- 浅色项冠虾虎鱼的异名 Cristatogobius albius
- 项冠虾虎鱼 Cristatogobius lophius
- 浅色项冠虾虎鱼 Cristatogobius nonatoae ：又称浅色项冠虾虎鱼。
宽鳃虾虎鱼属（Croilia）
- 裸头宽鳃虾虎鱼 Croilia mossambica
拟丝虾虎鱼属（Cryptocentroides）
- 阿拉伯拟丝虾虎鱼 Cryptocentroides arabicus
- 凤头拟丝虾虎鱼 Cryptocentroides gobioides
- 拟丝虾虎鱼 Cryptocentroides insignis
丝虾虎鱼属（Cryptocentrus）
晶虾虎鱼属（Crystallogobius）
- 线纹晶虾虎鱼 Crystallogobius linearis
- 尼氏晶虾虎鱼 Crystallogobius nilssonii
栉眼虾虎鱼属（Ctenogobiops）
- 斜带栉眼虾虎鱼 Ctenogobiops aurocingulus ：又称黄斑栉虾虎鱼。
- 褐斑栉眼虾虎鱼 Ctenogobiops crocineus ：又称西昔尔栉虾虎鱼。
- 丝棘栉眼虾虎鱼 Ctenogobiops feroculus
- 台湾栉眼虾虎鱼 Ctenogobiops formosa
- 克氏栉眼虾虎鱼 Ctenogobiops klausewitzi
- 班栉眼虾虎鱼 Ctenogobiops maculosus
- 丝鳍栉眼虾虎鱼 Ctenogobiops mitodes
- 点斑栉眼虾虎鱼 Ctenogobiops pomastictus
- 长棘栉眼虾虎鱼 Ctenogobiops tangaroai
栉虾虎鱼属（Ctenogobius）
- 条纹栉虾虎鱼 Ctenogobius fasciatus
- 小尾栉虾虎鱼 Ctenogobius lepturus
- 墨西哥栉虾虎鱼 Ctenogobius manglicola
- 拟纹栉虾虎鱼 Ctenogobius pseudofasciatus
- 箭栉虾虎鱼 Ctenogobius sagittula
- 裸项栉虾虎鱼 ctenogobius gymnauchen
栉孔虾虎鱼属（Ctenotrypauchen）
- 中华栉孔虾虎鱼 Ctenotrypauchen chinensis
- 若江栉孔虾虎鱼 Ctenotrypauchen wakae
三角虾虎鱼属（Deltentosteus）
- 地中海三角虾虎鱼 Deltentosteus colonianus
- 四斑三角虾虎鱼 Deltentosteus quadrimaculatus
皇后虾虎鱼属（Didogobius）
- 地中海皇后虾虎鱼 Didogobius bentuvii
- 高知皇后虾虎鱼 Didogobius kochi
- 施氏皇后虾虎鱼 Didogobius schlieweni
- 斯氏皇后虾虎鱼 Didogobius splechtnai
异翼虾虎鱼属（Discordipinna）
- 格氏异翼虾虎鱼 Discordipinna griessingeri
捷虾虎鱼属（Drombus）
- 圆头捷虾虎鱼 Drombus globiceps
- 哈氏捷虾虎鱼 Drombus halei
- 高体捷虾虎鱼 Drombus key
- 鳞胸捷虾虎鱼 Drombus lepidothorax
- 速泳捷虾虎鱼 Drombus ocyurus
- 长身捷虾虎鱼 Drombus simulus
- 三角捷虾虎鱼 Drombus triangularis
埃博虾虎鱼属（Ebomegobius）
- 埃博虾虎鱼 Ebomegobius goodi
荆虾虎鱼属（Echinogobius）
- 林氏荆虾虎鱼 Echinogobius hayashii
依柯虾虎鱼属（Economidichthys）
- 侏儒依柯虾虎鱼 Economidichthys pygmaeus
- 依柯虾虎鱼 Economidichthys trichonis
伊氏虾虎鱼属（Egglestonichthys）
- 黄蜂伊氏虾虎鱼 Egglestonichthys bombylios
- 黑鳍伊氏虾虎鱼 Egglestonichthys malenoptera
- 南海伊氏虾虎鱼 Egglestonichthys patriciae
大头虾虎鱼属（Ego）
- 横带大头虾虎鱼 Ego zebra
霓虹虾虎鱼属（Elacatinus）
- 黑鼻霓虹虾虎鱼 Elacatinus atronasus
- Elacatinus cayman
- 迪氏霓虹虾虎鱼 Elacatinus digueti
- 金头霓虹虾虎鱼 Elacatinus evelynae 又名黄头霓虹虾虎鱼、美国霓虹虾虎鱼、加勒比清洁虾虎鱼
- 菲格罗霓虹虾虎鱼 Elacatinus figaro
- 格尼氏霓虹虾虎鱼 Elacatinus genie 又名清洁虾虎鱼
- 霍氏霓虹虾虎鱼 Elacatinus horsti 又名金灯虾虎鱼
- 丑霓虹虾虎鱼 Elacatinus inornatus
- 詹氏霓虹虾虎鱼 Elacatinus janssi
- 岛栖霓虹虾虎鱼 Elacatinus nesiotes
- 霓虹虾虎鱼 Elacatinus oceanops 又名蓝灯虾虎鱼
- Elacatinus phthirophagus
- 前唇霓虹虾虎鱼 Elacatinus prochilos
- 墨西哥霓虹虾虎鱼 Elacatinus puncticulatus
- 兰德尔霓虹虾虎鱼 Elacatinus randalli
- 黄吻霓虹虾虎鱼 Elacatinus xanthiprora
鳢虾虎鱼属（Eleotrica）
- 凯氏鳢虾虎鱼 Eleotrica cableae
懒虾虎鱼属（Enypnias）
- 野懒虾虎鱼 Enypnias aceras
- 寡鳞懒虾虎鱼 Enypnias oligolepis
- 半裸懒虾虎鱼 Enypnias seminudus
圆虾虎鱼属（Eucyclogobius）
- 斜口圆虾虎鱼 Eucyclogobius microps
- 真圆虾虎鱼 Eucyclogobius newberryi
带虾虎鱼属（Eutaeniichthys）
- 带虾虎鱼 Eutaeniichthys gilli
埃弗曼虾虎鱼属（Evermannia）
- 伊氏埃弗曼虾虎鱼 Evermannia erici
- 长鳍埃弗曼虾虎鱼 Evermannia longipinnis
- 巴拿马埃弗曼虾虎鱼 Evermannia panamensis
- 尾纹埃弗曼虾虎鱼 Evermannia zosterura
艾虾虎鱼属（Evermannichthys）
- 粗尾艾虾虎鱼 Evermannichthys metzelaari
- 仰鼻艾虾虎鱼 Evermannichthys silus
矶塘鳢属（Eviota）
琴虾虎鱼属（Evorthodus）
- 琴虾虎鱼 Evorthodus lyricus
- 微琴虾虎鱼 Evorthodus minutus
无腹竿虾虎鱼属（Expedio）
- 无腹竿虾虎鱼 Expedio parvulus
鹦虾虎鱼属（Exyrias）
蜂巢虾虎鱼属（Favonigobius）
- 艾丽西亚蜂巢虾虎鱼 Favonigobius aliciae
- 裸项蜂巢虾虎鱼 Favonigobius gymnauchen ：又称裸颈鲨。
- 白条蜂巢虾虎鱼 Favonigobius lateralis
- 雀斑蜂巢虾虎鱼 Favonigobius lentiginosus
- 赖氏蜂巢虾虎鱼 Favonigobius reichei ：又称雷氏鲨。
- 圣蜂巢虾虎鱼 Favonigobius suppositus
费尔虾虎鱼属（Feia）
- 神女费尔虾虎鱼 Feia nympha
角吻虾虎鱼属（Flabelligobius）
- 福氏角吻虾虎鱼 Flabelligobius fourmanoiri
- 西奈半岛角吻虾虎鱼 Flabelligobius latruncularius
植虾虎鱼属（Fusigobius）
也称纺锤虾虎鱼属。
配虾虎鱼属（Gammogobius）
- 斯氏配虾虎鱼 Gammogobius steinitzi
虎虾虎鱼属（Garmannia）
- 虎虾虎鱼 Garmannia macrodon
姬虾虎鱼属（Gillichthys）
- 长颌姬虾虎鱼 Gillichthys mirabilis
- 刺毛姬虾虎鱼 Gillichthys seta
金氏虾虎鱼属（Ginsburgellus）
- 八纹金氏虾虎鱼 Ginsburgellus novemlineatus
盖棘虾虎鱼属（Gladiogobius）
- 剑盖棘虾虎鱼 Gladiogobius ensifer
叉舌虾虎鱼属（Glossogobius）
- 马达加斯加叉舌虾虎鱼 Glossogobius ankaranensis
- 金黄叉舌虾虎鱼 Glossogobius aureus ：又称金叉舌虾虎鱼。
- 贝利叉舌虾虎鱼 Glossogobius bellendenensis
- 双须舌虾虎鱼 Glossogobius bicirrhosus ：又称双须叉舌虾虎鱼。
- 拟背斑舌虾虎鱼 Glossogobius brunnoides ：又称拟背斑叉舌虾虎鱼。
- 布氏叉舌虾虎鱼 Glossogobius bulmeri
- 美丽叉舌虾虎鱼 Glossogobius callidus
- 盘鳍叉舌虾虎鱼 Glossogobius celebius ：又称盘鳍叉舌虾虎鱼。
- 钝吻舌虾虎鱼 Glossogobius circumspectus ：又称横列叉舌虾虎鱼。
- 科特氏舌虾虎鱼 Glossogobius coatesi
- 锥舌虾虎鱼 Glossogobius concavifrons
- 黄鳍舌虾虎鱼 Glossogobius flavipinnis
- 叉舌虾虎鱼 Glossogobius giuris ：又称叉舌虾虎鱼。
- 霍氏舌虾虎鱼 Glossogobius hoesei
- 中间舌虾虎鱼 Glossogobius intermedius
- 科克舌虾虎鱼 Glossogobius kokius
- 库拉高舌虾虎鱼 Glossogobius koragensis
- 马坦舌虾虎鱼 Glossogobius matanensis
- 暗鳍舌虾虎鱼 Glossogobius obscuripinnis ：又称无斑叉舌虾虎鱼。
- 点带叉舌虾虎鱼 Glossogobius olivaceus ：又称点带叉舌虾虎鱼。
- 少乳突舌虾虎鱼 Glossogobius sparsipapillus
- 新几内亚舌虾虎鱼 Glossogobius torrentis
颌鳞虾虎鱼属（Gnatholepis）
- 颌鳞虾虎鱼 Gnatholepis anjerensis ：又称臀斑颌鳞虾虎鱼。
- 捷泳颌鳞虾虎鱼 Gnatholepis baliurus
- 美尾颌鳞虾虎鱼 Gnatholepis calliurus
- 高伦颌鳞虾虎鱼 Gnatholepis cauerensis ：又称高伦颌鳞虾虎鱼。
- 肩斑颌鳞虾虎鱼 Gnatholepis cauerensis cauerensis ：又称肩斑颔鳞虾虎鱼。
- 达澳颌鳞虾虎鱼 Gnatholepis davaoensis
- 臀斑颌鳞虾虎鱼 Gnatholepis deltoides ：又称臀斑颌鳞虾虎鱼。
- 黄点颌鳞虾虎鱼 Gnatholepis inconsequens
- 乃氏颌鳞虾虎鱼 Gnatholepis knighti
- 汤氏颌鳞虾虎鱼 Gnatholepis thompsoni
叶虾虎鱼属（Gobiodon）
犁突虾虎鱼属（Myersina）
- 巴布亚犁突虾虎鱼 Myersina papuanus
似虾虎鱼属（Gobioides）
- 非洲似虾虎鱼 Gobioides africanus
- 短似虾虎鱼 Gobioides brevis
- 勃氏似虾虎鱼 Gobioides broussonnetii
- 格氏似虾虎鱼 Gobioides grahamae
- 秘鲁似虾虎鱼 Gobioides peruanus
- 箭状似虾虎鱼 Gobioides sagitta
小虾虎鱼属（Gobionellus）
- 黑鳍小虾虎鱼 Gobionellus atripinnis
- 梭体小虾虎鱼 Gobionellus boleosoma
- 克氏小虾虎鱼 Gobionellus claytoni
- 普通小虾虎鱼 Gobionellus comma
- 细齿小虾虎鱼 Gobionellus daguae
- 纤小虾虎鱼 Gobionellus gracillimus
- 滑鳞小虾虎鱼 Gobionellus liolepis
- 点鳍小虾虎鱼 Gobionellus manglicola
- 细齿小虾虎鱼 Gobionellus microdon
- 西方小虾虎鱼 Gobionellus occidentalis
- 大洋小虾虎鱼 Gobionellus oceanicus
- 拟纹小虾虎鱼 Gobionellus pseudofasciatus
- 眼带小虾虎鱼 Gobionellus saepepallens
- 箭小虾虎鱼 Gobionellus sagittula
- 舒氏小虾虎鱼 Gobionellus shufeldti
- 宝石小虾虎鱼 Gobionellus smaragdus
- 斑鳍小虾虎鱼 Gobionellus stigmalophius
- 柱头小虾虎鱼 Gobionellus stigmaticus
- 斑尾小虾虎鱼 Gobionellus stigmaturus
- 大口小虾虎鱼 Gobionellus stomatus
髯虾虎鱼属（Gobiopsis）
- 窄体髯虾虎鱼 Gobiopsis angustifrons
- 短须髯虾虎鱼 Gobiopsis aporia
- 砂髯虾虎鱼 Gobiopsis arenaria ：又称砂虾虎鱼。
- 勃氏髯虾虎鱼 Gobiopsis bravoi
- 大口髯虾虎鱼 Gobiopsis macrostoma
- 蛇首髯虾虎鱼 Gobiopsis pinto
- 五带髯虾虎鱼 Gobiopsis quinquecincta
鳍虾虎鱼属（Gobiopterus）
- 短鳍鳍虾虎鱼 Gobiopterus brachypterus
- 鳍虾虎鱼 Gobiopterus chuno
- 大鳞鳍虾虎鱼 Gobiopterus macrolepis
- 明达鳍虾虎鱼 Gobiopterus mindanensis
- 半饰鳍虾虎鱼 Gobiopterus semivestita
𬶋虾虎鱼属（Gobiosoma）
- 薄氏𬶋虾虎鱼 Gobiosoma bosc
- 钱氏𬶋虾虎鱼 Gobiosoma chancei
- 墨西哥𬶋虾虎鱼 Gobiosoma chiquita
- 双鳞𬶋虾虎鱼 Gobiosoma dilepis
- 紧口𬶋虾虎鱼 Gobiosoma etheostoma
- 伊夫林𬶋虾虎鱼 Gobiosoma evelynae
- 八带𬶋虾虎鱼 Gobiosoma gemmatum
- 格尼𬶋虾虎鱼 Gobiosoma genie
- 金氏𬶋虾虎鱼 Gobiosoma ginsburgi
- 格氏𬶋虾虎鱼 Gobiosoma grosvenori
- 希氏𬶋虾虎鱼 Gobiosoma hildebrandi
- 同色𬶋虾虎鱼 Gobiosoma homochroma
- 白线𬶋虾虎鱼 Gobiosoma horsti
- 诱惑𬶋虾虎鱼 Gobiosoma illecebrosum
- 长身𬶋虾虎鱼 Gobiosoma longipala
- 路易莎𬶋虾虎鱼 Gobiosoma louisae
- 大牙𬶋虾虎鱼 Gobiosoma macrodon
- 多带𬶋虾虎鱼 Gobiosoma multifasciatum
- 裸𬶋虾虎鱼 Gobiosoma nudum
- 虹𬶋虾虎鱼 Gobiosoma oceanops
- 柄鳞𬶋虾虎鱼 Gobiosoma pallens
- 副荣𬶋虾虎鱼 Gobiosoma paradoxum
- 壮体𬶋虾虎鱼 Gobiosoma robustum
- 北美𬶋虾虎鱼 Gobiosoma yucatanum
- 细纹𬶋虾虎鱼 Gobiosoma zebrella
虾虎鱼属（Gobius）
- 阿蒂虾虎鱼 Gobius ater
- 黄虾虎鱼 Gobius auratus
- 扁头虾虎鱼 Gobius batrachocephalus
- 布氏虾虎鱼 Gobius bucchichi
- 似鳅虾虎鱼 Gobius cobitis
- 康氏虾虎鱼 Gobius commersonii
- 库氏虾虎鱼 Gobius couchi
- 红嘴虾虎鱼 Gobius cruentatus
- 静𬶋虾虎鱼 Gobius eremius
- 仿虾虎鱼 Gobius fallax
- 河虾虎鱼 Gobius fluviatilis
- 加氏虾虎鱼 Gobius gasteveni
- 细虾虎鱼 Gobius geniporus
- 赫氏虾虎鱼 Gobius haackei
- 高体虾虎鱼 Gobius hypselosoma
- 红海虾虎鱼 Gobius koseirensis
- 印度虾虎鱼 Gobius kurpah
- 黑白虾虎鱼 Gobius leucomelas
- 泥栖虾虎鱼 Gobius luteus
- 黑虾虎鱼 Gobius niger
- 蛇头虾虎鱼 Gobius ophiocephalus
- 石虾虎鱼 Gobius paganellus
- 朗氏虾虎鱼 Gobius roulei
- 红斑虾虎鱼 Gobius rubropunctatus
- 二点虾虎鱼 Gobius ruthenspari
- 斯氏虾虎鱼 Gobius scorteccii
- 塞内加尔虾虎鱼 Gobius senegambiensis
- 真虾虎鱼 Gobius similis
- 缚虾虎鱼 Gobius strictus
- 似虎虾虎鱼 Gobius tigrellus
- 热带虾虎鱼 Gobius tropicus
- 黑鳍虾虎鱼 Gobius villosus
- 条纹虾虎鱼 Gobius vittatus
- 黄头虾虎鱼 Gobius xanthocephalus
尻虾虎鱼属（Gobiusculus）
- 黄体尻虾虎鱼 Gobiusculus flavescens
暗背虾虎鱼属（Gobulus）
- 暗背虾虎鱼 Gobulus crescentalis
- 汉氏暗背虾虎鱼 Gobulus hancocki
- 迈氏暗背虾虎鱼 Gobulus myersi
戈罗虾虎鱼属（Gorogobius）
- 黑带戈罗虾虎鱼 Gorogobius nigricinctus
裸身塘鳢属（Gymneleotris）
- 半裸身塘鳢 Gymneleotris seminudus
裸身虾虎鱼属（Gymnogobius）
- 邦奇氏裸身虾虎鱼 Gymnogobius bungei
- 黑皮裸身虾虎鱼 Gymnogobius nigrimembranis
- 黑翅裸身虾虎鱼 Gymnogobius nigripinnis
- 蛙裸身虾虎鱼 Gymnogobius raninus
粗棘虾虎鱼属（Hazeus）
- 大泷粗棘虾虎鱼 Hazeus otakii
- 单鳞粗棘虾虎鱼 Hazeus unisquamus
半虾虎鱼属（Hemigobius）
- 厚半虾虎鱼 Hemigobius crassa
- 斜纹半虾虎鱼 Hemigobius hoevenii）：又称霍氏间虾虎鱼。
异塘鳢属（Hetereleotris）
- 无孔异塘鳢 Hetereleotris apora
- 双斑异塘鳢 Hetereleotris bipunctata
- 半带异塘鳢 Hetereleotris caminata
- 红海异塘鳢 Hetereleotris diademata
- 凯尼异塘鳢 Hetereleotris kenyae
- 光鳞异塘鳢 Hetereleotris margaretae
- 云纹异塘鳢 Hetereleotris nebulofasciata
- 杂色异塘鳢 Hetereleotris poecila
- 触手异塘鳢 Hetereleotris tentaculata
- 文森氏异塘鳢 Hetereleotris vinsoni
- 普异塘鳢 Hetereleotris vulgaris
- 桑给巴尔异塘鳢 Hetereleotris zanzibarensis
- 眼带异塘鳢 Hetereleotris zonata
异刺盖虾虎鱼属（Heteroplopomus）
- 细须异刺盖虾虎鱼 Heteroplopomus barbatus
豚虾虎鱼属（Hyrcanogobius）
- 伯氏豚虾虎鱼 Hyrcanogobius bergi
泞虾虎鱼属（Ilypnus）
- 斑颊泞虾虎鱼 Ilypnus gilberti
- 灿泞虾虎鱼 Ilypnus luculentus
犬竿虾虎鱼属（Inu）
- 大头犬竿虾虎鱼 Inu ama
衔虾虎鱼属（Istigobius）
- 康培氏衔虾虎鱼 Istigobius campbelli ：又称康培氏衔虾虎鱼。
- 华丽衔虾虎鱼 Istigobius decoratus
- 印度衔虾虎鱼 Istigobius diadema
- 戈氏衔虾虎鱼 Istigobius goldmanni
- 豪氏衔虾虎鱼 Istigobius hoesei
- 和歌衔虾虎鱼 Istigobius hoshinonis
- 黑点衔虾虎鱼 Istigobius nigroocellatus
- 妆饰衔虾虎鱼 Istigobius ornatus
- 桔黄衔虾虎鱼 Istigobius perspicillatus
- 线斑衔虾虎鱼 Istigobius rigilius
- 珠点衔虾虎鱼 Istigobius spence
黏虾虎鱼属（Kelloggella）
- 萨摩阿黏虾虎鱼 Kelloggella cardinalis
- 多斑黏虾虎鱼 Kelloggella centralis
- 寡鳞黏虾虎鱼 Kelloggella oligolepis
- 多带黏虾虎鱼 Kelloggella quindecimfasciata
- 叉牙黏虾虎鱼 Kelloggella tricuspidata
奈波虾虎鱼属（Knipowitschia）
- 高加索奈波虾虎鱼 Knipowitschia caucasica
- 埃氏奈波虾虎鱼 Knipowitschia ephesi
- 戈氏奈波虾虎鱼 Knipowitschia goerneri
- 伊氏奈波虾虎鱼 Knipowitschia iljini
- 长尾奈波虾虎鱼 Knipowitschia longecaudata
- 马尔马拉湖奈波虾虎鱼 Knipowitschia mermere
- 米氏奈波虾虎鱼 Knipowitschia milleri
- 帕氏奈波虾虎鱼 Knipowitschia panizzae
- 斑点奈波虾虎鱼 Knipowitschia punctatissimus
- 萨沙奈波虾虎鱼 Knipowitschia thessala
库曼虾虎鱼属（Koumansetta）
- 赫氏库曼虾虎鱼 Koumansetta hectori ：又称海氏钝鲨。
- 雷氏库曼虾虎鱼 Koumansetta rainfordi ：又称雷氏钝鲨。
壶虾虎鱼属（Lebetus）
- 吉氏壶虾虎鱼 Lebetus guilleti
- 似鲉壶虾虎鱼 Lebetus scorpioides
韧虾虎鱼属（Lentipes）
- 韧虾虎鱼 Lentipes armatus
- 巴氏韧虾虎鱼 Lentipes bustamantaei
- 同色韧虾虎鱼 Lentipes concolor
- 马贵斯群岛韧虾虎鱼 Lentipes rubrofasciatus
- 沃森氏韧虾虎鱼 Lentipes watsoni
- 惠氏韧虾虎鱼 Lentipes whittenorum
鳞虾虎鱼属（Lepidogobius）
- 美鳞虾虎鱼 Lepidogobius lepidus
莱苏尔虾虎鱼属（Lesueurigobius）
- 东大西洋莱苏尔虾虎鱼 Lesueurigobius friesii
- 异带莱苏尔虾虎鱼 Lesueurigobius heterofasciatus
- 孔氏莱苏虾虎鱼 Lesueurigobius kuomansi
- 桑氏莱苏尔虾虎鱼 Lesueurigobius sanzoi
- 地中海莱苏尔虾虎鱼 Lesueurigobius suerii
遗虾虎鱼属（Lethops）
- 遗虾虎鱼 Lethops connectens
冰虾虎鱼属（Leucopsarion）
- 彼氏冰虾虎鱼 Leucopsarion petersii
梭虾虎鱼属（Lizagobius）
- 高氏梭虾虎鱼 Lizagobius galwayi
裂虾虎鱼属（Lobulogobius）
- 侧扁裂虾虎鱼 Lobulogobius morrigu
- 阿曼裂虾虎鱼 Lobulogobius omanensis
蝌蚪虾虎鱼属（Lophiogobius）
- 布氏蝌蚪虾虎鱼 Lophiogobius bleekeri
- 睛尾蝌蚪虾虎鱼 Lophiogobius ocellicauda
冠虾虎鱼属（Lophogobius）
- 冠虾虎鱼 Lophogobius cristulatus
- 鲤形冠虾虎鱼 Lophogobius cyprinoides
白头虾虎鱼属（Lotilia）
- 白头虾虎鱼 Lotilia graciliosa
裸叶虾虎鱼属（Lubricogobius）
竿虾虎鱼属（Luciogobius）
- 日本竿虾虎鱼 Luciogobius adapel
- 白竿虾虎鱼 Luciogobius albus
- 长头竿虾虎鱼 Luciogobius dormitoris
- 长竿虾虎鱼 Luciogobius elongatus
- 鳍丝竿虾虎鱼 Luciogobius grandis
- 斑点竿虾虎鱼 Luciogobius guttatus ：又称斑点竿鲨。
- 鳞竿虾虎鱼 Luciogobius koma
- 浅色竿虾虎鱼 Luciogobius pallidus
- 小竿虾虎鱼 Luciogobius parvulus
- 平头竿虾虎鱼 Luciogobius platycephalus
- 西海竿虾虎鱼 Luciogobius saikaiensis ：又称西海竿鲨。
狼牙双盘虾虎鱼属（Luposicya）
- 狼牙双盘虾虎鱼 Luposicya lupus
血虾虎鱼属（Lythrypnus）
- 高体血虾虎鱼 Lythrypnus alphigena
- 哥斯达黎加血虾虎鱼 Lythrypnus cobalus
- 大鳄血虾虎鱼 Lythrypnus crocodilus
- 蓝带血虾虎鱼 Lythrypnus dalli
- 侏儒血虾虎鱼 Lythrypnus elasson
- 吉氏血虾虎鱼 Lythrypnus gilberti
- 橙带血虾虎鱼 Lythrypnus heterochroma
- 岛栖血虾虎鱼 Lythrypnus insularis
- 拉氏血虾虎鱼 Lythrypnus lavenbergi
- 莫氏血虾虎鱼 Lythrypnus mowbrayi
- 横带血虾虎鱼 Lythrypnus nesiotes
- 五带血虾虎鱼 Lythrypnus okapia
- 斑血虾虎鱼 Lythrypnus phorellus
- 美丽血虾虎鱼 Lythrypnus pulchellus
- 闪光血虾虎鱼 Lythrypnus rhizophora
- 哥伦比亚血虾虎鱼 Lythrypnus solanensis
- 胸斑血虾虎鱼 Lythrypnus spilus
- 斑马血虾虎鱼 Lythrypnus zebra
壮牙虾虎鱼属（Macrodontogobius）
- 威氏壮牙虾虎鱼 Macrodontogobius wilburi
巨颌虾虎鱼属（Mahidolia）
- 大口巨颌虾虎鱼 Mahidolia mystacina ：又称帆鳍虾虎鱼。
芒虾虎鱼属（Mangarinus）
- 芒虾虎鱼 Mangarinus waterousi
Marcelogobius Schliewen, 2023：[4]
- Peter helenae
- Peter janetarum
- Peter splechtnai
矇眬虾虎鱼属（Mauligobius）
- 大颌矇眬虾虎鱼 Mauligobius maderensis
- 尼氏矇眬虾虎鱼 Mauligobius nigri
中虾虎鱼属（Mesogobius）
- 蟾头中虾虎鱼 Mesogobius batrachocephalus
- 黑背中虾虎鱼 Mesogobius nigronotatus
- 里海中虾虎鱼 Mesogobius nonultimus
侏虾虎鱼属（Microgobius）
米勒虾虎鱼属（Millerigobius）
- 大头米勒虾虎鱼 Millerigobius macrocephalus
神秘虾虎鱼属（Mistichthys）
- 吕宋神秘虾虎鱼 Mistichthys luzonensis
肩孔虾虎鱼属（Monishia）
- 红海肩孔虾虎鱼 Monishia ochetica
- 裸鳍肩孔虾虎鱼 Monishia william
鲻虾虎鱼属（Mugilogobius）
犁突虾虎鱼属（Myersina）
线鳍虾虎鱼属（Nematogobius）
- 线鳍虾虎鱼 Nematogobius ansorgii
- 短线鳍虾虎鱼 Nematogobius brachynemus
- 梅氏线鳍虾虎鱼 Nematogobius maindroni
新虾虎鱼属（Neogobius）
- 深水新虾虎鱼 Neogobius bathybius
- 博氏新虾虎鱼 Neogobius bogdanowi
- 里海新虾虎鱼 Neogobius caspius
- 库拉河新虾虎鱼 Neogobius cyrius
- 乳新虾虎鱼 Neogobius fluviatilis
- 裸喉新虾虎鱼 Neogobius gymnotrachelus
- 大头新虾虎鱼 Neogobius kessleri
- 黑口新虾虎鱼 Neogobius melanostomus
- 罗氏新虾虎鱼 Neogobius rhodioni
尼斯裸虾虎鱼属（Nes）
- 丝鳍尼斯裸虾虎鱼 Nes longus
岛虾虎鱼属（Nesogobius）
- 欣氏岛虾虎鱼 Nesogobius hinsbyi
- 美丽岛虾虎鱼 Nesogobius pulchellus
裸拟虾虎鱼属（Nudagobioides）
- 南氏裸拟虾虎鱼 Nudagobioides nankaii
歪虾虎鱼属（Obliquogobius）
- 印度歪虾虎鱼 Obliquogobius cometes
- Obliquogobius eptactis Fujiwara, Psomadakis, Swe & Motomura, 2021[5]
- 特氏歪虾虎鱼 Obliquogobius turkayi
地中海虾虎鱼属（Odondebuenia）
- 地中海虾虎鱼 Odondebuenia balearica
狼牙虾虎鱼属（Odontamblyopus）
- 红狼牙虾虎鱼 Odontamblyopus lacepedii ：又称盲条鱼。
寡鳞虾虎鱼属（Oligolepis）
蛇头虾虎鱼属（Ophiogobius）
- 詹氏蛇头虾虎鱼 Ophiogobius jenynsi
- 蛇头虾虎鱼 Ophiogobius ophicephalus
拟刺盖虾虎鱼属（Oplopomops）
- 双棘拟刺盖虾虎鱼 Oplopomops diacanthus
刺盖虾虎鱼属（Oplopomus）
- 刺盖虾虎鱼 Oplopomus oplopomus ：又称盖刺虾虎鱼。
妙音虾虎鱼属（Opua）
- 莫桑比克妙音虾虎鱼 Opua atherinoides
- 红海妙音虾虎鱼 Opua elati
- 斑鳍妙音虾虎鱼 Opua maculipinna
- 妙音虾虎鱼 Opua nephodes
背眼虾虎鱼属（Oxuderces）
- 犬齿背眼虾虎鱼 Oxuderces dentatus
- 沃氏背眼虾虎鱼 Oxuderces wirzi
沟虾虎鱼属（Oxyurichthys）
帕多虾虎鱼属（Padogobius）
- 马氏帕多虾虎鱼 Padogobius martensii
- 意大利帕多虾虎鱼 Padogobius nigricans
犁虾虎鱼属（Palatogobius）
- Palatogobius incendius Tornabene, Robertson & Baldwin, 2017[6]
- 犁虾虎鱼 Palatogobius paradoxus
苔虾虎鱼属（Palutrus）
- 苔虾虎鱼 Palutrus pruniosus
- 肩斑深虾虎鱼 Palutrus scapulopunctatus
矮虾虎鱼属（Pandaka）
- 莱氏矮虾虎鱼 Pandaka lidwilli
- 矮虾虎鱼 Pandaka pygmaea
- 路氏矮虾虎鱼 Pandaka rouxi
- 裸头矮虾虎鱼 Pandaka silvana
- 三斑矮虾虎鱼 Pandaka trimaculata
乳突虾虎鱼属（Papillogobius）
- 澳洲乳突虾虎鱼 Papillogobius exquisitus
- 黑鳃乳突虾虎鱼 Papillogobius melanobranchus
- 斑纹乳突虾虎鱼 Papillogobius punctatus
- 乳突虾虎鱼 Papillogobius reichei ：又称雷氏鲨。
拟矛尾虾虎鱼属（Parachaeturichthys）
副叶虾虎鱼属（Paragobiodon）
副平牙虾虎鱼属（Parapocryptes）
- 大鳞副平牙虾虎鱼 Parapocryptes macrolepis
- 长尾副平牙虾虎鱼 Parapocryptes rictuosus
- 蜥形副平牙虾虎鱼 Parapocryptes serperaster
副孔虾虎鱼属（Paratrypauchen）
- 小头副孔虾虎鱼 Paratrypauchen microcephalus ：又称栉赤鲨。
副阿胡虾虎鱼属（Parawaous）
- 大头副阿胡虾虎鱼 Parawaous megacephalus
拟沙虾虎鱼属（Parkraemeria）
- 拟沙虾虎鱼 Parkraemeria ornata
麦虾虎鱼属（Parrella）
- 棕色麦虾虎鱼 Parrella fusca
- 金氏麦虾虎鱼 Parrella ginsburgi
- 卢氏麦虾虎鱼 Parrella lucretiae
- 大颌麦虾虎鱼 Parrella maxillaris
齿弹涂鱼属（Periophthalmodon）
- 裸峡齿弹涂鱼 Periophthalmodon freycineti
- 许氏齿弹涂鱼 Periophthalmodon schlosseri
- 鳞峡齿弹涂鱼 Periophthalmodon septemradiatus
弹涂鱼属（Periophthalmus）
Peter Schliewen, 2023：[4]
- Peter amicuscaridis
- Peter wirtzi
叶状虾虎鱼属（Phyllogobius）
- 平头叶状虾虎鱼 Phyllogobius platycephalops
扁眼虾虎鱼属（Platygobiopsis）
- 明仁扁眼虾虎鱼 Platygobiopsis akihito
腹瓢虾虎鱼属（Pleurosicya）
须虾虎鱼属（Pogonogobius）
- 须虾虎鱼 Pogonogobius planifrons
多椎虾虎鱼属（Polyspondylogobius）
- 中华多椎虾虎鱼 Polyspondylogobius sinensis
长臀虾虎鱼属（Pomatoschistus）
- 巴氏长臀虾虎鱼 Pomatoschistus bathi
- 密点长臀虾虎鱼 Pomatoschistus canestrinii
- 尼氏长臀虾虎鱼 Pomatoschistus knerii
- 洛氏长臀虾虎鱼 Pomatoschistus lozanoi
- 云斑长臀虾虎鱼 Pomatoschistus marmoratus
- 小眼长臀虾虎鱼 Pomatoschistus microps
- 小长臀虾虎鱼 Pomatoschistus minutus
- 长臀虾虎鱼 Pomatoschistus norvegicus
- 大眼长臀虾虎鱼 Pomatoschistus pictus
- 夸氏长臀虾虎鱼 Pomatoschistus quagga
- 托氏长臀虾虎鱼 Pomatoschistus tortonesei
犀孔虾虎鱼属（Porogobius）
- 施氏犀孔虾虎鱼 Porogobius schlegelii
锯鳞虾虎鱼属（Priolepis）
原吻虾虎鱼属（Proterorhinus）
- 云斑原吻虾虎鱼 Proterorhinus marmoratus
- 半透明原吻虾虎鱼 Proterorhinus semipellucidus
砂虾虎鱼属（Psammogobius）
拟玻璃虾虎鱼属（Pseudaphya）
- 拟玻璃虾虎鱼 Pseudaphya ferreri
拟平牙虾虎鱼属（Pseudapocryptes）
- 婆罗洲拟平牙虾虎鱼 Pseudapocryptes borneensis
- 长身拟平牙虾虎鱼 Pseudapocryptes elongatus
拟叶虾虎鱼属（Pseudogobiodon）
- 大鳍拟叶虾虎鱼 Pseudogobiodon macrochir
拟髯虾虎鱼属（Pseudogobiopsis）
- Pseudogobiopsis lumbantobing Larson, Hadiaty & Hubert, 2017 [8]
- 少鳞拟髯虾虎鱼 Pseudogobiopsis oligactis
- 似虎拟髯虾虎鱼 Pseudogobiopsis tigrellus
拟虾虎鱼属（Pseudogobius）
- 大眼拟虾虎鱼 Pseudogobius avicennia
- 等颌拟虾虎鱼 Pseudogobius isognathus
- 爪哇拟虾虎鱼 Pseudogobius javanicus
- 小口拟虾虎鱼 Pseudogobius masago ：又称小拟虾虎鱼。
- 天鹅拟虾虎鱼 Pseudogobius olorum
- 奥氏拟虾虎鱼 Pseudogobius oratai
拟吻虾虎鱼属（Pseudorhinogobius）
- 无孔拟吻虾虎鱼 Pseudorhinogobius aporus
裸滑虾虎鱼属（Psilogobius）
- 梅氏裸滑虾虎鱼 Psilogobius mainlandi
- 条腹裸滑虾虎鱼 Psilogobius prolatus
裸滑塘鳢属（Psilotris）
- 六带裸滑塘鳢 Psilotris alepis Ginsburg, 1953
- 似蟾裸滑塘鳢 Psilotris batrachodes
- 贝氏裸滑塘鳢 Psilotris boehlkei Greenfield, 1993
- 高棘裸滑塘鳢 Psilotris celsus Böhlke, 1963
- 考氏裸滑塘鳢 Psilotris kaufmani Greenfield, Findley & Johnson, 1993
- Psilotris laetarii Van Tassell & Young, 2016
- Psilotris laurae Van Tassell, Tornabene & Baldwin, 2016[9]
- Psilotris vantasselli Tornabene & Baldwin, 2019
高鳍虾虎鱼属（Pterogobius）
- 蛇首高鳍虾虎鱼 Pterogobius elapoides
- 纵带高鳍虾虎鱼 Pterogobius virgo
- 五带高鳍虾虎鱼 Pterogobius zacalles
- 白带高鳍虾虎鱼 Pterogobius zonoleucus
半鳞虾虎鱼属（Pycnomma）
- 半鳞虾虎鱼 Pycnomma semisquamatum
静虾虎鱼属（Quietula）
- 瓜氏静虾虎鱼 Quietula guaymasiae (Jenkins & Evermann, 1889)
- 静虾虎鱼 Quietula y-cauda (Jenkins & Evermann, 1889)
雷虾虎鱼属（Redigobius）
吻虾虎鱼属（Rhingobius）
- 带颊吻虾虎鱼 Rhingobius taenigena
鲯虾虎鱼属（Rhinogobiops）
- 蓝点鲯虾虎鱼 Rhinogobiops nicholsii (Bean, 1882)
吻虾虎鱼属（Rhinogobius）
獠牙虾虎鱼属（Risor）
- 小口獠牙虾虎鱼 Risor ruber (Rosén, 1911)
相模虾虎鱼属（Sagamia）
- 相模虾虎鱼 Sagamia geneionema (Hilgendorf, 1879)
青弹涂鱼属（Scartelaos）
裂身虾虎鱼属（Schismatogobius）
- Schismatogobius alleni Keith, Lord & Larson, 2017
- 宽带裂身虾虎鱼 Schismatogobius ampluvinculus Chen, Shao & Fang, 1995：又称宽带裸身虾虎鱼。
- Schismatogobius arscuttoli Keith, Lord & Hubert, 2017
- Schismatogobius baitabag Keith, Lord & Larson, 2017
- 勃氏裂身虾虎鱼 Schismatogobius bruynisi de Beaufort, 1912
- Schismatogobius bussoni Keith, Hubert, Limmon & Darhuddin, 2017
- 德氏裂身虾虎鱼 Schismatogobius deraniyagalai Kottelat & Pethiyagoda, 1989
- Schismatogobius essi Keith, Lord & Larson, 2017
- Schismatogobius fuligimentus Chen, Séret, Pöllabauer & Shao, 2001
- Schismatogobius hoesei Keith, Lord & Larson, 2017
- 裂身虾虎鱼 Schismatogobius insignus (Herre, 1927)
- 斑纹裂身虾虎鱼 Schismatogobius marmoratus (Peters, 1868)
- Schismatogobius mondo Keith, Lord & Larson, 2017
- 忍者裂身虾虎鱼 Schismatogobius ninja Maeda, Saeki & Satoh, 2017[10]
- Schismatogobius pallidus (Herre, 1934)
- Schismatogobius risdawatiae Keith, Darhuddin, Sukmono & Hubert, 2017
- 罗氏裂身虾虎鱼 Schismatogobius roxasi Herre, 1936：又称罗氏裸身虾虎鱼。
- Schismatogobius sapoliensis Keith, Darhuddin, Limmon & Hubert, 2018
- Schismatogobius saurii Keith, Lord, Hadiaty & Hubert, 2017
- Schismatogobius tiola Keith, Lord & Larson, 2017
- Schismatogobius tuimanua Keith, Lord & Larson, 2017
- Schismatogobius vanuatuensis Keith, Marquet & Watson, 2004
- Schismatogobius vitiensis Jenkins & Boseto, 2005
辛氏微体鱼属（Schindleria）
也称辛氏鳚属。
瓢虾虎鱼属（Sicydium）
- 隐瓢虾虎鱼 Sicydium adelum
- 哥斯达黎加瓢虾虎鱼 Sicydium altum
- 巴巴多斯瓢虾虎鱼 Sicydium antillarum
- 短瓢虾虎鱼 Sicydium brevifile
- 巴斯瓢虾虎鱼 Sicydium bustamantei
- 科科斯岛瓢虾虎鱼 Sicydium cocoensis
- 锯唇瓢虾虎鱼 Sicydium crenilabrum
- 费伊氏瓢虾虎鱼 Sicydium fayae
- 裸腹瓢虾虎鱼 Sicydium gymnogaster
- 希氏瓢虾虎鱼 Sicydium hildebrandi
- 多斑瓢虾虎鱼 Sicydium multipunctatum
- 皮氏瓢虾虎鱼 Sicydium pittieri
- 瓢虾虎鱼 Sicydium plumieri
- 细斑瓢虾虎鱼 Sicydium punctatum
- 萨氏瓢虾虎鱼 Sicydium salvini
- 黄带黄爪虾虎鱼 Sicydium zosterophorum
瓢鳍虾虎鱼属（Sicyopterus）
瓢眼虾虎鱼属（Sicyopus）
显色虾虎鱼属（Signnigobius）
- 双斑显色虾虎鱼 Signnigobius biocellatus
扁头虾虎鱼属（Silhouettea）
- 红海扁头虾虎鱼 Silhouettea aegyptia
- 钱氏扁头虾虎鱼 Silhouettea chaimi
- 道津扁头虾虎鱼 Silhouettea dotui
- 软扁头虾虎鱼 Silhouettea evanida
- 霍氏扁头虾虎鱼 Silhouettea hoesei
- 印度扁头虾虎鱼 Silhouettea indicus
- 南方扁头虾虎鱼 Silhouettea insinuans
- 项斑扁头虾虎鱼 Silhouettea nuchipunctatus
- 丝鳍扁头虾虎鱼 Silhouettea sibayi
眶管虾虎鱼属（Siphonogobius）
- 眶管虾虎鱼 Siphonogobius nue Shibukawa & Iwata, 1998
岩穴虾虎鱼属（Speleogobius）
- 似红岩穴虾虎鱼 Speleogobius trigloides Zander & Jelinek, 1976
狭虾虎鱼属（Stenogobius）
点虾虎鱼属（Stigmatogobius）
- 布氏点虾虎鱼 Stigmatogobius brocki
- 霍氏点虾虎鱼 Stigmatogobius hoevenii
- 微点虾虎鱼 Stigmatogobius minima
- 印尼点虾虎鱼 Stigmatogobius poicilosoma
- 班鳍点虾虎鱼 Stigmatogobius sadanundio 又名印度点虾虎鱼。
枝牙虾虎鱼属（Stiphodon）
连膜虾虎鱼属（Stonogobiops）
- 横带连膜虾虎鱼 Stonogobiops dracula
- 拉森氏连膜虾虎鱼 Stonogobiops larsonae
- 中间连膜虾虎鱼 Stonogobiops medon
- 丝鳍连膜虾虎鱼 Stonogobiops nematodes
- 五带连膜虾虎鱼 Stonogobiops pentafasciata
- 黄吻连膜虾虎鱼 Stonogobiops xanthorhinica
- 红带连膜虾虎鱼 Stonogobiops yasha
猪虾虎鱼属（Sueviota）
- 围鼻猪虾虎鱼 Sueviota atrinasa
- Sueviota bryozophila Allen, Erdmann & Cahyani, 2016 [11]
- 橙色猪虾虎鱼 Sueviota lachneri
- 拉氏猪虾虎鱼 Sueviota larsonae
多棘虾虎鱼属（Sufflogobius）
- 双须多棘虾虎鱼 Sufflogobius bibarbatus
骏河虾虎鱼属（Suruga）
- 底栖骏河虾虎鱼 Suruga fundicola
复虾虎鱼属（Synechogobius）
- 斑尾复虾虎鱼 Synechogobius ommaturus
鳗虾虎鱼属（Taenioides）
- 鳗虾虎鱼 Taenioides anguillaris ：又称鳗形灰盲条鱼。
- 布氏鳗虾虎鱼 Taenioides buchanani
- 须鳗虾虎鱼 Taenioides cirratus ：又称灰盲条鱼。
- 大牙鳗虾虎鱼 Taenioides esquivel
- 细鳗虾虎鱼 Taenioides gracilis
- 杰氏鳗虾虎鱼 Taenioides jacksoni
- 等颌鳗虾虎鱼 Taenioides limicola ：又称等颌灰盲条鱼。
- 黑缘鳗虾虎鱼 Taenioides nigrimarginatus
纹唇毛背鱼属（Taeniolabrus）
- 印度纹唇毛背鱼 Taeniolabrus cyclograptus
塔斯曼虾虎鱼属（Tasmanogobius）
- 格氏塔斯曼虾虎鱼 Tasmanogobius gloveri
- 拉氏塔斯曼虾虎鱼 Tasmanogobius lasti
- 洛氏塔斯曼虾虎鱼 Tasmanogobius lordi
吸虾虎鱼属（Tenacigobius）
- 野吸虾虎鱼 Tenacigobius ridens
猛虾虎鱼属（Thorogobius）
- 安哥拉猛虾虎鱼 Thorogobius angolensis
- 猛虾虎鱼 Thorogobius ephippiatus
- 大鳞猛虾虎鱼 Thorogobius macrolepis
- 罗氏猛虾虎鱼 Thorogobius rofeni
富山虾虎鱼属（Tomiyamichthys）
缟虾虎鱼属（Tridentiger）
磨塘鳢属（Trimma）
微虾虎鱼属（Trimmatom）
- 红带微虾虎鱼 Trimmatom eviotops
- 大足微虾虎鱼 Trimmatom macropodus
- 微虾虎鱼 Trimmatom nanus
- 查戈斯岛微虾虎鱼 Trimmatom offucius
- 鞍微虾虎鱼 Trimmatom sagma
- 大堡礁微虾虎鱼 Trimmatom zapotes
孔虾虎鱼属（Trypauchen）
塔库虾虎鱼属（Tukugobius）
- 菲律宾塔库虾虎鱼 Tukugobius philippinus
泥虾虎鱼属（Tyntlastes）
- 泥虾虎鱼 Tyntlastes sagitta
加州盲虾虎鱼属（Typhlogobius）
- 加州盲虾虎鱼 Typhlogobius californiensis
凡塘鳢属（Valenciennea）
梵虾虎鱼属（Vanderhorstia）
范尼虾虎鱼属（Vanneaugobius）
- 大眼范尼虾虎鱼 Vanneaugobius canariensis
- 多氏范尼虾虎鱼 Vanneaugobius dollfusi
- 普氏范尼虾虎鱼 Vanneaugobius pruvoti
管虾虎鱼属（Varicus）
- 管虾虎鱼 Varicus bucca
- Varicus lacerta Tornabene, Robertson & Baldwin, 2016[12]
- 玛里琳管虾虎鱼 Varicus marilynae
韦氏虾虎鱼属（Weberogobius）
- 阿马韦氏虾虎鱼 Weberogobius amadi (Weber, 1913)
惠勒虾虎鱼属（Wheelerigobius）
- 马氏惠勒虾虎鱼 Wheelerigobius maltzani
- 沃氏惠勒虾虎鱼 Wheelerigobius wirtzi
裸颊虾虎鱼属（Yongeichthys）
- 云斑裸颊虾虎鱼 Yongeichthys criniger
- 云纹裸颊虾虎鱼 Yongeichthys nebulosus ：又称云纹虾虎鱼。
- 汤氏裸颊虾虎鱼 Yongeichthys thomasi
- 印度裸颊虾虎鱼 Yongeichthys tuticorinensis
柴帕钝牙虾虎鱼属（Zappa）
- 柴帕钝牙虾虎鱼 Zappa confluentus (Roberts, 1978)
真斑马虾虎鱼属（Zebrus）
- 真斑马虾虎鱼 Zebrus zebrus (Risso, 1827)
参考文献
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