以下分支圖來自澤維科夫與雅各（2020年）的分析，顯示了本屬在大眼魚龍科中可能的系統發育位置。[4]
| 大眼魚龍類 Ophthalmosauria
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| 大眼魚龍亞科 Ophthalmosaurinae
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密接實泳魚龍 Acamptonectes densus
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尼氏真加魚龍 Gengasaurus nicosiai
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亞氏小鰭魚龍 Nannopterygius yasykovi
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包齒小鰭魚龍 Nannopterygius enthekiodon
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薩茹列夫小鰭魚龍 Nannopterygius saveljeviensis
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北方小鰭魚龍 Nannopterygius borealis
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伏爾加關節鰭魚龍 Arthropterygius volgensis
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隆氏關節鰭魚龍 Arthropterygius lundi
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南海關節鰭魚龍 Arthropterygius thalassonotus
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霍氏關節鰭魚龍 Arthropterygius hoybergeti
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克氏關節鰭魚龍 Arthropterygius chrisorum
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| 扁鰭魚龍亞科 Platypterygiinae
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極端短鰭魚龍 Brachypterygius extremus
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細椎阿戈爾魚龍 Aegirosaurus leptospondylus
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垂直穆伊斯卡魚龍 Muiscasaurus catheti
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星紋列寧魚龍 Leninia stellans
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獨特巧泳魚龍 Sveltonectes insolitus
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油砂礦阿薩巴斯卡魚龍 Athabascasaurus bitumineus
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美洲扁鰭魚龍 Platypterygius americanus
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卡氏水魚龍 Acuetzpalin carranzai
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薩奇卡扁鰭魚龍 Platypterygius sachicarum
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波氏礁靈魚龍 Caypullisaurus bonapartei
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南方扁鰭魚龍 Platypterygius australis
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貝登普盧托尼亞魚龍 Plutoniosaurus bedengensis
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比氏辛比爾斯克魚龍 Simbirskiasaurus birjukovi
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哈茨山扁鰭魚龍 Platypterygius hercynicus
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西氏錫斯特龍魚龍 Sisteronia seeleyi
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平趾扁鰭魚龍 Platypterygius platydactylus
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林氏慈母椎龍 Maiaspondylus lindoei
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