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非蛋白胺基酸是生物化學上指在蛋白質內找不到(例如:肉碱、GABA和L-DOPA),或沒有被標準遺傳密碼編碼的其他胺基酸。
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儘管在合成蛋白質時只會用到21種胺基酸(真核細胞只會用20種[note 1]),事實上目前已經知道還有另外超過300種的天然胺基酸,而相信窮盡所有組合,這數目可以數以千計[1]。 在所有的非蛋白胺基酸當中,有部份較為值得注意,因為下列各種原因:
在技術上,任何具有胺(-NH2)和羧酸(-COOH)官能團的有機化合物都是氨基酸。 蛋白胺基酸是該組的一小部分,具有帶有一個氨基,一個羧基,一個侧链和一個α-氫左旋構象的中心碳原子(α-或2-),甘氨酸除外, 非胺基和脯氨酸,其胺基是仲胺,因此由於傳統原因通常被稱為亞氨基酸,儘管不是亞氨基。
遺傳密碼編碼20種標準氨基酸,用於在翻譯過程中摻入蛋白質中。 然而,有兩種額外的蛋白質氨基酸:硒代半胱胺酸和吡咯離胺酸。 這些非標準氨基酸不具有專用密碼子,但是當存在特定序列時,加入代替終止密碼子,硒代半胱胺酸的UGA密碼子和SECIS元件[2],吡咯赖氨酸的UAG PYLIS下游序列[3]。 所有其他氨基酸被稱為“非蛋白原性”。
有各種氨基酸組[4]:
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