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酶学委员会编号

化学编号方案,并赋予酶的层次分类鉴定号码,识别其酶类家族成员 来自维基百科,自由的百科全书

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酶学委员会编号酶编号(英語:Enzyme Commission number),简称EC编号EC号EC number),是一种基于催化化学反应而制定数字分类方案。[1]作为酶命名法 / 酶学委员会命名法enzyme nomenclature)系统,[2]同時會為各種酶給予一個建議的名稱,且每个EC编号都与相应酶催化反应的推荐名称相关联。

EC编号并非针对不同种类的酶,而是针对酶催化的反应。如果不同的酶(例如来自不同生物体的酶)催化相同的反应,则它们会获得相同的EC编号。[3]此外,通过趋同进化,完全不同的蛋白质折叠英语Protein fold class可以催化相同的反应(这些有时被称为非同源同功能酶英语Non-homologous isofunctional enzymes[4]因此会被分配相同的EC编号。相比之下,联合蛋白数据库标识符通过氨基酸序列唯一地指定蛋白质。[5]

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编号数字格式

每个酶代码均由字母“EC”和四个以句点分隔的数字组成(例如EC X.X.X.X)。这些数字代表酶的逐级精细分类。目前存在一些初步认定的EC编号,其第四位(序列号)数字包含“n”(例如 EC 3.5.1.n3)。[3]

例如,三肽氨基肽酶英语Tripeptide aminopeptidase的编号为“EC 3.4.11.4”,其组成部分表示以下酶组:

  • EC 3代指水解酶(利用分解其他分子的酶)
  • EC 3.4代指是作用于肽键的水解酶
  • EC 3.4.11.4指从三肽氨基末端裂解的酶

顶层编号

注意:酶分类编号与“格式编号”不同

更多信息 组别, 被催化的化学反应 ...
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反应相似性

可以通过使用化学键变化、反应中心或亚结构指标(以前称为 EC-BLAST,现为EMBL-EBI酶门户)来计算酶促反应之间的相似性。[7]

历史

在EC编号系统发展之前,酶的命名是任意的,通常使用诸如老黄酶(old yellow enzyme)英语NADPH dehydrogenase苹果酸酶英语Malic enzyme之类的名称,这些名称很少或根本没有提供任何有关所催化反应的线索。大多数这些名称已不再使用,但仍有少数名称在使用,尤其是特异性很低的蛋白水解酶,例如胃蛋白酶木瓜蛋白酶,因为根据特异性进行合理分类非常困难。

到了20世纪50年代,混乱已经让人无法忍受,在霍夫曼-奥斯滕霍夫(Hoffman-Ostenhof)[8]、迪克森(Dixon)和韦伯(Webb)[9]提出了类似的酶催化反应分类方案,1955年在布鲁塞尔举行的国际生物化学大会成立了酶委员会,由马尔科姆·迪克森英语Malcolm Dixon (biochemist)担任主席。第一版命名书籍发布于1961年,酶委员会随即解散,但其名称以EC编号这一术语保留了下来。目前的第六版由国际生物化学和分子生物学联合会于 1992年出版,是最后一个以印刷书籍形式出版的版本,包含3196种不同的酶。补编1—4出版于1993年至1999年。后续补编已以电子版形式发布在国际生物化学与分子生物学联盟(IUBMB)命名委员会的网站上。[6]2018年8月,IUBMB修改了该系统,添加了顶级EC 7(第七类)酶类别,即易位酶[10][11]

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参见

参考文献

外部链接

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