QPCR

qPCR eli kvantitatiivinen tosiaika-PCR^[1] (engl. quantitative real-time PCR) on molekyylibiologian menetelmä, jossa DNA:ta monistetaan polymeraasiketjureaktiolla (PCR) ja monistuneen tuotteen määrää mitataan reaaliajassa fluoresoivalla koettimella. Menetelmällä voidaan havaita patogeeneja tutkittavasta näytteestä tai selvittää tutkittavan DNA-sekvenssin määrä.^[2]

Tämä artikkeli käsittelee kvantitatiivista tosiaika-PCR-menetelmää. Käänteistranskriptaasi-PCR-menetelmää käsitellään artikkelissa RT-PCR.

qPCR:n tuloksena saatu fluoresenssikuvaaja.

Verrattuna tavalliseen polymeraasiketjureaktioon qPCR-menetelmän etuja ovat reaktion onnistumisen reaaliaikainen seuranta ja mahdollisuus selvittää monistuneen DNA:n määrä paljon aikaisempia menetelmiä tarkemmin. Hyvien puoliensa lisäksi qPCR on menetelmänä suhteellisen yksinkertainen, joten se on otettu jokapäiväiseen käyttöön molekyylibiologiassa ja on siten muuttanut tapaa tehdä tutkimusta.^[2]

Lyhenne

Vuonna 2009 ensimmäistä kertaa julkaistussa MIQE-ohjeistuksessa (engl. Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments) yhtenäistettiin PCR-menetelmistä käytettäviä lyhenteitä. Ohjeistuksen mukaan kvantitatiivinen tosiaika-PCR lyhennetään qPCR. Käänteistranskriptaasia käyttävä PCR-menetelmä, jossa RNA-mallijuoste muutetaan cDNA:ksi ennen monistusta, lyhennetään RT-PCR. Nämä kaksi edellä mainittua menetelmää yhdistävä reaaliaikainen kvantitatiivinen käänteistranskriptaasi-PCR lyhennetään RT-qPCR.^[2]

Ohjeistuksesta huolimatta qPCR-lyhennettä saatetaan toisinaan käyttää RT-qPCR-menetelmästä ja RT-PCR saattaa viitata qPCR-menetelmään, jolloin RT-osa on peräisin sanasta real-time.^[2]