| Functional MRI (Risonanza Magnetica Funzionale) |
| FEAT |
Analisi di fMRI basata su modelli con una interfaccia "GUI" facile ma potente: pre-processamento delle immagini (includente la correzione nel tempo delle ferre "slice timing correction", la correzione dei movimenti del paziente "MCFLIRT" ed il sistema di unwarping "PRELUDE+FUGUE EPI"); Analisi delle serie nel tempo col GLM "FILM" preceduto dal "prewhitening"; registratura d'immagini per immagini spaziali strutturali o standard; ed effetti di analisi dei gruppi generalizzati servendosi di effetti mescolati di analisi dei gruppi utilizzando tecniche d'inferenza bayesiana avanzate. |
| MELODIC |
Analisi di FMRI che prescinde da modelli, dato che utilizza procedure definite "Analisi delle componenti indipendenti" (PICA). MELODIC stima automaticamente il numero di sorgenti interessanti di rumore e di segnale nei dati anche perché il "modello di rumore" associato, è in grado di assegnare significanze ("valori-p") alle mappe spaziali che vengono ricostruite. |
| FLOBS |
Generazione di funzioni base HRF ottimali e di stime di attivazione bayesiana. |
| SMM |
Spatial Mixture Modelling - Modellazione di Miscele Spaziali - test di ipotesi alternative utilizzando la modellazione di miscele di istogrammi con la regolarizzazione spaziale della classificazione in attivazione e non-attivazione. |
| MRI Strutturale |
| BET /
BET2 |
Brain Extraction Tool - Strumento per l'Estrazione Cerebrale - che segmenta (separa) il cervello dal non-cervello in dati strutturali e funzionali, e fornisce una modellazione delle superfici del cranio e dello scalpo. |
| SUSAN |
Riduzione del rumore non-lineare. |
| FAST |
FMRIB's Automated Segmentation Tool - Strumento di Segmentazione Automatico - esegue la segmentazione del cervello (in diversi tipi di tessuto) e fa correzioni del campo di bias (bias field correction). |
| FLIRT |
FMRIB's Strumento di Registratura delle immagini Lineare - redistratura lineare inter e intra modale. |
| FUGUE |
Risolve le distorsioni geometriche nelle immagini EPI utilizzando mappe del campo B0. |
| SIENA |
Analisi del cambiamento strutturale del cervello, per poter stimare l'atrofia cerebrale. |
| MRI in Diffusione |
| FDT |
Strumenti per la Diffusione della FMRIB - strumenti per la ricostruzione dei parametri di diffusione di basso livello e per la trattografia probabilistica. |
| TBSS |
Tract-Based Spatial Statistics (parte degli strumenti di FMRIB per l'analisi delle immagini in diffusione) - analisi in base ai voxel (voxelwise) dei dati di diffusione in più soggetti. |
| Altri strumenti |
| Inference |
Diversi strumenti di inferenza/soglia, che includono: Randomise (attrezzo basato sulla permutazione per la determinazione della soglia statistica non-parametrica), Cluster (determinazione della soglia basato su gruppi che utilizza la teoria GRF per l'inferenza), FDR (false discovery rate inference), Glm (una interfaccia grafica per l'utente che serve a creare matrici di modello di design). |
| FSLView |
Strumento interattivo per mostrare dati in 3D e 4D. |
| AVWUTILS |
Miscelanea di dispositivi per convertire e processare immagini. |