香川県の二級水系一覧では、香川県を流れる水系のうち、香川県が管理する二級水系を記述する。2006年4月1日現在、79水系、275河川ある。
リストの順序は、河口の位置を基準に、徳島県境から西へ順番に並んでいる。島嶼部の河川は末尾に記載している。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。
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| 水系名 | 流路延長(km) | 流域面積(km2) | 河川数 | 河口のある自治体 | 備考 |
| 大谷川 |
3.299 | 2.0 | 1 | 東かがわ市 | |
| 坂本川 |
1.765 | 2.3 | 1 | 東かがわ市 | |
| 菜切川 |
1.500 | 1.4 | 1 | 東かがわ市 | |
| 馬宿川 |
8.618 | 21.6 | 2 | 東かがわ市 | |
| 足谷川 |
2.000 | 1.9 | 1 | 東かがわ市 | |
| 古川 |
2.480 | 2.8 | 1 | 東かがわ市 | |
| 小海川 |
6.205 | 12.4 | 2 | 東かがわ市 | |
| 中川 |
3.516 | 5.8 | 5 | 東かがわ市 | |
| 湊川 |
18.026 | 51.6 | 7 | 東かがわ市 | |
| 古川 |
3.107 | 2.8 | 1 | 東かがわ市 | |
| 与田川 |
5.694 | 17.2 | 7 | 東かがわ市 | |
| 番屋川 |
4.567 | 13.5 | 6 | 東かがわ市 | |
| 田尻川 |
0.614 | 0.9 | 1 | 東かがわ市 | |
| 大山川 |
1.383 | 0.9 | 1 | さぬき市 | |
| 東代川 |
0.500 | 0.9 | 1 | さぬき市 | |
| 西代川 |
1.400 | 2.0 | 1 | さぬき市 | |
| 梶川 |
1.300 | 0.8 | 1 | さぬき市 | |
| 梅川 |
0.900 | 1.2 | 1 | さぬき市 | |
| 津田川 |
15.022 | 43.7 | 12 | さぬき市 | |
| 滝川 |
1.086 | 1.5 | 1 | さぬき市 | |
| 鴨部川 |
22.228 | 68.0 | 14 | さぬき市 | |
| 弁天川 |
1.560 | 1.8 | 1 | さぬき市 | |
| 大橋川 |
0.950 | 3.5 | 1 | さぬき市 | |
| 玉浦川 |
1.370 | 2.0 | 1 | さぬき市 | |
| 下井手川 |
1.750 | 3.6 | 1 | 高松市 | |
| 長者川 |
1.600 | 4.7 | 2 | 高松市 | |
| 牟礼川 |
1.800 | 4.8 | 2 | 高松市 | |
| 相引川 |
5.010 | 11.6 | 1 | 高松市 | |
| 新川 |
18.693 | 131.9 | 20 | 高松市 | |
| 詰田川 |
4.670 | 31.6 | 4 | 高松市 | |
| 摺鉢谷川 |
2.290 | 3.5 | 1 | 高松市 | |
| 香東川 |
32.989 | 113.2 | 11 | 高松市 | |
| 本津川 |
21.370 | 51.1 | 10 | 高松市 | |
| 住吉川 |
3.300 | 6.0 | 1 | 高松市 | |
| 亀水川 |
2.474 | 7.0 | 1 | 高松市 | たるみがわ |
| 玉川 |
0.900 | 4.2 | 1 | 坂出市 | |
| 野田川 |
1.480 | 2.2 | 1 | 坂出市 | |
| 青海川 |
4.987 | 24.1 | 4 | 坂出市 | |
| 綾川 |
38.213 | 137.5 | 20 | 坂出市 | |
| 大束川 |
17.201 | 58.6 | 16 | 宇多津町 | |
| （土器川） |
33 | 140 | 11 | 丸亀市 | 一級水系 |
| 西汐入川 |
4.590 | 13.8 | 1 | 丸亀市 | |
| 金倉川 |
20.500 | 60.2 | 11 | 丸亀市 | |
| 桜川 |
4.380 | 10.8 | 4 | 多度津町 | |
| 弘田川 |
7.501 | 33.7 | 5 | 多度津町 | |
| 高瀬川 |
15.434 | 57.0 | 13 | 三豊市 | |
| 瀬入川 |
1.850 | 9.5 | 1 | 三豊市 | |
| 田井川 |
0.610 | 1.8 | 1 | 三豊市 | |
| 江尻川 |
1.500 | 4.6 | 1 | 三豊市 | |
| 天王川 |
1.300 | 1.5 | 1 | 三豊市 | |
| 苧扱川 |
3.500 | 4.6 | 1 | 観音寺市 | うこくがわ |
| 財田川 |
32.518 | 155.5 | 24 | 観音寺市 | さいたがわ |
| 一の谷川 |
7.122 | 20.7 | 4 | 観音寺市 | |
| 柞田川 |
16.023 | 61.0 | 8 | 観音寺市 | くにたがわ |
| 唐井手川 |
5.380 | 5.3 | 1 | 観音寺市 | |
| 白坂川 |
2.900 | 5.5 | 2 | 観音寺市 | |
| 吉田川 |
3.691 | 5.3 | 1 | 観音寺市 | |
| 四方堂川 |
1.350 | 2.0 | 1 | 観音寺市 | |
| 伝法川 |
7.893 | 19.0 | 2 | 土庄町（小豆島） | |
| 角田川 |
0.740 | 0.9 | 1 | 小豆島町（小豆島） | |
| 池田大川 |
2.513 | 7.4 | 2 | 小豆島町（小豆島） | |
| 競川 |
0.940 | 2.0 | 1 | 小豆島町（小豆島） | |
| 春田川 |
1.100 | 1.4 | 1 | 小豆島町（小豆島） | |
| 明神川 |
0.540 | 1.3 | 1 | 小豆島町（小豆島） | |
| 別当川 |
3.966 | 8.8 | 1 | 小豆島町（小豆島） | |
| 片城川 |
1.895 | 3.3 | 1 | 小豆島町（小豆島） | |
| 木庄川 |
1.360 | 1.5 | 1 | 小豆島町（小豆島） | |
| 安田大川 |
2.669 | 6.5 | 2 | 小豆島町（小豆島） | |
| 中筋川 |
1.245 | 0.9 | 1 | 小豆島町（小豆島） | |
| 向条川 |
1.101 | 1.1 | 1 | 小豆島町（小豆島） | |
| 城石川 |
0.430 | 2.3 | 1 | 小豆島町（小豆島） | |
| 森庄川 |
1.420 | 4.1 | 1 | 小豆島町（小豆島） | もりしょうかわ |
| 伊豆川 |
0.890 | 1.5 | 2 | 小豆島町（小豆島） | |
| 吉田川 |
5.026 | 6.3 | 1 | 小豆島町（小豆島） | よしだがわ |
| 東川 |
1.140 | 3.0 | 2 | 土庄町（小豆島） | |
| 桂川 |
1.000 | 5.6 | 1 | 土庄町（小豆島） | |
| 橘川 |
3.927 | 7.6 | 2 | 土庄町（小豆島） | |
| 皇踏川 |
0.670 | 0.7 | 1 | 土庄町（小豆島） | おうとがわ |
| 小瀬桂川 |
0.640 | 0.7 | 1 | 土庄町（前島） | こせかつらがわ |
| 春日川 |
1.200 | 2.1 | 1 | 土庄町（豊島） | |
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