LIM domen

LIM domeni su proteinski strukturni domeni, koji se sastoje od dva susedna domena cinkovog prsta, razdvojena sa dve hidrofobne aminokiseline.^[1] Oni su dobili ime po njihovom otkriću u proteinima Lin11, Isl-1 i Mec-3.^[2] Pokazano je da proteini koji sadrže LIM domen učestvuju u citoskeletalnoj organizaciji, razvoju organa i onkogenezi. LIM domeni posreduju protein-protein interakcije koje su kritične za ćelijske procese.

LIM domen

Strukture LIM domena iz Pinč proteina. Atomi cinka su prikazani sivo.
Identifikatori
Simbol	LIM
Pfam	PF00412
InterPro	IPR001781
PROSITE	PDOC50178
SCOP	1ctl
Superfamilija	1ctl
Dostupne PDB strukture: Pfam structures PDB RCSB PDB; PDBe PDBsum strukturni pregled

LIM domeni imaju visoko divergentne sekvence, izuzev pojedinih ostataka. Divergencija sekvenci omogućava postojanje mnoštva različitih mesta vezivanja u istom osnovnom domenu. Konzervirani ostaci učestvuju u vezivanju cinka ili su hidrofobna osnova proteina. LIM domeni imaju sledeću sekvencu:

[C]-[X]_2-4-[C]-[X]_13-19-[W]-[H]-[X]_2-4-[C]-[F]-[LVI]-[C]-[X]_2-4-[C]-[X]_13-20-C-[X]_2-4-[C]

Organizacija Lim domena

LIM domeni se često javljaju u umnošcima, kao što je to slučaj kod proteina TES i LMO4. Oni takođe mogu da budu vezani za druge domene, čime se omogučava vezivanje i sortiranje, npr. LIM kinaze.