Strukturna bioinformatika

Strukturna bioinformatika je grana bioinformatike koja je srodna sa analizom i predviđanjem trodimenzionalne strukture bioloških makromolekula poput proteina, RNK, i DNK. Ona se bavi generalizacijama makromolekulske 3D strukture kao što su poređenja sveukupnih savijanja i lokalnih motivima, principima molekulskog savijanja, evolucija i interakcije vezivanja, i relacije strukture/funkcije. Ona koristi eksperimentalno rešene strukture i računarske modele. Termin strukturna ima isto značenje kao i kod strukturne biologije. Strukturna bioinformatika se smatra delom računarske strukturne biologije.

Literatura

• Bourne, P.E., and Gu, J. (2009) Structural Bioinformatics (2nd edition), John Wiley & Sons, New York, ISBN 978-0-470-18105-8
• Bourne, P.E., and Weissig, H. (2003) Structural Bioinformatics, Wiley ISBN 0-471-20199-5
• Leach, Andrew (2001) Molecular Modelling: Principles and Applications (2nd edition), Prentice Hall, ISBN 978-0-582-38210-7
• Leontis NB, Westhof E. (2001). „Geometric nomenclature and classification of RNA base pairs”. RNA 7 (4): 499-512. DOI:10.1017/S1355838201002515. PMC 1370104. PMID 11345429.
• Jane S. Richardson (1981). „The anatomy and taxonomy of protein structure”. Adv Protein Chem. Advances in Protein Chemistry 34: 167-339. DOI:10.1016/S0065-3233(08)60520-3. ISBN 978-0-12-034234-1. PMID 7020376. Arhivirano iz originala na datum 2019-02-10. Pristupljeno 2014-03-11.
• Gopalasamudram Narayana Iyer Ramachandran, Sasisekharan V. (1968). „Conformation of polypeptides and proteins”. Adv Protein Chem. Advances in Protein Chemistry 23: 283-438. DOI:10.1016/S0065-3233(08)60402-7. ISBN 978-0-12-034223-5. PMID 4882249.
• Ramachandran GN, Ramakrishnan C, Sasisekharan V. (1963). „Stereochemistry of polypeptide chain configurations”. J Mol Biol 7: 95-9. DOI:10.1016/S0022-2836(63)80023-6. PMID 13990617.

Povezano

• Proteinska banka podataka
• SCOP
• Molekulsko modeliranje

Vanjske veze

• MMDB
• PDB