Каспаза-12

Каспаза 12(CASP12) - білок сімейства каспаз, кодується геном CASP12, що у людей знаходиться на довгому плечі 11-ї хромосоми. Структурно білок найбільш схожий на сімейство каспаз ICE(англ. Interleukin 1-beta Converting Enzyme, ICE — фермети, що конвертують інтерлейкін 1-бета). На відмінну від інших каспаз, не має протеазної активності.

CASP12
Ідентифікатори
Символи	CASP12, CASP-12, CASP12P1, caspase 12 (gene/pseudogene), caspase 12, Caspase-12, Caspase_12, IPR035713
Зовнішні ІД	OMIM: 608633 MGI: 1312922 GeneCards: CASP12
Реагує на сполуку
emricasan[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • cysteine-type peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway Клітинна компонента • NLRP3 inflammasome complex • AIM2 inflammasome complex • IPAF inflammasome complex • ендоплазматичний ретикулум • цитоплазма Біологічний процес • regulation of apoptotic process • regulation of inflammatory response • протеоліз • execution phase of apoptosis • GO:0097285 апоптоз • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • apoptotic signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	100506742	12364
Ensembl	ENSG00000204403	ENSMUSG00000025887
UniProt	Q6UXS9	O08736
RefSeq (мРНК)	NM_001191016	NM_009808
RefSeq (білок)	NP_001177945	NP_033938
Локус (UCSC)	Хр. 11: 104.89 – 104.9 Mb	Хр. 9: 5.35 – 5.37 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

У щурів, гомологічний білок є медіатором апоптозу у відповідь на пошкодження ендоплазматичного ретикулуму(ЕПР-стрес).

Людський ген CASP12 має дуже поширений поліморфізм, при якому в гені присутній передчасний стоп-кодон. Тому у більшості людей транслюється нефункціональний білок. Функціональний білок синтезується в людей, що належать до певної етнічної групи африканських аборигенів, в яких виявлений підвищений ризик розвитку сепсису.

Виявлено кілька різних форм транскрипту, що утворюються шляхами альтернативного сплайсингу.

Ген CASP12

Ген CASP12 є білок-кодуючим і розташований на довгому плечі 11-ї хромосоми. Складається з 12 953-ох нуклеотидів.

Ген та його продукти задіяні в розвитку аміотрофічного латерального склерозу, транспорті електронів в дихальних шляхах та в синтезі АТФ. Бере участь в механізмах апоптозу.

Важливим паралогом гену є ген CASP4.

Біохімічні процеси, в які задіяні продукти гену

Фізіологічні процеси:

• апоптоз
• ЕПР-стрес

Патологічні процеси:

• Хвороба Альцгеймера
• аміотрофічний латеральний склероз
• гепатит В

Білок

Білок має 3 ізоформи, створені шляхом альтернативного сплайсингу. Найпоширеніша ізоформа 1(Q6UXS9-1)складається з 341-ї амінокислоти та має молекулярну масу в 38,9 кДа. Ізоформа 2 (Q6UXS9-2) має стоп-кодон на місці 169-ї амінокислоти, тому її довжина 168 амінокислот та молекулярна маса 19 кДа. Крім цього, після 87-ї амінокислоти спостерігаються амінокислотні заміни. В ізоформі 3(Q6UXS9-3) відсутній фрагмент з 3-86 амінокислот, довжина - 257, молекулярна маса - 29,4 кДа.

Найбільша концентрація білку виявлена в ЕПР, невелика кількість присутня в цитозолі.

Білок може знижувати вивільнення цитокінів у відповідь на бактеріальний ліпополісахарид під час інфекцій. Знижує активацію NF-каппа-B у відповідь на TNF.

Недавні дослідження показали, що відбувається позитивний добір індивідів за неактивною формою гену, так як вони більш стійкі до розвитку запальних захворювань.

Література

1. Population distribution of the functional caspase-12 allele. (PMID: 16917906) Kachapati K … Dean M Human mutation 2006^[4]
2. Spread of an inactive form of caspase-12 in humans is due to recent positive selection. (PMID: 16532395) Xue Y … Tyler-Smith C American journal of human genetics 2006
3. Human caspase 12 has acquired deleterious mutations. (PMID: 12054529) Fischer H … Tschachler E Biochemical and biophysical research communications 2002^[5]
4. Genetic variation of innate immune genes in HIV-infected african patients with or without oropharyngeal candidiasis.^[6] (PMID: 20577092) Plantinga TS … Netea MG Journal of acquired immune deficiency syndromes (1999) 2010
5. Persistence of full-length caspase-12 and its relation to malaria in West and Central African populations. (PMID: 20423816) McCall MB … Netea MG European cytokine network 2010

Див. також

• хромосома 11
• CASP4
• CASP1
• CASP9