TET2

TET2 (англ. Tet methylcytosine dioxygenase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 002 амінокислот, а молекулярна маса — 223 811^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEQDRTNHVE		GNRLSPFLIP		SPPICQTEPL		ATKLQNGSPL		PERAHPEVNG
DTKWHSFKSY		YGIPCMKGSQ		NSRVSPDFTQ		ESRGYSKCLQ		NGGIKRTVSE
PSLSGLLQIK		KLKQDQKANG		ERRNFGVSQE		RNPGESSQPN		VSDLSDKKES
VSSVAQENAV		KDFTSFSTHN		CSGPENPELQ		ILNEQEGKSA		NYHDKNIVLL
KNKAVLMPNG		ATVSASSVEH		THGELLEKTL		SQYYPDCVSI		AVQKTTSHIN
AINSQATNEL		SCEITHPSHT		SGQINSAQTS		NSELPPKPAA		VVSEACDADD
ADNASKLAAM		LNTCSFQKPE		QLQQQKSVFE		ICPSPAENNI		QGTTKLASGE
EFCSGSSSNL		QAPGGSSERY		LKQNEMNGAY		FKQSSVFTKD		SFSATTTPPP
PSQLLLSPPP		PLPQVPQLPS		EGKSTLNGGV		LEEHHHYPNQ		SNTTLLREVK
IEGKPEAPPS		QSPNPSTHVC		SPSPMLSERP		QNNCVNRNDI		QTAGTMTVPL
CSEKTRPMSE		HLKHNPPIFG		SSGELQDNCQ		QLMRNKEQEI		LKGRDKEQTR
DLVPPTQHYL		KPGWIELKAP		RFHQAESHLK		RNEASLPSIL		QYQPNLSNQM
TSKQYTGNSN		MPGGLPRQAY		TQKTTQLEHK		SQMYQVEMNQ		GQSQGTVDQH
LQFQKPSHQV		HFSKTDHLPK		AHVQSLCGTR		FHFQQRADSQ		TEKLMSPVLK
QHLNQQASET		EPFSNSHLLQ		HKPHKQAAQT		QPSQSSHLPQ		NQQQQQKLQI
KNKEEILQTF		PHPQSNNDQQ		REGSFFGQTK		VEECFHGENQ		YSKSSEFETH
NVQMGLEEVQ		NINRRNSPYS		QTMKSSACKI		QVSCSNNTHL		VSENKEQTTH
PELFAGNKTQ		NLHHMQYFPN		NVIPKQDLLH		RCFQEQEQKS		QQASVLQGYK
NRNQDMSGQQ		AAQLAQQRYL		IHNHANVFPV		PDQGGSHTQT		PPQKDTQKHA
ALRWHLLQKQ		EQQQTQQPQT		ESCHSQMHRP		IKVEPGCKPH		ACMHTAPPEN
KTWKKVTKQE		NPPASCDNVQ		QKSIIETMEQ		HLKQFHAKSL		FDHKALTLKS
QKQVKVEMSG		PVTVLTRQTT		AAELDSHTPA		LEQQTTSSEK		TPTKRTAASV
LNNFIESPSK		LLDTPIKNLL		DTPVKTQYDF		PSCRCVEQII		EKDEGPFYTH
LGAGPNVAAI		REIMEERFGQ		KGKAIRIERV		IYTGKEGKSS		QGCPIAKWVV
RRSSSEEKLL		CLVRERAGHT		CEAAVIVILI		LVWEGIPLSL		ADKLYSELTE
TLRKYGTLTN		RRCALNEERT		CACQGLDPET		CGASFSFGCS		WSMYYNGCKF
ARSKIPRKFK		LLGDDPKEEE		KLESHLQNLS		TLMAPTYKKL		APDAYNNQIE
YEHRAPECRL		GLKEGRPFSG		VTACLDFCAH		AHRDLHNMQN		GSTLVCTLTR
EDNREFGGKP		EDEQLHVLPL		YKVSDVDEFG		SVEAQEEKKR		SGAIQVLSSF
RRKVRMLAEP		VKTCRQRKLE		AKKAAAEKLS		SLENSSNKNE		KEKSAPSRTK
QTENASQAKQ		LAELLRLSGP		VMQQSQQPQP		LQKQPPQPQQ		QQRPQQQQPH
HPQTESVNSY		SASGSTNPYM		RRPNPVSPYP		NSSHTSDIYG		STSPMNFYST
SSQAAGSYLN		SSNPMNPYPG		LLNQNTQYPS		YQCNGNLSVD		NCSPYLGSYS
PQSQPMDLYR		YPSQDPLSKL		SLPPIHTLYQ		PRFGNSQSFT		SKYLGYGNQN
MQGDGFSSCT		IRPNVHHVGK		LPPYPTHEMD		GHFMGATSRL		PPNLSNPNMD
YKNGEHHSPS		HIIHNYSAAP		GMFNSSLHAL		HLQNKENDML		SHTANGLSKM
LPALNHDRTA		CVQGGLHKLS		DANGQEKQPL		ALVQGVASGA		EDNDEVWSDS
EQSFLDPDIG		GVAVAPTHGS		ILIECAKREL		HATTPLKNPN		RNHPTRISLV
FYQHKSMNEP		KHGLALWEAK		MAEKAREKEE		ECEKYGPDYV		PQKSHGKKVK
REPAEPHETS		EPTYLRFIKS		LAERTMSVTT		DSTVTTSPYA		FTRVTGPYNR
YI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

TET2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4NM6, 5DEU, 5D9Y
Ідентифікатори
Символи	TET2, KIAA1546, MDS, tet methylcytosine dioxygenase 2, Tet methylcytosine dioxygenase 2, IMD75
Зовнішні ІД	OMIM: 612839 MGI: 2443298 HomoloGene: 49498 GeneCards: TET2
Пов'язані генетичні захворювання
рак молочної залози, меланома, справжня поліцитемія, мієлодиспластичний синдром, гострий мієлоїдний лейкоз, blood platelet count[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • oxidoreductase activity • dioxygenase activity • zinc ion binding • DNA binding • ferrous iron binding • methylcytosine dioxygenase activity • iron ion binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • 5-methylcytosine catabolic process • клітинний цикл • GO:1904578 response to organic cyclic compound • protein O-linked glycosylation • myeloid cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • DNA demethylation • histone H3-K4 trimethylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • oxidative demethylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54790	214133
Ensembl	ENSG00000168769	ENSMUSG00000040943
UniProt	Q6N021	Q4JK59
RefSeq (мРНК)	NM_001127208 NM_017628	NM_001040400 NM_145989 NM_001346736
RefSeq (білок)	NP_001120680 NP_060098	NP_001035490 NP_001333665
Локус (UCSC)	Хр. 4: 105.15 – 105.28 Mb	Хр. 3: 133.17 – 133.25 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 doi:10.1093/dnares/7.4.271
• Chen Q., Chen Y., Bian C., Fujiki R., Yu X. (2013). TET2 promotes histone O-GlcNAcylation during gene transcription. Nature. 493: 561—564. PMID 23222540 doi:10.1038/nature11742
• Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of human CXXC10 gene in silico. Int. J. Oncol. 25: 1193—1199. PMID 15375572