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16BO133病毒

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16BO133病毒严重急性呼吸道综合征相关冠状病毒(SARSr-CoV)的一个病毒株,在韩国马铁菊头蝠中发现,于2019年发表,其基因组被完整定序,是首个被完整定序的韩国SARSr-CoV病毒株,在SARSr-CoV中属于SARS-CoV相关病毒,与其基因组序列相似度为82.8%。

事实速览 16BO133病毒, 病毒分类 ...
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发现

16BO133病毒于2016年在韩国马铁菊头蝠的口腔样本中被发现,此病毒株的基因组长29075nt。在SARSr-CoV中,16BO133和2016年发表、自中国吉林马铁菊头蝠中发现的JTMC15病毒最为接近,基因组核酸序列相似度为98.3%,与其他SARSr-CoV相较之下,这两个病毒株因为ORF7b末端的框移突变而丧失了ORF8[1][2]。16BO133病毒和SARS-CoV的基因组核酸序列相似度则为82.8%[3]

过去虽有其他SARSr-CoV病毒株在韩国被发现(B15-21病毒等),但皆无完整序列定序[4],16BO133病毒是首个被完整定序的韩国SARSr-CoV病毒株[1]

演化树

截至2021年1月 (2021-01)SARS-CoV与相关病毒株的系统发生树

16BO133 与SARS-COV相似度82.8 % · 马铁菊头蝠 · 韩国全罗北道 (2016年采集、2019年发表)[1]

Rf1 87.8 % · 马铁菊头蝠 · 中国湖北宜昌 (2004年采集、2005年发表)[5]

BtCoV HKU3 87.9 % · 中华菊头蝠 · 香港、中国广东 (2004年采集、2005年发表、2010年又发表若干新病毒株)[6]

LYRa11 90.9 % · 中菊头蝠 · 中国云南保山 (2011年采集、2014年发表)[7]

Rp3 92.6 % · 皮氏菊头蝠 · 中国广西南宁 (2004年采集、2005年发表)[5]

SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中国云南禄丰 (2013年采集、2015年发表)[8]

SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中国云南禄丰 (2013年采集、2015年发表)[8]

SHC014 95.4 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明 (2011年采集、2013年发表)[9]

WIV1 95.6 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明 (2012年采集、2013年发表)[9]

WIV16 96.0 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明 (2013年采集、2016年发表)[10]

果子狸SARS冠状病毒 99.8 % · 果子狸 · 中国广东[6]

SARS-CoV 100 %

SARS-CoV-2 79 %

  蝙蝠病毒
  果子狸病毒
  人类病毒


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参考文献

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