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非蛋白胺基酸
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非蛋白胺基酸[1](non-proteinogenic amino acids)是生物化學上指在蛋白質內找不到(例如:肉鹼、GABA和L-DOPA),或沒有被標準遺傳密碼編碼的其他胺基酸。
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儘管在合成蛋白質時只會用到21種胺基酸(真核細胞只會用20種[note 1]),事實上目前已經知道還有另外超過300種的天然胺基酸,而相信窮盡所有組合,這數目可以數以千計[2]。 在所有的非蛋白胺基酸當中,有部份較為值得注意,因為下列各種原因:
通過否定來定義

在技術上,任何具有胺(-NH2)和羧酸(-COOH)官能團的有機化合物都是胺基酸。 蛋白胺基酸是該組的一小部分,具有帶有一個胺基,一個羧基,一個側鏈和一個α-氫左旋構象的中心碳原子(α-或2-),甘胺酸除外, 非胺基和脯胺酸,其胺基是仲胺,因此由於傳統原因通常被稱為亞胺基酸,儘管不是亞胺基。
遺傳密碼編碼20種標準胺基酸,用於在翻譯過程中摻入蛋白質中。 然而,有兩種額外的蛋白質胺基酸:硒代半胱胺酸和吡咯離胺酸。 這些非標準胺基酸不具有專用密碼子,但是當存在特定序列時,加入代替終止密碼子,硒代半胱胺酸的UGA密碼子和SECIS元件[3],吡咯離胺酸的UAG PYLIS下游序列[4]。 所有其他胺基酸被稱為「非蛋白原性」。
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硒代半胱胺酸。 該胺基酸在其β-碳上含有硒醇基團
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吡咯離胺酸。 該胺基酸通過與賴胺酸的羧基吡咯啉環的ε-胺基連接而形成
有各種胺基酸組[5]:
- 20種標準胺基酸
- 22種蛋白質胺基酸
- 超過80個胺基酸是由高濃度非生物創建
- 大約900個是由自然途徑產生的
- 超過118種被工程化胺基酸被置於蛋白質中
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參考文獻
註釋
參見
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