Kozak序列

科扎克共有序列, 或Kozak 序列 ，是在真核生物的mRNA中共有的(gcc)gccRccAUGG序列 。它在翻譯過程的啟動中扮演了重要角色。^[1]，得名自揭示了其重要性的瑪麗蓮·科扎克。

序列標識為(gcc)gccRccAUGG, 源自科扎克對大範圍的樣本（共約699種）^[2]的歸納和分析，其中：

1. 小寫字母表示此位置處最常見的鹼基（仍然可以變化）;
2. 大寫字母表示高度保守的鹼基，例如「AUGG」序列是不變的或很少，甚至根本沒有變化，唯一的例外是IUPAC的模糊碼^[3]。「R」這表明嘌呤（A或G）總是在這個位置上（科扎克聲稱A更常見）
3. 括號內的序列((gcc))重要性不明。

科扎克的研究局限於脊椎動物的一部分（例如人類，牛，貓，狗，雞，豚鼠，倉鼠，小鼠，豬，兔，羊，非洲爪蟾）。

簡介

這個序列在mRNA分子上被核糖體識別為翻譯起始位點，即蛋白質是由此開始被該mRNA分子編碼的。核糖體需要此序列，或一個可能的可變形式（見下文）來啟動翻譯。Kozak序列不應與核糖體結合位點（RBS）相混淆，後者一般為信使RNA的5'端帽或內部核糖體進入位點（IRES）。

在體內(In vivo)，不同的mRNA上這段區域往往不完全匹配，由一個給定的mRNA合成蛋白質的量取決於Kozak序列的強度。^[4] 這個序列中的一些核苷酸比其它的更重要：AUG是最重要的，因為它是實際的起始密碼子，在對應蛋白質的N-末端編碼一個甲硫氨酸。（很少地，CUG被用作起始密碼子，編碼亮氨酸，而不是典型的蛋氨酸作為起始。）「AUG」的A被定為1號位的話，對於一個「強」的Kozak序列，核苷酸在相對於1號核苷酸的4號位（即G所在的位置）和-3號位（即R的位點，沒有號碼0的位置）必須匹配一般的Kozak序列。「適中」強度的Kozak序列只有上述兩個中的一個匹配，而「弱」的兩個都不匹配。在-1和-2的cc並不那麼保守，但有助於提升整體強度。^[5]有證據表明， 在-6位的G在翻譯起始中也是重要。 ^[1]

體內有這些類型的Kozak序列的例子，他們很可能是演變而來的基因調控的又一機制。Lmx1b （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）是「弱」Kozak序列基因的一個例子。^[6]從這樣的位點起始的翻譯，mRNA序列需要有額外的特性，以便使核糖體識別起始密碼子。

變異

研究顯示β-珠蛋白基因（β+45;人類）在-6位G—>C的變異表現打亂血液和生物合成功能的表型。這是首個被發現的人類Kozak序列變異。它在一個義大利東南部的地中海貧血家庭中被發現。^[1]

共有序列的可變形式

(gcc)gccRccAUGG
       AGNNAUGN
        ANNAUGG
        ACCAUGG
     GACACCAUGG

不同真核生物中的類Kozak序列

生物類群	門	共有序列
脊椎動物		gccRccATGG[2]
果蠅 (Drosophila spp.)	節肢動物門	cAAaATG[7]
釀酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae)	子囊菌門	aAaAaAATGTCt[8]
粘菌 (Dictyostelium discoideum)	變形蟲門	aaaAAAATGRna[9]
纖毛蟲	纖毛蟲門	nTaAAAATGRct[9]
瘧原蟲 (Plasmodium spp.)	頂復門	taaAAAATGAan[9]
弓形蟲 (Toxoplasma gondii)	頂復門	gncAaaATGg[10]
Trypanosomatidae	眼蟲門	nnnAnnATGnC[9]
陸生植物		AACAATGGC[11]

參見

• 夏因-達爾加諾序列, 原核生物的核糖體結合位點。