Pigoraptor

Pigoraptor ist eine Gattung einzelliger, einfach begeißelter (uniflagellarer) Protisten. Die beweglichen (motilen) Geißelzellen sind länglich-oval oder rundlich. Die glatte Geißel dieser Schwimmzellen entspringt aus einem Punkt in der Mitte der Seite, ist nach hinten gerichtet, und endet in einem langen Acronem.^{[A. 1]} Die Zellen sind nackt (ohne Schale oder Schuppen – Testa bzw. Theca), manchmal bilden sie kurze, dünne Pseudopodien aus. Pigoraptor kann Zellverbände (Cluster) aus mehreren Einzelzellen bilden. Die Gattung ernährt sich räuberisch, zu ihrer Beute gehören heterotrophe Metakinetoplastina (ehem. Bodonida), vor allem sich langsam bewegende und unbewegliche Zellen oder Zysten.^[1]

Pigoraptor
REM-Aufnahme von P. vietnamica (Schwimm- oder Geißelzelle). ac: Acronem;[A. 1] cv: kontraktile Vakuole. Balken 4 µm. REM-Aufnahme von P. chileana (Geißelzelle). gr: Grube. Balken: 4 μm
Systematik
ohne Rang: Holozoa ohne Rang: Filozoa ohne Rang: Filasterea ohne Rang: Ministeriida Familie: Capsasporidae Gattung: Pigoraptor
Wissenschaftlicher Name
Pigoraptor
Tikhonenkov, Hehenberger, Mylnikov & Keeling 2017[1]

Typusart ist T. vietnamica .^[1]

Beschreibung

Kladogramm mit den Abstammungslinien, in denen große Giant Virus Endogenization Events (GEVEs) beschrieben wurden, sowie das Vorkommen von 5mC und Genkörper-Methylierungsmustern (GbM). Dunkle Punkte stehen für Vorkommen, weiße Punkte für Fehlen, graue Punkte für hohe Wahrscheinlichkeit und braune Punkte für fehlende Daten/Studien.^{[A. 2]}

Schematische Darstellung der möglichen phylogenetischen Position von Pigoraptor und ver­wandten Gattungen.
A: Pluriformea als Schwesterklade zu einer die Tiere, Choanoflagellaten und Filasterea (einschließlich Pigoraptor) umfassenden Klade (nach Hehenberger et al.^[1]),
B: Pluriformea als Schwesterstamm zu Ichthyosporea innerhalb von Teretosporea (Tereto­sporea-Hypothese nach López-Escardó et al.).
Hervorgehoben sind die neuen Gattungen Syssomonas und Pigoraptor.^[2]

Pigoraptor vietnamica und P. chileana gehören verwandtschaftlich zu den Filasterea, und sind vermutlich auch verwandt mit Sysso­monas multi­formis (eine Spezies, die in phylo­genomischen Analysen mit der Gattung mit Corallo­chytrium eine neue Klade Pluri­formea bildet). Alle drei Arten sind räuberische Flagellaten, die relativ große eu­karyo­tische Ein­zeller erbeuten, und alle drei scheinen auch eine komplexe Lebens­geschichte mit mehreren unter­schied­lichen Stadien, ein­schließ­lich multi­zellulärer Cluster, auf­zu­weisen.^[1]

Lebenszyklus

Lebenszyklus und -phasen von P. vietnamica

Mutmaßliche Lebensstadien von Pigoraptor vietnamica: Schwimmende Geißel­zellen (Flagellaten) können lange, dünne, manchmal verzweigte Filopodien bilden, die sich am Substrat anheften können. Die Geißelzellen können manchmal auch breite Lobopodien aufweisen. Sie können ihre Geißel zurückziehen und rundlich werden, um sich entweder in zwei Tochter-Geißelzellen zu teilen oder in ein zystisches Stadium überzugehen. Daraus können wiederum zwei begeißelte Tochterzellen entstehen. Die Zellen können auch locker zusammenhängende Zellverbände bilden, die sich gemeinsam ernähren und leicht wieder zerfallen.^[3]

Die Lebensstadien von Pigoraptor chileana sind denen von P. vietnamica sehr ähnlich, aber P. chileana zeigt eine viel geringere Fähigkeit zur Bildung von Filopodien und Lobopodien (solche Stadien sind bei P. chileana extrem selten).^[3]

Arten

Artenliste gemäß der Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI):^[4]

Gattung Pigoraptor Tikhonenkov, Hehenberger, Mylnikov & Keeling 2017^[1]

• Pigoraptor chileana Tikhonenkov, Hehenberger, Mylnikov & Keeling 2017 [Opisthokonta sp. DVT-2017b] (Abkürzung Pchi^i[5])
  • Referenzstamm: Opistho-2 – Typlokalität: Bodensedimente einer temporär überfluteten Wiese (d. h. Süßwasser) in der Nähe des Lago Blanca,^[6] Feuerland (Chile).
• Pigoraptor vietnamica Tikhonenkov, Hehenberger, Mylnikov & Keeling 2017 [Opisthokonta sp. DVT-2017a] (Typusart, Abkürzung Pvie^i[5])
  • Referenzstamm: Opistho-1 – Typlokalität: Süßwasserreservoir Dak Minh^[7] (Schlicksand am Uferbereich), Provinz Đắk Lắk, Südvietnam.

Etymologie

Der Gattungsname Pigoraptor setzt sich zusammen aus lateinisch piger, deutsch ‚faul‘, englisch lazy und raptor, deutsch ‚räuber‘, englisch predator, bedeutet also „fauler Räuber“.

• Das Art-Epitheton vietnamica ist neulateinisch und bedeutet ‚aus Vietnam‘ oder ‚zu Vietnam gehörig‘, ‚in Vietnam lebend‘.
• Analog bedeutet das Art-Epitheton chileana ‚aus Chile‘, ‚zu Chile gehörig‘ oder ‚in Chile lebend‘.^[1]

Kultivierung und Sequenzierung

Bei den Klonen (Stämmen) Opistho-1 und Opistho-2 (von P. vietnamica respektive P. chileana) wurde wie folgt vorgegangen: Zwanzig Einzelzellen jedes Klons (bei Opistho-1 nochmals zusätzlich elf Einzelzellen) wurden in 0,2 mℓ dünnwandige Mikroreaktionsgefäße (PCR-Gefäße) übertragen, die 2 μℓ Zelllyse-Puffer^{[A. 3]} enthielten. Die Sequenzierung wurde dann auf der Plattform Illumina MiSeq mit Leselängen von 300 bp durchgeführt.^[1]

Genom und Transkriptionsfaktoren

Die Untersuchung von Genen, die mit der Multizellularität von Tieren in Verbindung stehen, ergab, dass diese neuen Filasterea ein ähnliches Repertoire an Genen zur Zelladhäsion aufweisen wie andere Arten dieser Gruppe.^[1]

Im Jahr 2024 fanden Gao et al. heraus, dass einige einzellige Holozoa Sox-artige Gene besitzen. D. h. sie kodieren Proteine, die wie der Transkriptionsfaktor Sox-2 DNA binden.^{[A. 4]} Unter diesen Holozoa befanden sich neben den Choanoflagellaten Mylnosiga fluctuans (Myfluⁱ)^[8] und Salpingoeca helianthica (Salhelⁱ) auch Filasterea wie die beiden Spezies (Pvie und Pchiⁱ) von Pigoraptor. Die Sox-HMG-Sequenzen von Pvie, Pchi, Myflu und Salhel bilden eine Schwesterklade zu den tierischen Sox-Genen. Bekannte Sox-ähnliche Sequenzen aus anderen Choanoflagellaten (und erst recht Filasterea) zeigen dagegen eine geringere Verwandtschaft und größere Abweichungen, befinden sich also außerhalb der Sox-Hauptklade. Dies deutet darauf hin, dass

• die Sox-Gene bereits vor dem letzten gemeinsamen Vorfahren der mehrzelligen Tiere (Metazoa) entstanden sind, und
• viele einzellige Holozoa ihre Sox-Gene entweder verloren haben, oder dass diese degeneriert sind.

Alle Aminosäuren, die für das sequenzspezifische Auslesen von Basen in modernen Sox-Proteinen entscheidend sind, sind auch in den Sox-Varianten von Pvie, Pchi, Myflu und Salhel konserviert. Dies ließ die Vermutung aufkommen, dass diese Sox-Varianten auch die gleichen DNA-Motive binden können wie ihre Gegenstücke in Säugetieren. Um diese Vermutung zu testen, wählten Gao et al. repräsentative Sox-Sequenzen von Einzellern aus. Unter diesen befanden sich insbesondere Pchi (als Filasterea-Mitglied) und Salhel (als Choanoflagellat). Es stellte sich schließlich heraus, dass diese Proteine eine Sequenzspezifität aufweisen, die sich nicht vom Sox2 von Mäusen unterscheidet.^[5]

Bildergalerie

• Pigoraptor vietnamica
• 
  Morphologie und Lebensformen^{[A. 5]}
• 
  Gesamtansicht und Geißelstruktur^{[A. 6]}
• 
  Schnitte des Zellkerns und anderer Strukturen^{[A. 7]}
• 
  Zellkern und Anordnung der Basal­körper^{[A. 8]}
• 
  Anordnung der beiden Basalkörper relativ to zueinander (Serienschnitte).^{[A. 9]}

• Pigoraptor chileana
• 
  Morphologie und Lebensformen^{[A. 10]}
• 
  Gesamtansicht, Geißelstruktur und Geißelwurzelsystem^{[A. 11]}
• 
  Anordnung der Basalkörper und Struktur der Filopodien^{[A. 12]}

Anmerkungen

1. Acronem: Der schlanke Abschnitt einer Geißel (Wiktionary: acroneme – englisch). Unterscheide:
   Axonem: Bündel von neun Mikrotubuli, die das innere Gerüst eines Ciliums oder Flagellums bilden, mit zwei zusätzlichen zentralen Mikrotubuli, die die anderen verbinden, wenn das Cilium/Flagellum beweglich ist (Wiktionary: axoneme – englisch).
2. Amoebidium ist als Vertreter der Ichthyosporea angegeben, Pigoraptor als Vertreter der Filasterea.
3. 0,2 % Lösung von Triton X-100 (Octoxinol 9) und RNase-Inhibitor)
4. Die Sox-Proteinfamilie teilt die HMG-Box genannten Proteindomänen.
5. Morphologie und Lebensformen von P. vietnamica:

   a,b,h,i: Gesamtansicht einer Zelle (Differentialinterferenzkontrast- bzw. REM-Aufnahmen)

   с: Aggregation von Geißelzellen.000	d: Amoeboflagellat mit Filopodien.
   e: Zelle mit Lobopodien.	f: Zyste.
   g: Zweiteilung.

   ac: Acronem ([w]); cv: kontraktile Vakuole; gr: Rille (groove); Balken: a–g: 10 μm, h: 4 μm, i: 2 μm.
6. Gesamtansicht und Geißelstruktur von Pigoraptor vietnamica (TEM-Aufnahmen):

   a: Längsschnitt durch die Zelle.000 b,c: Längsschnitt durch die Geißel.

   d–f: Querschnitte durch die Geißel im Übergangsbereich.

   cf: Zentralfilament; fl, Geißel (Flagellum); fbb: Geißelbasalkörper; n: Zellkern (Nukleus); rs: Reservesubstanz; Balken: a: 1 μm, b: 0,5 μm, c: 0,5 μm, d–f: 0,2 μm.
7. Schnitte des Zellkerns und anderer Strukturen von P. chileana:

   a: Zellkern.	b: Golgi-Apparat.
   c: Mitochondrium.	d,e: Zellkern & Filopodien.
   f: Nahrungsvakuole.000	g: Exozytose.
   h: Reservesubstanz.	i: sich teilende symbiotische Bakterien.

   an: flagellares Axonem ([w]); bc: Bakterium; ec: Ectoproct („Analsegment“);^[0] fp, Filopodium; fv: Nahrungsvakuole (food vacuole); Ga: Golgi-Apparat; mt: Mitochondrium; n: Zellkern (Nukleus); nu: Nucleolus; rs: Reservesubstanz; sb: symbiotische Bakterien; Balken: a: 1 μm, b–d,i: 0,5 μm, e: 0,2 μm, f,g,h: 1 μm.
8. Zellkern und Anordnung der Basalkörper von P. vietnamica:

   a: Teil der Zelle, der den Zellkern und den Basalkörper der Geißel (Flagellum) enthält.

   b: Nicht-flagellarer Basalkörper

   c: flagellarer Basalkörper (Geißelbasalkörper) und umgebende Strukturen.

   fbb: flagellarer Basalkörper; mct: Mikrotubuli; n: Zellkern (Nukleus); nu: Nucleolus; rf: radiale Fibrillen; rs: Reservesubstanz; Balken: a: 0,5 μm, b: 0,5 μm, c: 0,2 μm.
9. Anordnung der beiden Basalkörper relativ zueinander (Serienschnitte, P. vietnamica):
   fbb: flagellarer Basalkörper (Geißelbasalkörper); mct: Mikrotubuli; n: Zellkern (Nukleus); nfbb, Nicht-flagellarer Basalkörper; Balken: alle 0,5 μm.
10. Morphologie und Lebensformen von P. chileana:

    a,b,h,i: Gesamtansicht einer Zelle (Differentialinterferenzkontrast- bzw. REM-Aufnahmen).

    с: Aggregation von Zellen.000	d: Zyste.
    e: Zweiteilung.	f,g: Zelle mit kurzen Lobopodien & Filopodien.

11. Gesamtansicht, Geißelstruktur und Geißelwurzelsystem von Pigoraptor chileana:

    a: Gesamtansicht des Zellschnitts.

    b–d: Geißel (Flagellum).

    e–h: Flagellarer Basalkörper und umgebende Strukturen.

    an: Axonem ([w]); ds: (elektronen-)dichter Fleck (dense spot); fbb: flagellarer Basalkörper; fv: Nahrungsvakuole (food vacuole); mct: Mikrotubuli; n: Zellkern (Nucleus); nfbb: nicht-flagellarer Basalkörper; nu: Nucleolus; Balken: a,d–h: 0,5 μm, b,c: 0,2 μm.
12. Anordnung der Basalkörper und Struktur der Filopodien von Pigoraptor chileana.

    a–f: Serienschnitte der Basalkörper.00 g–i: Filopodien.

    fbb: flagellarer Basalkörper; fl: Geißel (Flagellum); fp: Filopodium; mct: Mikrotubuli; n: Zellkern (Nucleus); nfbb: nicht-flagellarer Basalkörper; Balken: a–f: 0,2 μm, g–i: 0,5 μm