Katepsin C

Katepsin C (CTSC) – poznat i kao dipeptidil peptidaza I (DPP-I) – je lizosomna egzocistein proteaza koja pripada familiji C1 peptidaza.^{[5][6][7][8][9]}

CTSC
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 4OEM, 1K3B, 2DJF, 2DJG, 3PDF, 4CDC, 4CDD, 4CDE, 4CDF, 4OEL
Identifikatori
Aliasi	CTSC, CPPI, DPP-I, DPP1, DPPI, HMS, JP, JPD, PALS, PDON1, PLS, katepsin C
Vanjski ID-jevi	OMIM: 602365 MGI: 109553 HomoloGene: 1373 GeneCards: CTSC
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 11 (čovjek)[1] Bend 11q14.2 Početak 88,265,069 bp[1] Kraj 88,359,684 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 7 (miš)[2] Bend 7|7 D3 Početak 87,927,293 bp[2] Kraj 87,960,096 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • peptidase activator activity involved in apoptotic process • phosphatase binding • cysteine-type peptidase activity • chaperone binding • protein self-association • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • vezivanje identičnih proteina • chloride ion binding • cysteine-type endopeptidase activity • serine-type endopeptidase activity • hydrolase activity Ćelijska komponenta • Golđijev aparat • endoplasmic reticulum lumen • membrana • Endoplazmatski retikulum • COPII-coated ER to Golgi transport vesicle • Lizozom • Egzosom • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • Golđijeva membrana • extracellular region • Vanćelijsko • nukleoplazma • centrosom • azurophil granule lumen • intracellular membrane-bounded organelle • collagen-containing extracellular matrix • citoplazma Biološki proces • GO:0010260 starenje • positive regulation of proteolysis involved in cellular protein catabolic process • positive regulation of apoptotic signaling pathway • response to organic substance • Proteoliza • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII vesicle coating • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 Imuni odgovor • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • T cell mediated cytotoxicity • GO:0097285 apoptoza • neutrophil degranulation • negative regulation of myelination • positive regulation of microglial cell activation Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	1075	13032
Ensembl	ENSG00000109861	ENSMUSG00000030560
UniProt	P53634	P97821
RefSeq (mRNK)	NM_148170 NM_001114173 NM_001814	NM_009982 NM_001311790
RefSeq (bjelančevina)	NP_001107645 NP_001805 NP_680475	NP_001298719 NP_034112
Lokacija (UCSC)	Chr 11: 88.27 – 88.36 Mb	Chr 7: 87.93 – 87.96 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Kod čovjeka, kodirana je sa CTSC gena.^[10][11]

Funkcija

Katepsin C se javlja kao centralni koordinator aktivacije mnogih serin proteaza u imuno/upalnim ćelijama. Katepsin C katalizira eksciziju dipeptida iz N-kraja proteinske i peptidne podloge, osim ako (1) je blokirana amino grupa N-kraja, (2) mjesto cijepanja na obje strane prolinskog ostatka ili je (3) ostatak N-kraja lizin ili arginin ili (4) struktura peptida ili proteina sprečava dalje razlaganje iz N-kraja

Struktura

U cDNK kodiranju pacova, čovjeka, miša, goveda, psa, klonirana su dva shistosoma (kategorirana) katepsina Cs, koji pokazuju da je enzim vrlo očuvan. Za ljudski i pacovski katepsin C, cDNK kodira prekursor (prepro-katepsin C) koji se sastoji od signalnih peptida od 24 ostatka, pro-regije 205 (pacovski katepsin C ) ili 206 (ljudski katepsin C) ostataka i katalitske domene od 233 ostatka koji sadrže katalitske ostatke, te da ima 30-40% identičnih sekvenci zrelih aminokiselina papaina i niz drugih katepsina, uključujući i katepsine B, H, K i L i S.^[12]

Prevedeni prepro-katepsin C se obrađuje u zreli oblik u najmanje četiri podjele lanca polipeptida. Ovaj signalni peptid je uklonjen tokom translokacija ili lučenjem pro-enzima (pro-katepsina C) i velikog proregijskog fragmenta fragmenta N-kraja (poznat i kao domena isključenja), koji se zadržava u zrelom enzimu, odvojen od katalitiske domene ekscizijom (isijecanjem) nezrele pro-regija C-kraja, što se zove aktiviranje peptida. U rascjepu katalitske domene stvaraju se teški lanac od oko 164 ostatka i lahki, od oko 69 ostataka.

Za razliku od drugih članova papainske porodice, zreli katepsin C sastoji se od četiri podjedinice, od kojih je svaka sastavljen od N-kraja proregionskog fragmenta, teškoh i lahkog lanca. Pro-regije fragment i teškog lanca su glikozilirani. ^[13][14][15]

Također pogledajte

• Enzim
• Katepsin