汽水・淡水魚類レッドリスト (環境省)

汽水・淡水魚類レッドリスト（きすい・たんすいぎょるいレッドリスト）は、日本の環境省が公表した汽水・淡水産の魚類のレッドリストであり、日本国内における魚類の絶滅危惧の評価である。日本国内の個体群に対しての評価であるので、世界的にみれば普通種に該当する場合がある。

概要

環境省版の汽水・淡水魚類レッドリストは、1991年（平成3年）に『日本の絶滅のおそれのある野生生物－脊椎動物編』として公表されたもの（1991年版）が初めてである。その後、1999年（平成11年）2月18日に、改訂されたレッドリスト（1999年版）が公表された^[1]。その1999年版レッドリストを基に、2003年（平成15年）5月に『改訂・日本の絶滅のおそれのある野生生物 -レッドデータブック- 4 汽水・淡水魚類』が作成された^[2]。さらに、2007年（平成19年）8月3日に最新のレッドリスト（2007年版）が公表された^[3]。

1991年版では48種（亜種を含む、以下同じ）、1999年版では110種、2007年版では230種と、掲載種数は増加している。ただしこれは、最新の研究の結果により分類が変更されたこと（それまでは別（亜）種と考えられていたものが、同（亜）種であると改められる等）や、評価単位が変更されたこと（種単位で評価していた分類群を亜種単位での評価に変える等）などによる部分があるので、掲載種数の増加が単純に絶滅危惧種の増加を示すとは言えないことに注意する必要がある。

環境省では、汽水・淡水魚類の評価対象種として、約400種を選定しているが、これには下記の要件がある^[3]。

1. 分類上亜種に細分される場合は原則として亜種を評価の対象とする。
   1. 学名を伴わなくとも、実体が1分類群として論文等により明確に定義付けられている場合は評価の対象とする。
   2. 亜種レベルに満たないグループ、種内変異であるサツキマス、イワメ等、亜種名が存在しても分類上の議論がある種は、単独での選定評価は行わない。
2. 淡水河川・湖沼から汽水域に生息する魚類を対象とする。海産魚類は対象外。
3. 海外から導入された種および他地域から導入された種は対象から除く。
   1. ただし、導入かどうかの判断が困難な場合は対象とする（例：タウナギ、タイワンキンギョ）。

リストおよびカテゴリーの変遷

汽水・淡水魚類の絶滅危惧（絶滅のおそれのある種）の数は、1991年版では22種、1999年版では76種、2007年版では144種となり、増加している。汽水・淡水魚類の評価対象種は約400種なので、2007年版では、約36%が絶滅危惧である。

1991年版から1999年版でカテゴリーランク外からの新掲載種は49種であり、そのうち30種はハゼ類である。これは、ハゼ類に関する知見が増えた事や、ハゼ類の分布範囲が狭く生息数が減少しやすい事が理由である^[1]。

1999年版から2007年版への改訂で、評価対象種にカワボラ等の南西諸島の種を加えて、約300種から約400種に増加したが、絶滅のおそれのある種も76種増加した。また、田園地帯を生息地とする種のカテゴリーランクが上昇し、そのような生息環境が悪化していることが示唆された。琵琶湖のニゴロブナやゲンゴロウブナが掲載されたが、これはブラックバス（オオクチバス等）外来種の影響が考えられる。メダカやドジョウ類は新知見に基づき評価したほか、チョウザメについても評価対象とし絶滅にカテゴリーした^[3]。

ヤツメウナギ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（ヤツメウナギ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
ヤツメウナギ科
スナヤツメ北方種	Lethenteron sp. 1	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類	1999年版では「スナヤツメL. reissneri」で評価した。
スナヤツメ南方種	Lethenteron sp. 2	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類	1999年版では「スナヤツメLethenteron reissneri」で評価した。
カワヤツメ	Lethenteron japonicum	-	-	絶滅危惧II類
シベリアヤツメ	Lethenteron kessleri	希少種	準絶滅危惧	準絶滅危惧
栃木県のミツバヤツメ	Entosphenus tridentatus	-	情報不足	地域個体群	1999年版では「ミツバヤツメ」で評価した。
ユウフツヤツメ	Lampetra tridentata	希少種	-	-

チョウザメ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（チョウザメ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
チョウザメ科
チョウザメ	Acipenser medirostris	-	-	絶滅

ウナギ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（ウナギ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	2017年版	備考
ウナギ科
ニホンウナギ	Anguilla japonica	-	-	情報不足	絶滅危惧IB類[注 1]
ニューギニアウナギ	Anguilla bicolor pacifica	-	-	情報不足	情報不足
ウツボ科
コゲウツボ	Uropterygius concolor	-	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ナミダカワウツボ	Echidna rhodochilus	-	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類

ニシン目

汽水・淡水魚類レッドリスト（ニシン目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
カタクチイワシ科
エツ	Coilia nasus	希少種 地域個体群	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類	1991年版では「エツ」と「佐賀県六角川のエツ個体群」に分けて評価した。
ニシン科
ドロクイ	Nematalosa japonica	-	-	絶滅危惧IB類
太平洋側湖沼系群のニシン	Clupea pallasii	-	-	地域個体群

コイ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（コイ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
ドジョウ科
スジシマドジョウ小型種山陽型	Cobitis sp., S San-yo form	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類	1999年版では「スジシマドジョウ小型種」で評価した。
アユモドキ	Leptobotia curta	絶滅危惧種	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
イシドジョウ	Cobitis takatsuensis	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
ヒナイシドジョウ	Cobitis shikokuensis	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	1999年版では「イシドジョウ」に含められていた（2006年11月に新種記載）。
スジシマドジョウ大型種	Cobitis sp. L	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧IB類
スジシマドジョウ小型種東海型	Cobitis sp., S Tokai form	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	1999年版では「スジシマドジョウ小型種」で評価した。
スジシマドジョウ小型種琵琶湖型（淀川個体群を含む）	Cobitis sp., S Biwako form	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	1999年版では「スジシマドジョウ小型種」で評価した。
スジシマドジョウ小型種山陰型	Cobitis sp., S San-in form	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	1999年版では「スジシマドジョウ小型種」で評価した。
スジシマドジョウ小型種九州型	Cobitis sp., S Kyushu form	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	1999年版では「スジシマドジョウ小型種」で評価した。
エゾホトケドジョウ	Lefua nikkonis	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧IB類
ホトケドジョウ	Lefua echigonia	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
ナガレホトケドジョウ	Lefua sp.	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
アジメドジョウ	Niwaella delicata	-	地域個体群	絶滅危惧II類	1999年版では「大阪府のアジメドジョウ」で評価した。
ヤマトシマドジョウ	Cobitis matsubarae	-	-	絶滅危惧II類
スジシマドジョウ中型種	Cobitis sp. M	-	-	絶滅危惧II類
コイ科
スワモロコ	Gnathopogon elongatus suwae	-	絶滅	絶滅
ミヤコタナゴ	Tanakia tanago	絶滅危惧種	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
イチモンジタナゴ	Acheilognathus cyanostigma	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類
イタセンパラ	Acheilognathus longipinnis	絶滅危惧種	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
セボシタビラ	Acheilognathus tabira nakamurae	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧IA類
ゼニタナゴ	Acheilognathus typus	希少種	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類
ニッポンバラタナゴ	Rhodeus ocellatus kurumeus	絶滅危惧種	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
スイゲンゼニタナゴ	Rhodeus atremius suigensis	絶滅危惧種	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ヒナモロコ	Aphyocypris chinensis	絶滅危惧種	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
シナイモツゴ	Pseudorasbora pumila pumila	希少種	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類
ウシモツゴ	Pseudorasbora pumila subsp.	絶滅危惧種	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
アブラヒガイ	Sarcocheilichthys biwaensis	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類
ホンモロコ	Gnathopogon caerulescens	-	-	絶滅危惧IA類
ゲンゴロウブナ	Carassius cuvieri	-	-	絶滅危惧IB類
ニゴロブナ	Carassius auratus grandoculis	-	-	絶滅危惧IB類
タナゴ	Acheilognathus melanogaster	-	準絶滅危惧	絶滅危惧IB類
シロヒレタビラ	Acheilognathus tabira tabira	-	-	絶滅危惧IB類
山陰地方のアカヒレタビラ	Acheilognathus tabira subsp.	-	地域個体群	絶滅危惧IB類
カゼトゲタナゴ	Rhodeus atremius atremius	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧IB類
ワタカ	Ischikauia steenackeri	-	-	絶滅危惧IB類
カワバタモロコ	Hemigrammocypris rasborella	地域個体群	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	1991年版では「静岡県のカワバタモロコ個体群」で評価した。
ウケクチウグイ	Tribolodon nakamurai	危急種	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
ハス	Opsariichthys uncirostris uncirostris	-	-	絶滅危惧II類
ツチフキ	Abbottina rivularis	-	-	絶滅危惧II類
デメモロコ	Squalidus japonicus japonicus	-	-	絶滅危惧II類
キンブナ	Carassius auratus subsp. 2	-	-	準絶滅危惧
ヤリタナゴ	Tanakia lanceolata	-	-	準絶滅危惧
アブラボテ	Tanakia limbata	-	-	準絶滅危惧
ヤチウグイ	Phoxinus percnurus sachalinensis	-	準絶滅危惧	準絶滅危惧
カワヒガイ	Sarcocheilichthys variegatus	-	-	準絶滅危惧
スゴモロコ	Squalidus chankaensis biwae	-	-	準絶滅危惧
フナ属の1種（沖縄諸島産）	Carassius sp.	-	-	情報不足
ナガブナ	Carassius auratus subsp. 1	-	-	情報不足
ヤマナカハヤ	Phoxinus lagowskii yamamotis	-	情報不足	情報不足
琵琶湖のコイ野生型	Cyprinus carpio	-	-	地域個体群
本州日本海側のマルタウグイ	Tribolodon brandti	-	-	地域個体群
東北地方のエゾウグイ	Tribolodon sachalinensis	-	-	地域個体群

ナマズ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（ナマズ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
ナマズ科
イワトコナマズ	Silurus lithophilus	-	-	準絶滅危惧
ギギ科
ネコギギ	Pseudobagrus ichikawai	絶滅危惧種	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
ギバチ	Pseudobagrus tokiensis	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類
アリアケギバチ	Pseudobagrus aurantiacus	絶滅危惧種	準絶滅危惧	準絶滅危惧	1991年版では「九州産ギバチ P. sp.」で評価した。
アカザ科
アカザ	Liobagrus reini	地域個体群	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類	1991年版では「九州のアカザ個体群」で評価した。

サケ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（サケ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
サケ科
クニマス	Oncorhynchus nerka kawamurae	絶滅種	絶滅	絶滅	2010年、西湖にて生息を確認。
ベニザケ（ヒメマス）	Oncorhynchus nerka nerka	-	-	絶滅危惧IA類
イトウ	Hucho perryi	危急種	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
オショロコマ	Salvelinus malma krascheninnikovi	希少種	準絶滅危惧	絶滅危惧II類
ミヤベイワナ	Salvelinus malma miyabei	希少種	準絶滅危惧	絶滅危惧II類
ゴギ	Salvelinus leucomaenis imbrius	危急種	地域個体群	絶滅危惧II類	1999年版では「西中国地方のイワナ（ゴギ）」で評価した。
サクラマス（ヤマメ）	Oncorhynchus masou masou	-	-	準絶滅危惧
サツキマス（アマゴ）	Oncorhynchus masou ishikawae	絶滅危惧種	-	準絶滅危惧
ビワマス	Oncorhynchus masou subsp.	希少種	準絶滅危惧	準絶滅危惧
ニッコウイワナ	Salvelinus leucomaenis pluvius	-	-	情報不足
紀伊半島のヤマトイワナ（キリクチ）	Salvelinus leucomaenis japonicus	絶滅危惧種	地域個体群	地域個体群	1991年版では「キリクチ」で評価した。
イワメ	Oncorhynchus iwame	絶滅危惧種	-	-

キュウリウオ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（キュウリウオ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
アユ科
リュウキュウアユ	Plecoglossus altivelis ryukyuensis	絶滅危惧種	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
シラウオ科
アリアケシラウオ	Salanx ariakensis	絶滅危惧種	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
アリアケヒメシラウオ	Neosalanx reganius	絶滅危惧種	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
キュウリウオ科
イシカリワカサギ	Hypomesus olidus	-	情報不足	準絶滅危惧
襟裳岬以西のシシャモ	Spirinchus lanceolatus	-	-	地域個体群

タウナギ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（タウナギ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
タウナギ科
タウナギ	Monopterus sp.	地域個体群	地域個体群	絶滅危惧IB類	1999年版までは、沖縄島のタウナギで評価。

ボラ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（ボラ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
ボラ科
カワボラ	Cestraeus plicatilis	-	-	絶滅危惧IA類
ナガレフウライボラ	Crenimugil heterocheilos	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧IB類
アンピンボラ	Chelon subviridis	-	-	情報不足
オニボラ	Ellochelon vaigiensis	-	-	情報不足
カマヒレボラ	Moolgarda pedaraki	-	-	情報不足
モンナシボラ	Moolgarda engeli	-	-	情報不足

ダツ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（ダツ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
メダカ科
メダカ北日本集団	Oryzias latipes subsp.	地域個体群	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類	1991年版では「沖縄のメダカ個体群」で、1999年版では種「メダカ」で評価した。
メダカ南日本集団	Oryzias latipes latipes	地域個体群	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類	1991年版では「沖縄のメダカ個体群」で、1999年版では種「メダカ」で評価した。
サヨリ科
コモチサヨリ	Zenarchopterus dunckeri	-	-	準絶滅危惧
クルメサヨリ	Hyporhamphus intermedius	-	-	準絶滅危惧

トゲウオ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（トゲウオ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
トゲウオ科
ミナミトミヨ	Pungitius kaibarae	絶滅種	絶滅	絶滅
ハリヨ	Gasterosteus aculeatus leiurus	危急種	地域個体群	絶滅危惧IA類	1999年版では「福島以南の陸封イトヨ類（ハリヨを含む）」で評価した。
ムサシトミヨ	Pungitius sp. 1	絶滅危惧種	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
トミヨ属雄物型	Pungitius sp. 2	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	1999年版では「イバラトミヨ雄物型」で評価した。
トミヨ属汽水型	Pungitius sp. 3	-	-	準絶滅危惧
エゾトミヨ	Pungitius tymensis	希少種	準絶滅危惧	準絶滅危惧
福島県以南の陸封イトヨ太平洋型	Gasterosteus aculeatus aculeatus	地域個体群	地域個体群	地域個体群	1991年版では「福島県会津のイトヨ個体群（地域個体群）」および「福井県大野盆地のイトヨ個体群（地域個体群）」で、1999年版では「福島以南の陸封イトヨ類（ハリヨを含む）」で評価した。
本州のイトヨ日本海型	Gasterosteus aculeatus aculeatus	-	-	地域個体群
本州のトミヨ属淡水型	Pungitius pungitius	-	-	地域個体群

ヨウジウオ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（ヨウジウオ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
ヨウジウオ科
ホシイッセンヨウジ	Microphis (Coelonotus) argulus	-	-	絶滅危惧IA類
タニヨウジ	Microphis (Lophocampus) retzii	-	-	絶滅危惧IA類
ヒメテングヨウジ	Microphis (Oostethus) jagorii	-	-	絶滅危惧IA類

フグ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（フグ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
フグ科
沖縄島のクサフグ	akifugu niphobles	-	-	地域個体群

カサゴ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（カサゴ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
ハオコゼ科
アゴヒゲオコゼ	Tetraroge barbata	-	-	絶滅危惧IA類
ヒゲソリオコゼ	Tetraroge niger	-	-	絶滅危惧IA類
カジカ科
ヤマノカミ	Trachidermus fasciatus	危急種	絶滅危惧II類	絶滅危惧IB類
カジカ小卵型	Cottus reinii	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧IB類	1999年版では和名は「ウツセミカジカ」。
カジカ中卵型	Cottus sp.	-	-	絶滅危惧IB類
カマキリ（アユカケ）	Cottus kazika	-	-	絶滅危惧II類
カジカ大卵型	Cottus pollux	-	-	準絶滅危惧
東北・北陸地方のカンキョウカジカ	Cottus hangiongensis	-	-	地域個体群
東北地方のハナカジカ	Cottus nozawae	-	地域個体群	地域個体群

スズキ目

汽水・淡水魚類レッドリスト（スズキ目）

和名	学名	1991年版	1999年版[2]	2007年版	2017年版	備考
アカメ科
アカメ	Lates japonicus	希少種	準絶滅危惧	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
イサキ科
ダイダイコショウダイ	Plectorhinchus albovittatus	-	-	情報不足	情報不足
キス科
アオギス	Sillago parvisquamis	-	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
アトクギス	Sillaginops macrolepis	-	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
シマイサキ科
ヨコシマイサキ	Mesopristes cancellatus	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ニセシマイサキ	Mesopristes argenteus	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
シミズシマイサキ	Mesopristes iravi	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ペルキクティス科
オヤニラミ	Coreoperca kawamebari	希少種	準絶滅危惧	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類
タイ科
ナンヨウチヌ	Acanthopagrus berda	-	-	準絶滅危惧	絶滅危惧Ⅱ類
スズキ科
有明海のスズキ	Lateolabrax japonicus	-	-	地域個体群	地域個体群
ハゼ科
北海道南部・東北地方のスミウキゴリ	Gymnogobius petschiliensis	-	-	地域個体群	地域個体群
タカサゴイシモチ科
ナンヨウタカサゴイシモチ	Ambassis interrupta	-	-	絶滅危惧II類	情報不足
テッポウウオ科
テッポウウオ	Toxotes jaculatrix	-	-	情報不足	絶滅危惧IA類
テンジクダイ科
カガミテンジクダイ	Yarica hyalosoma	-	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ハナダカタカサゴイシモチ	Ambassis macracanthus	-	-	情報不足	情報不足
ワキイシモチ	Fibramia lateralis	-	-	情報不足	情報不足
ヒルギヌメリテンジクダイ	Pseudamia amblyuroptera	-	-	情報不足	情報不足
フエダイ科
ウラウチフエダイ	Lutjanus goldiei	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ユゴイ科
トゲナガユゴイ	Kuhlia munda	-	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
ヘビギンポ科
ウラウチヘビギンポ	Enneapterygius cheni	-	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
イソギンポ科
ヒルギギンポ	Omox biporos	-	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
カワギンポ	Omobranchus ferox	-	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ゴマクモギンポ	Omobranchus elongatus	-	-	情報不足	情報不足
ネズッポ科
ナリタイトヒキヌメリ	Pseudocalliurichthys ikedai	-	-	情報不足	情報不足
ツバサハゼ科
ツバサハゼ	Rhyacichthys aspro	希少種	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
カワアナゴ科
オウギハゼ	Bunaka gyrinoides	-	-	情報不足	準絶滅危惧	2015年版までの和名は「カワアナゴ科の1種」
ハゼ科
トカゲハゼ	Scartelaos histophorus	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ヨロイボウズハゼ	Lentipes armatus	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
カエルハゼ	Smilosicyopus leprurus	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
アカボウズハゼ	Sicyopus zosterophorus	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ハヤセボウズハゼ	Stiphodon imperiorientis	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
コンテリボウズハゼ	Stiphodon atropurpureus	-	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ドウクツミミズハゼ	Luciogobius albus	希少種	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ミスジハゼ	Callogobius sp.	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ウラウチイソハゼ	Eviota ocellifer	-	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
シマサルハゼ	Oxyurichthys sp. 2	-	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ヒメトサカハゼ	Cristatogobius aurimaculatus	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
クロトサカハゼ	Cristatogobius nonatoae	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
イサザ	Gymnogobius isaza	-	準絶滅危惧	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
キセルハゼ	Gymnogobius cylindricus	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IB類
アゴヒゲハゼ	Glossogobius bicirrhosus	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
コンジキハゼ	Glossogobius aureus	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
カワクモハゼ	Bathygobius sp.	-	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ホホグロハゼ	Mugilogobius parvus	-	-	絶滅危惧IA類	準絶滅危惧
オガサワラヨシノボリ	Rhinogobius sp. BI	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IB類
コマチハゼ	Parioglossus taeniatus	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ヒメサツキハゼ	Parioglossus interruptus	-	-	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類
ヤエヤマノコギリハゼ	Butis amboinensis	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類
ヒスイボウズハゼ	Stiphodon alcedo	-	-	-	絶滅危惧IA類	2017年版新規掲載
ジャノメハゼ	Bostrychus sinensis	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
タナゴモドキ	Hypseleotris cyprinoides	希少種	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
タメトモハゼ	Giuris sp. 1	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
タビラクチ	Apocryptodon punctatus	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	絶滅危惧II類
ムツゴロウ	Boleophthalmus pectinirostris	危急種	絶滅危惧II類	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
チワラスボ	Taenioides cirratus	-	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
ルリボウズハゼ	Sicyopterus lagocephalus	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	絶滅危惧II類
トサカハゼ	Cristatogobius lophius	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
クボハゼ	Gymnogobius scrobiculatus	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
ジュズカケハゼ	Gymnogobius castaneus	-	地域個体群	絶滅危惧IB類	準絶滅危惧	2015年版では「ジュズカケハゼ広域分布種（Gymnogobius sp. "Widely-distributed species"）
コシノハゼ	Gymnogobius nakamurae	-	地域個体群	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類	2015年版では「ジュズカケハゼ鳥海山周辺固有種（Gymnogobius sp. "Chokai-endemic species"）
ホクリクジュズカケハゼ	Gymnogobius sp. 2	-	地域個体群	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類	2015年版では「ジュズカケハゼ富山固有種Gymnogobius sp. "Toyama-endemic species"」
ムサシノジュズカケハゼ	Gymnogobius sp. 1	-	地域個体群	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	2015年版では「ジュズカケハゼ関東固有種Gymnogobius sp. "Kanto-endemic species"」
シマエソハゼ	Schismatogobius ampluvinculus	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
エソハゼ	Schismatogobius roxasi	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
マングローブゴマハゼ	Pandaka lidwilli	-	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧II類
アオバラヨシノボリ	Rhinogobius sp. BB	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IA類
キバラヨシノボリ	Rhinogobius sp. YB	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
コビトハゼ	Parioglossus rainfordi	-	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧IB類
ホシマダラハゼ	Ophiocara porocephala	-	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類
アサガラハゼ	Caragobius urolepis	-	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類	2015版学名は「Brachyamblyopus anotus」
ワラスボ	Odontamblyopus lacepedii	-	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類
ヒゲワラスボ	Trypauchenopsis intermedia	-	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類	2015版学名は「Taenioides limicola」
シロウオ	Leucopsarion petersii	-	準絶滅危惧	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類
ミナミヒメミミズハゼ	Luciogobius sp.	-	地域個体群	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類	1999年版では「琉球列島のミミズハゼ」で評価した。
エドハゼ	Gymnogobius macrognathos	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類
チクゼンハゼ	Gymnogobius uchidai	-	絶滅危惧IB類	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類
シンジコハゼ	Gymnogobius taranetzi	希少種	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類
ハゼクチ	Acanthogobius hasta	-	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類
ミナミアシシロハゼ	Acanthogobius insularis	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類
マサゴハゼ	Pseudogobius masago	-	地域個体群	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類	1999年版では「沖縄島のマサゴハゼ」で評価した。
キララハゼ	Acentrogobius viridipunctatus	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類
ゴマハゼ	Pandaka sp.	-	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類
ボルネオハゼ	Parioglossus palustris	-	-	絶滅危惧II類	絶滅危惧II類
ゴシキタメトモハゼ	Giuris sp. 2	-	-	準絶滅危惧	絶滅危惧IB類
トビハゼ	Periophthalmus modestus	-	地域個体群	準絶滅危惧	準絶滅危惧	1999年版では「東京湾奥部のトビハゼ」および「沖縄島のトビハゼ」で評価した。
イドミミズハゼ	Luciogobius pallidus	希少種	情報不足	準絶滅危惧	準絶滅危惧
ヒモハゼ	Eutaeniichthys gilli	-	-	準絶滅危惧	準絶滅危惧
ホクロハゼ	Acentrogobius caninus	-	-	準絶滅危惧	準絶滅危惧
トウカイヨシノボリ	Rhinogobius sp. TO	-	-	準絶滅危惧	準絶滅危惧
ショウキハゼ	Tridentiger barbatus	-	-	準絶滅危惧	準絶滅危惧
イシドンコ	Odontobutis hikimius	-	-	情報不足	絶滅危惧II類
エリトゲハゼ	Belobranchus belobranchus	-	-	情報不足	情報不足
カキイロヒメボウズハゼ	Stiphodon surrufus	-	-	情報不足	情報不足
ネムリミミズハゼ	Luciogobius dormitoris	-	情報不足	情報不足	情報不足
ドウケハゼ	Stenogobius ophthalmoporus	-	-	情報不足	情報不足
ヘビハゼ	Gymnogobius mororanus	-	-	情報不足	情報不足
スダレウロハゼ	Glossogobius circumspectus	-	-	情報不足	準絶滅危惧
フタゴハゼ	Glossogobius sp.	-	-	情報不足	情報不足
コクチスナゴハゼ	Pseudogobius gastrospilos	-	-	情報不足	情報不足
ニセシラヌイハゼ	Silhouettea sp.	-	-	情報不足	準絶滅危惧
シラヌイハゼ	Silhouettea dotui	-	-	情報不足	準絶滅危惧
タスキヒナハゼ	Redigobius balteatus	-	絶滅危惧IA類	情報不足	情報不足
フタホシハゼ	Mugilogobius fuscus	-	-	情報不足	情報不足
ムジナハゼ	Mugilogobius mertoni	-	-	情報不足	絶滅危惧II類
ニセツムギハゼ	Acentrogobius audax	-	-	情報不足	準絶滅危惧
ホホグロスジハゼ	Acentrogobius suluensis	-	-	情報不足	準絶滅危惧
ギンポハゼ	Parkraemeria saltator	-	-	情報不足	絶滅危惧II類
ビワヨシノボリ	Rhinogobius sp. BW	-	-	情報不足	情報不足
ナミノコハゼ	Gobitrichinotus radiocularis	-	-	情報不足	準絶滅危惧
トンガスナハゼ	Kraemeria tongaensis	-	-	情報不足	情報不足
マイコハゼ	Parioglossus lineatus	-	絶滅危惧IA類	情報不足	情報不足
ニライカナイボウズハゼ	Stiphodon niraikanaiensis	-	-	-	情報不足	2017年版新規掲載
トラフボウズハゼ	Stiphodon multisquamus	-	-	-	情報不足	2017年版新規掲載
ゴクラクギョ科
タイワンキンギョ	Macropodus opercularis	希少種	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類	絶滅危惧IA類

総計

汽水・淡水魚類レッドリストの総計

カテゴリー	1991年版	1999年版[2]	2007年版	備考
絶滅 （絶滅種に相当）	2	3	4
野生絶滅	-	0	0
絶滅危惧IA類	-	29	61
絶滅危惧IB類	-	29	48
絶滅危惧I類 （絶滅危惧種に相当）	16	58	109	絶滅危惧IA類と絶滅危惧IB類の合計
絶滅危惧II類 （危急種に相当）	6	18	35
絶滅危惧	22	76	144	絶滅のおそれのある種 絶滅危惧I類と絶滅危惧II類の合計
準絶滅危惧 （希少種に相当）	17	12	26
情報不足	-	5	39
地域個体群	7	12	17
合計	48	108	230

※計数は、発表された当時の各レッドリストの掲載種の数であり、表内のカテゴリーの数と計数が一致しないことがある。これは、レッドリストの見直しに伴い評価単位である分類群（種や亜種、地域個体群等）を変更することがあり、本表ではそれらの変遷も追えるように作成されているためである。これらについては備考を参照のこと。