En 1904, il se marie avec Hélène Glasson dont il a un fils, Michel Guinier[4], et une fille Annette un de ses sujets préférés. En 1907, il est lauréat du prix Henner.
Excellent pastelliste et brillant coloriste, il peint de nombreux portraits, essentiellement féminins. Il exécute aussi des paysages, des scènes marines souvent inspirées par la Bretagne dont il peint les costumes et les paysages, principalement la région de Concarneau et le Pays Bigouden, mais aussi au Faouët, à Vannes, à Paimpol et à l'île de Bréhat[7]. Il aborde avec succès tous types de sujets: l'allégorie, le nu, la scène de genre, le portrait, le paysage. Il séjourne en Italie, en Hollande, dans les Alpes et dans les Pyrénées[8]. «C'est l'un de ces peintres bourgeois, vivant confortablement de tableaux de commande, qui, une fois en vacances, peignent uniquement par plaisir, au gré des promenades et des coups de cœur» écrit Françoise Gloux, galeriste[3]. Henri Guinier bénéficie aussi de commandes officielles: en 1909, il participe avec d'autres peintres à la décoration de la mairie de Neuilly-sur-Seine, peignant La Tapisserie[9]. Il est probablement l'auteur de deux peintures murales situées à l'ENSAM[réf.nécessaire].
En 1914, au Salon des artistes français, il est salué pour son Portrait du lieutenant-colonel Rimailho, célèbre officier ayant perfectionné le canon de 75 mm et ayant conçu le canon de 155 court à tir rapide auquel il a donné son nom[10].
Durant la Première Guerre mondiale, Henri Guinier est non-mobilisable en raison de son âge. Il aurait alors contribué à la section camouflage mise en place par le peintre Lucien-Victor Guiraud de Scévola[10]. En avril 1917, l'artiste participe à la troisième mission des artistes aux Armées avec d'autres peintres tels que Charles-Frédéric Lauth, Bernard Naudin, André Devambez ou encore René Piot[11]. Leurs oeuvres, véritables témoignages de guerre, sont diffusées dans la presse mais aussi présentées lors d'exposition comme celle de juin 1917 au musée du Luxembourg qui a été commentée par le critique d'art Louis Vauxcelles[11]. Dans une vue de l'exposition, le panneau d'Henri Guinier présente de nombreux paysages tragiques ou des scènes de ruines[12]. En effet, l'artiste a réalisé de nombreux dessins et pastels ainsi qu'un ensemble de photographies sur le front à Verdun. À la suite de cette exposition, l'État se porte acquéreur de certains de ses tableaux comme Verdun, Froideterre, avril 1917[10] ou encore Le Bois de Vaux-Chapitre[13]. Après la guerre, Henri Guinier expose au Salon des artistes français de 1919 une allégorie de La France victorieuse.
À partir de 1920, passant désormais l'hiver à la montagne, il peint des paysages des régions de Pau et Argelès-Gazost ou encore de la vallée de Chamonix[14]. «Dans les dernières années de sa vie, il s'intéresse beaucoup au dessin, ne se contenant plus d'exprimer les jeux changeants de la lumière, mais s'attachant à la précision de la forme qu'il aime à ciseler» écrit Jean Vuillemin[15].
Les archives du peintre sont données par sa famille au musée départemental breton de Quimper en 2007. Le peintre fait l'objet d'une exposition temporaire au musée du Faouët (Morbihan) en 2008.
Dijon, musée de Dijon[Lequel ?]: Le Pardon de Sainte-Anne-d'Auray, 1902;
Ophélie (1er quart du 20e siècle), Reims, musée des Beaux-Arts.Joigny, musée de Joigny[18]: Le Christ pleuré par les Saintes Femmes, 1895, second prix de Rome[19];
Un Dimanche, enfants de Marie (1898), palais des Beaux-Arts de Lille (photo en noir et blanc par François Antoine Vizzavona).
La Fontaine miraculeuse, pardon des aveugles, chapelle de La Clarté à Combrit, Pays Bigouden (1914), musée départemental breton de Quimper.
Le vieux Terrien (Salon de 1921).
Vieille bretonne du Faouët (1910), huile sur toile, musée du Faouët.
Paysanne de Concarneau (vers 1920), musée départemental breton.
