PDZ domen

PDZ domen je zajednički strukturni domen sa 80-90 aminokiselina koji je nađen kod signalnih proteina bakterija, kvasca, biljki, virusa^[1] i životinja.^[2] PDZ je akronim formiran kombinovanjem prvih slova imena tri proteina — PSD95 (engleski: ), DlgA (engleski: ), i zo-1 (engleski: ) — za koje su prvo otkriveno da imaju zajednički domen. PDZ domeni su se ranije nazivali DHR (Dlg homolognim regionom)^[3] ili GLGF (glicin-leucin-glicin-fenilalanin) domenima. Ti domeni pomažu vezivanje transmembranskih proteina za citoskelet i drže na okupu signalne komplekse^[4].

Molekulska struktura PDZ domena uključujući ljudski GOPC (Goldži-vezani PDZ protein koji sadrži motiv upredene zavojnice)
Identifikatori
Simbol	PDZ
Pfam	PF00595
InterPro	IPR001478
SMART	PDZ
PROSITE	PDOC50106
SCOP	1lcy
Superfamilija	1lcy
Dostupne PDB strukture: Pfam structures PDB RCSB PDB; PDBe PDBsum strukturni pregled

PDZ domeni imaju sposobnost vezivanja za kratki region C-terminusa drugih specifičnih proteina. Ti kratki regioni se vezuju za PDZ domen putem augmentacije beta ravni. Beta ravan PDZ domena se uvećava dodatkom dodatnog beta lanaca iz vezanog proteina.^[5]

Proteini koji sadrže ovaj domen

PDZ domeni su nađeni kod više hiljada poznatih proteina^[6] Ti proteini su široko rasprostranjeni kod eukariota i eubakterija,^[7] dok ima veoma malo primera tih proteina kod Archaebacteria. PDZ domeni su često sa drugim proteinskim domenima i te kombinacije im omogućavaju da izvršavaju njihove specifične funkcije. Na primer za PDZ domene u PSD-95 proteinima je utvrđeno da su vezani sa SH3 domenom i guanilat kinaznim domenom.