| Governador |
Període de govern |
Notes |
| Miguel López de Legazpi | 27 d'abril de 1565 – 20 d'agost de 1572 | Conquistador. |
| Guido de Lavezaris | 20 d'agost de 1572 – 25 d'agost de 1575 | Tresorer de l'expedició de conquesta. |
| Francisco de Sande | 25 d'agost de 1575 – abril de 1580 | |
| Gonzalo Ronquillo de Peñalosa | abril 1580 – 10 de març de 1583 | Nomenat governador vitalici. |
| Diego Ronquillo | 10 de març de 1583 – 16 de maig de 1584 | Nebot de l'anterior. |
| Santiago de Vera | 16 de maig de 1584 – maig de 1590 | En 1584 s'establí la Reial Audiència. En 1590 Vera la abolió.[3] |
| Gómez Pérez das Mariñas | maig de 1590 – 25 d'octubre de 1593 | Morí assassinat. |
| Pedro de Rojas | 25 d'octubre 1593 – 3 de desembre de 1593 | Interií. Oïdor de la Reial Audiència. |
| Luis Pérez Dasmariñas | 3 de desembre 1593 – 14 de juliol de 1596 | Interí. Fill de Gómez Pérez das Mariñas. |
| Francisco Tello de Guzmán | 14 de juliol de 1596 – maig de 1602 | Es rehabilità la Reial Audiència per decret reial.[3] |
| Pedro Bravo de Acuña | maig de 1602 – 24 de juny de 1606 | Va morir en el càrrec. |
| Reial Audiència | 24 de juny de 1606 – 15 de juny de 1608 | Cristóbal Téllez de Almansa assumí el govern militar. |
| Rodrigo de Vivero y Aberrucia | 15 de juny de 1608 – abril de 1609 | |
| Juan de Silva | abril de 1609 – 19 d'abril de 1616 | Va morir en el càrrec. |
| Reial Audiència | 19 d'abril de 1616 – 18 de juny de 1618 | Andrés de Alcaraz assumí el govern militar. |
| Alonso Fajardo de Tenza | 18 de juny de 1618 – julio de 1624 | Va morir en el càrrec. |
| Reial Audiència | julio de 1624 – juny de 1625 | Jerónimo de Silva assumí el comandament militar. Durant el seu mandat, l'oïdor Jerónimo de Legazpi s'autoanomenà governador general. |
| Fernando de Silva | juny de 1625 – 29 de juny 1626 | |
| Juan Niño de Tabora | 29 de juny de 1626 – 22 de juliol de 1632 | Va morir en el càrrec. |
| Reial Audiència | 22 de juliol de 1632 – 1633 | Lorenzo de Olaza y Lecubarri assumí el govern militar. |
| Juan Cerezo de Salamanca | 1633 – 25 de juny de 1635 | |
| Sebastián Hurtado de Corcuera | 25 de juny de 1635 – 11 d'agost de 1644 | |
| Diego Fajardo Chacón | 11 d'agost de 1644 – 1 d'abril de 1654 | |
| Francisco Tabili | 1 d'abril de 1654 – 25 de juliol de 1654 | |
| Sabiniano Manrique de Lara | 25 de juliol de 1654 – 8 de setembre de 1663 | |
| Diego de Salcedo | 8 de setembre de 1663 – 28 de setembre de 1668 | Arrestat i deposat per la Inquisició. |
| Juan Manuel de la Peña Bonifaz | 28 de setembre de 1668 – 24 de setembre de 1669 | Oïdor de la Reial Audiència, assumí el govern en solitari. |
| Manuel de León | 24 de setembre de 1669 – 11 d'abril de 1677 | Va morir en el càrrec. |
| Reial Audiència | 11 d'abril de 1677 – 21 de setembre de 1677 | Francisco Coloma assumí el govern militar. Va morir. |
| 21 de setembre de 1677 – 28 de setembre de 1678 | Francisco de Sotomayor y Mansilla assumí el govern militar. |
| Juan de Vargas y Hurtado | 28 de setembre de 1678 – 24 d'agost de 1684 | |
| Gabriel de Curuzealegui y Arriola | 24 d'agost de 1684 – abril de 1689 | |
| Reial Audiència | abril de 1689 – juliol de 1690 | Alonso de Avila Fuertes assumí el govern militar. |
| Fausto Cruzat y Góngora | juliol de 1690 – 8 de desembre de 1701 | |
| Domingo Zabálburu de Echevarri | 8 de desembre de 1701 – 25 d'agost de 1709 | |
| Martín de Urzúa y Arizmendi | 25 d'agost de 1709 – 4 de febrer de 1715 | Va morir en el càrrec. |
| Reial Audiència | 4 de febrer de 1715 – 9 d'agost de 1717 | Jose Torralba assumí el comandament militar. |
| Fernando Manuel de Bustillo | 9 d'agost de 1717 – 11 d'octubre de 1719 | Assassinat. |
| Francisco de la Cuesta | 11 d'octubre de 1719 – 6 d'agost de 1721 | Arquebisbe de Manila. |
| Toribio José Cosio y Campo | 6 d'agost de 1721 – 14 d'agost de 1729 | |
| Fernando Valdés y Tamón | 14 d'agost de 1729 – juliol de 1739 | |
| Gaspar de la Torre | juliol de 1739 – 21 de setembre de 1745 | Va morir en el càrrec. |
| Juan Arrechederra | 21 de setembre de 1745 – 20 de juliol de 1750 | Arquebisbe de Manila. |
| Francisco José de Ovando y Solís | 20 de juliol de 1750 – juliol de 1754 | |
| Pedro Manuel de Arandía Santisteban | de juliol de 1754 – 31 de maig de 1761 | Va morir en el càrrec. |
| Miguel Lino de Ezpeleta | juny de 1759 – julio de 1761 | |
| Manuel Antonio Rojo del Río | julio de 1761 – 6 d'octubre de 1762 | Durant l'ocupació britànica de Manila en la guerra dels Set Anys, Rojo va ser capturat i Dawsonne Drake va governar la part britànica. Anda s'autoanomenà governador en Bacolor. |
| Simón de Anda y Salazar | 6 d'octubre de 1762 – 10 de febrer de 1764 |
| Francisco Javier de la Torre | 10 de febrer de 1764 – 6 de juliol de 1765 | Interí. |
| José Antonio Raón Gutiérrez | 6 de juliol de 1765 – julio de 1770 | |
| Simón de Anda y Salazar | julio de 1770 – 30 d'octubre de 1776 | Va morir en el càrrec. |
| Pedro de Sarrio | 30 d'octubre 1776 – julio de 1778 | 1r cop. Interí. |
| José Basco y Vargas | juliol de 1778 – 22 de novembre de 1787 | |
| Pedro de Sarrio | 22 de novembre de 1787 – 1 de juliol de 1788 | 2n cop. Interí. |
| Félix Berenguer de Marquina | 1 de juliol de 1788 – 1 de setembre de 1793 | |
| Rafael María de Aguilar y Ponce de León | 1 de setembre de 1793 – 7 d'agost de 1806 | Va morir en el càrrec. |
| Mariano Fernández de Folgueras | 7 d'agost de 1806 – 4 de març de 1810 | 1r cop. |
| Manuel Gonzalez de Aguilar | 4 de març de 1810 – 4 de setembre de 1813 | |
| José Ramón de Gardoqui y Jaraveitia | 4 de setembre de 1813 – 9 de desembre de 1816 | Va morir en el càrrec. |
| Mariano Fernández de Folgueras | 9 de desembre de 1816 – 30 d'octubre de 1822 | 2n cop. |
| Juan Antonio Martínez | 30 d'octubre de 1822 – 15 d'octubre de 1825 | |
| Mariano Ricafort Palacín y Abarca | 15 d'octubre de 1825 – 23 de desembre de 1830 | |
| Pascual Enrile y Alcedo | 23 de desembre de 1830 – 1 de març de 1835 | Interí como segundo en el mando militar. |
| Gabriel de Torres | 1 de març de 1835 – 23 d'abril de 1835 | Interí. |
| Joaquín de Crámer | 23 d'abril de 1835 – 9 de setembre de 1835 | Interí. |
| Pedro Antonio Salazar Castillo y Varona | 9 de setembre de 1835 – 27 d'agost de 1837 | |
| Andrés García Camba | 27 d'agost de 1837 – 29 de desembre de 1838 | |
| Luis Lardizábal | 29 de desembre de 1838 – 14 de febrer de 1841 | |
| Marcelino Oraá Lecumberri | 14 de febrer de 1841 – 17 de juny de 1843 | |
| Francisco de Paula Alcalá de la Torre | 17 de juny de 1843 – 16 de juliol de 1844 | |
| Narcís Claveria i Zaldua | 16 de juliol de 1844 – 26 de desembre de 1849 | |
| Antonio María Blanco | 26 de desembre de 1849 – 29 de juliol de 1850 | Interí. |
| Antonio de Urbistondo y Eguía | 29 de juliol de 1850 – 20 de desembre de 1853 | |
| Ramón Montero Blandino | 20 de desembre de 1853 – 2 de febrer de 1854 | 1r cop. Interí. |
| Manuel Pavía y Lacy | 2 de febrer de 1854 – 28 d'octubre de 1854 | |
| Ramón Montero Blandino | 28 d'octubre de 1854 – 20 de novembre de 1854 | 2n cop. Interí. |
| Manuel Crespo y Cebrián | 20 de novembre de 1854 – 5 de desembre de 1856 | Dimitió. |
| Ramón Montero y Blandino | 5 de desembre de 1856 – 9 de març de 1857 | 3ª vez. Interí. |
| Fernando Norzagaray y Escudero | 9 de març de 1857 – 12 de gener de 1860 | |
| Ramón María Solano Llanderal | 12 de gener de 1860 – 29 d'agost de 1860 | Va morir en el càrrec. |
| José MacCrohon y Blake | | Va morri quan viatjava des d'Espanya a ocupar el càrrec. |
| Juan Herrera Dávila | 29 d'agost de 1860 – 2 de febrer de 1861 | Inicià el seu mandat com a interí. |
| José Lemery e Ibarrola | 2 de febrer de 1861 – 7 de juliol de 1862 | |
| Salvador Valdés | 7 de juliol de 1862 – 9 de juliol de 1862 | Interí. |
| Rafael Echagüe y Bermingham | 9 de juliol de 1862 – 24 de març de 1865 | |
| Joaquín del Solar e Ibáñez | 24 de març de 1865 – 25 d'abril de 1865 | 1r cop. Interí. |
| Juan de Lara e Irigoyen | 25 d'abril de 1865 – 9 de gener de 1866 | |
| Manuel Rodríguez-Fito y Bueno | 9 de gener de 1866 – 19 de novembre de 1867 | |
| José de la Gándara y Navarro | 19 de novembre de 1867 – 7 de juny de 1869 | |
| Manuel Maldonado | 7 de juny de 1869 – 23 de juny de 1869 | Interí. |
| Carlos María de la Torre y Navacerrada | 23 de juny de 1869 – 4 d'abril de 1871 | |
| Rafael Izquierdo Gutiérrez | 4 d'abril de 1871 – 8 de gener de 1873 | Dimití per motius de salut. |
| Manuel MacCrohon | 8 de gener de 1873 – 24 de gener de 1873 | Interí. |
| Juan Alaminos y Vivar | 24 de gener de 1873 – 17 de març de 1874 | |
| Manuel Blanco Valderrama | 17 de març de 1874 – 18 de juny de 1874 | Inicià el seu mandat com a interí. |
| José Malcampo y Monge | 18 de juny de 1874 – 28 de febrer de 1877 | |
| Domingo Moriones i Murillo | 28 de febrer de 1877 – 20 de març de 1880 | |
| Rafael Rodríguez Arias | 20 de març de 1880 – 15 d'abril de 1880 | Interí. |
| Fernando Primo de Rivera | 15 d'abril de 1880 – 10 de març de 1883 | 1r cop |
| Emilio Molíns | 10 de març de 1883 – 7 d'abril de 1883 | Interí, 1r cop. |
| Joaquim Jovellar i Soler | 7 d'abril de 1883 – 1 d'abril de 1885 | |
| Emilio Molíns | 1 d'abril de 1885 – 4 d'abril de 1885 | Interí, 2n cop. |
| Emilio Terrero y Perinat | 4 d'abril de 1885 – 1888 | |
| Antonio Molto | 1888 – 1888 | Interí. |
| Federico Lobatón | 1888 – 1888 | Interí. |
| Valerià Weyler i Nicolau | 1888 – 1891 | |
| Eulogio Despujol y Dusay | 1891 – 1893 | |
| Federico Ochando | 1893 – 1893 | Interí. |
| Ramón Blanco y Erenas | 1893 – 13 de desembre de 1896 | |
| Camilo García de Polavieja | 13 de desembre de 1896 – 15 d'abril de 1897 | |
| José de Lachambre | 15 d'abril de 1897 – 23 d'abril de 1897 | Interí. |
| Fernando Primo de Rivera | 23 d'abril de 1897 – 11 d'abril de 1898 | 2n cop. |
| Basilio Augustín y Dávila | 11 d'abril de 1898 – 24 de juliol de 1898 | |
| Fermín Jáudenes y Álvarez | 24 de juliol de 1898 – 13 d'agost de 1898 | Interí. |
| Francisco Rizzo | 13 d'agost de 1898 – 13 d'agost de 1898 | Interí. |
| Diego de los Ríos y Nicolau | 13 d'agost de 1898 – 10 de desembre de 1898 | Interí. |