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共同利用・共同研究拠点（きょうどうりよう・きょうどうけんきゅうきょてん、英語: Joint Usage / Research Center）とは、日本の国公私立大学の附置研究所・施設のうち、大学の枠を越えて全国の研究者が共同利用できる拠点。文部科学省研究振興局によって、日本全体の学術研究レベルの向上を目指す観点から認定が行われる。共同利用・共同研究拠点に認定されると、設備の整備や共同利用に係る経費について、国から重点的に予算配分が行われる。共同利用・共同研究拠点を除く各大学の研究所・施設については、各大学の運営に任され、国からの直接の関与は行われない。
2022年4月1日現在、59大学107拠点が認定されている[1]。
2008年7月に学校教育法施行規則が改正され、当システムがスタートした。2008年7月以前は、国立大学の附置研究所・施設のみを対象として、全国共同利用型附置研究所、全国共同利用型研究施設という名称で、同様の予算の重点配分システムが運用されていた。
また、2018年度から国際的にも有効かつ質の高い研究資源等を最大限活用している共同利用・共同研究拠点を、国際共同利用・共同研究拠点として認定している。
※ 2022年4月1日現在
☆は国際共同利用・共同研究拠点（英語: International Joint Usage / Research Center）を表す。
国立大学
- 北海道大学
- 帯広畜産大学
- 原虫病研究センター
- 東北大学
- 筑波大学
- 計算科学研究センター
- つくば機能植物イノベーション研究センター
- ヒューマン・ハイ・パフォーマンス先端研究センター
- 群馬大学
- 生体調節研究所
- 千葉大学
- 環境リモートセンシング研究センター
- 真菌医学研究センター
- 東京大学
- 東京医科歯科大学
- 東京外国語大学
- 東京工業大学
- 一橋大学
- 新潟大学
- 金沢大学
- 名古屋大学
- 宇宙地球環境研究所
- 低温プラズマ科学研究センター
- 未来材料・システム研究所
- 京都大学
- 医生物学研究所
- ウイルス感染症・生命科学先端融合的共同研究拠点
- 再生医学・再生医療の先端融合的共同研究拠点
- エネルギー理工学研究所
- 化学研究所 ☆
- 基礎物理学研究所
- 経済研究所
- 人文科学研究所
- 数理解析研究所 ☆
- 生存圏研究所
- 生態学研究センター
- 東南アジア地域研究研究所
- 地域情報資源の共有化と相関型地域研究の推進拠点
- 東南アジア研究の国際共同研究拠点
- 複合原子力科学研究所
- 防災研究所
- 野生動物研究センター
- 医生物学研究所
- 大阪大学
- 鳥取大学
- 岡山大学
- 広島大学
- 放射光科学研究センター
- 徳島大学
- 先端酵素学研究所
- 愛媛大学
- 沿岸環境科学研究センター
- 地球深部ダイナミクス研究センター
- プロテオサイエンスセンター
- 高知大学
- 海洋コア総合研究センター
- 九州大学
- 佐賀大学
- 長崎大学
- 高度感染症研究センター
- 熱帯医学研究所
- 熊本大学
- 発生医学研究所
- 琉球大学
- 熱帯生物圏研究センター
- 熊本大学・富山大学（共同設置）先進軽金属材料国際研究機構
公立大学
私立大学
- 自治医科大学
- 先端医療技術開発センター
- 慶應義塾大学
- 昭和大学
- 発達障害医療研究所
- 玉川大学
- 脳科学研究所
- 東京工芸大学
- 風工学研究センター
- 東京農業大学
- 生物資源ゲノム解析センター
- 東京理科大学
- 総合研究院火災科学研究所
- 法政大学
- 明治大学
- 先端数理科学インスティテュート
- 早稲田大学
- 坪内博士記念演劇博物館
- 各務記念材料技術研究所
- 中部大学
- 中部高等学術研究所国際GISセンター
- 藤田医科大学
- 総合医科学研究所（現・医科学研究センター）
- 立命館大学
- アート・リサーチセンター ☆
- 京都芸術大学
- 舞台芸術研究センター
- 同志社大学
- 赤ちゃん学研究センター
- 大阪商業大学
- JGSS研究センター
- 関西大学
- ソシオネットワーク戦略研究機構
ネットワーク型拠点
- 学際大規模情報基盤共同利用・共同研究拠点
- 東京大学情報基盤センター ○
- 北海道大学情報基盤センター
- 東北大学サイバーサイエンスセンター
- 東京工業大学学術国際情報センター
- 名古屋大学情報基盤センター
- 京都大学学術情報メディアセンター
- 大阪大学サイバーメディアセンター
- 九州大学情報基盤研究開発センター
- 物質・デバイス領域共同研究拠点
- 生体医歯工学共同研究拠点
- 東京医科歯科大学生体材料工学研究所 ○
- 東京工業大学未来産業技術研究所
- 静岡大学電子工学研究所
- 広島大学ナノデバイス・バイオ融合科学研究所
- 放射線災害・医科学研究拠点
- 広島大学原爆放射線医科学研究所 ○
- 長崎大学原爆後障害医療研究所
- 福島県立医科大学ふくしま国際医療科学研究センター
- 放射能環境動態・影響評価ネットワーク共同研究拠点
- 触媒科学計測共同研究拠点
- 北海道大学触媒科学研究所 ○
- 大阪公立大学人工光合成研究センター
- 産業技術総合研究所触媒化学融合研究センター
- 糖鎖生命科学連携ネットワーク型拠点
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