From Wikipedia, the free encyclopedia
Protein FAM57B je protein koji je kod ljudi kodiran genom FAM57B.[5][6] Patricia Hartz (2013) mapirela ge gen FAM57B na poziciji 16p11.2 hromosoma 16, na osnovu poravnavanja sekvenci FAM57B (GenBank AL136777) sa genomskom sekvencom (GRCh37).
FAM57B | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
Aliasi | TLCD3B | ||||||||||||||||||||||||
Vanjski ID-jevi | OMIM: 615175 MGI: 1916202 HomoloGene: 69491 GeneCards: TLCD3B | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr 16: 30.02 – 30.05 Mb | Chr 7: 126.4 – 126.43 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
|
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 274 aminokiseline, a molekulska težina 30.629 Da.[7]
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLTPMVAGGV | VFPGLFLLSK | NTLQRLPQLR | WEEADAVIVS | ARLVSSVQAI | ||||
MASTAGYIVS | TSCKHIIDDQ | HWLSSAYTQF | AVPYFIYDIY | AMFLCHWHKH | ||||
QVKGHGGDDG | AARAPGSTWA | IARGYLHKEF | LMVLHHAAMV | LVCFPLSVVW | ||||
RQGKGDFFLG | CMLMAEVSTP | FVCLGKILIQ | YKQQHTLLHK | VNGALMLLSF | ||||
LCCRVLLFPY | LYWAYGRHAG | LPLLAVPLAI | PAHVNLGAAL | LLAPQLYWFF | ||||
LICRGACRLF | WPRSRPPPAC | QAQD |
Na osnovu eksperimenata na mišima, predviđa se da će FAM57B imati ulogu u sintezi keramida i adipogenez. Yamashita-Sugahara et al. (2013) klonirali su tri prerađene varijante mišjeg Fam57b koje su eksprimirane putem različitih promotora. Varijante 1 i 2 kodiraju proteine sa po 275 aminokiselina, ali njihove prve 42 aminokiseline se razlikuju. Varijanta 3 kodira izvedeni protein od 225 aminokiselina sa N-terminalnim skraćivanjem u odnosu na izoforme 1 i 2. Sve tri izoforme sadrže Tram-Lag1-CLN8 (TLC) domen. Izoforme 1 i 2 imaju po šest transmembranskih domena, a izoforma 3 ima ih pet. Kvantitativna RT-PCR analiza otkrila je varijabilnu ekspresiju varijanti Fam57b u tkivima miša. Varijanta 1 bila je visoko eksprimiranana u mozgu, varijanta 2 u testisima, sa znatno nižom ekspresijom u bijelom masnom tkivu, a varijanta 3 je bila slabo eksprimirana u testisima. Izoforma 1 lokalizirana je na Golgijevom aparatu, dok su izoforme 2 i 3nalaze u endoplazmatskom retikulumu.
Yamashita-Sugahara et al. (2013) uočili su pojačanu ekspresiju sve tri varijante Fam57b u mišjim ST2 i 3T3L1 ćelijama tokom diferencijacije adipocita. Pparg (, glavni regulator diferencijacije adipocita, direktno je regulirao ekspresiju Fam57b varijante 2 putem PPARG-odgovornog elementa (PPRE) u svojoj promotorskoj regiji. Prekomjerna ekspresija mišjih Fam57b varijanti 1 i 2 u ćelijama ST2 inhibirala je adipogenezu i povećala ukupni sadržaj keramida. Prekomjerno ispoljavanje Fam57b varijante 3 imalo je malo efekta. Izoforme Fam57b imale su jedinstvene učinke na keramide, s tim što je izoforma 1 blago povećavala sadržaj ćelija C18- i C20-keramida, a izoforma 2 sadržaj C16-, C18- i C20-keramida. Izoforma 3 imala je minimalan efekat na sintezu keramida.[8]
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.