Kalpain-1

Katalitska podjedinica kalpaina-1 (CANP 1) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom CAPN1 sa hromosoma 11.^[5][6][7]

Kalpain-1
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 1ZCM, 2ARY
Identifikatori
Aliasi	CAPN1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 114220 MGI: 88263 HomoloGene: 3800 GeneCards: CAPN1
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 11 (čovjek)[1] Bend 11q13.1 Početak 65,180,566 bp[1] Kraj 65,212,006 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 19 (miš)[2] Bend 19 A|19 4.34 cM Početak 6,038,573 bp[2] Kraj 6,065,927 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • cysteine-type peptidase activity • vezivanje iona metala • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • hydrolase activity • endopeptidase activity • calcium ion binding • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity Ćelijska komponenta • membrana • focal adhesion • intracellular anatomical structure • mitohondrija • Lizozom • Egzosom • citosol • extracellular region • citoplazma • ćelijska membrana • ficolin-1-rich granule lumen Biološki proces • extracellular matrix disassembly • receptor catabolic process • positive regulation of cell population proliferation • regulation of macroautophagy • mammary gland involution • neutrophil degranulation • GO:0048552 regulation of catalytic activity • cornification • self proteolysis • Proteoliza • regulation of NMDA receptor activity Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	823	12333
Ensembl	ENSG00000014216	ENSMUSG00000024942
UniProt	P07384	O35350
RefSeq (mRNK)	NM_001198868 NM_001198869 NM_005186	NM_001110504 NM_007600
RefSeq (bjelančevina)	NP_001185797 NP_001185798 NP_005177	NP_001103974 NP_031626
Lokacija (UCSC)	Chr 11: 65.18 – 65.21 Mb	Chr 19: 6.04 – 6.07 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 714 aminokiselina, a molekulska težina 81.890 Da.^[7]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MSEEIITPVY		CTGVSAQVQK		QRARELGLGR		HENAIKYLGQ		DYEQLRVRCL
QSGTLFRDEA		FPPVPQSLGY		KDLGPNSSKT		YGIKWKRPTE		LLSNPQFIVD
GATRTDICQG		ALGDCWLLAA		IASLTLNDTL		LHRVVPHGQS		FQNGYAGIFH
FQLWQFGEWV		DVVVDDLLPI		KDGKLVFVHS		AEGNEFWSAL		LEKAYAKVNG
SYEALSGGST		SEGFEDFTGG		VTEWYELRKA		PSDLYQIILK		ALERGSLLGC
SIDISSVLDM		EAITFKKLVK		GHAYSVTGAK		QVNYRGQVVS		LIRMRNPWGE
VEWTGAWSDS		SSEWNNVDPY		ERDQLRVKME		DGEFWMSFRD		FMREFTRLEI
CNLTPDALKS		RTIRKWNTTL		YEGTWRRGST		AGGCRNYPAT		FWVNPQFKIR
LDETDDPDDY		GDRESGCSFV		LALMQKHRRR		ERRFGRDMET		IGFAVYEVPP
ELVGQPAVHL		KRDFFLANAS		RARSEQFINL		REVSTRFRLP		PGEYVVVPST
FEPNKEGDFV		LRFFSEKSAG		TVELDDQIQA		NLPDEQVLSE		EEIDENFKAL
FRQLAGEDME		ISVKELRTIL		NRIISKHKDL		RTKGFSLESC		RSMVNLMDRD
GNGKLGLVEF		NILWNRIRNY		LSIFRKFDLD		KSGSMSAYEM		RMAIESAGFK
LNKKLYELII		TRYSEPDLAV		DFDNFVCCLV		RLETMFRFFK		TLDTDLDGVV
TFDLFKWLQL		TMFA

Funkcija

Kalpaini, neutralne proteaze aktivirane kalcijem, su nelizozomalne, unutarćelijskee cisteinskr proteaze. Kalpaini sisara uključuju sveprisutne proteine specifične za želudac i mišiće. Sveprisutni enzimi se sastoje od heterodimera s različitim velikim, katalitskim podjedinicama povezanim sa zajedničkom malom, regulatornom podjedinicom. Ovaj gen kodira veliku podjedinicu sveprisutnog enzima, kalpain-1.^[7]

Interakcije

Pokazalo se da CAPN1 reaguje sa PSEN2.^[8]