Ku70

Ku70 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom XRCC6sa hromosoma 22.^[5][6]

Ku70
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 1JEQ, 1JEY, 1JJR, 3RZX
Identifikatori
Aliasi	XRCC6
Vanjski ID-jevi	OMIM: 152690 MGI: 95606 HomoloGene: 37483 GeneCards: XRCC6
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 22 (čovjek)[1] Bend 22q13.2 Početak 41,621,163 bp[1] Kraj 41,664,048 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 15 (miš)[2] Bend 15 E1|15 38.33 cM Početak 81,872,036 bp[2] Kraj 81,924,286 bp[2]
Ontologija gena Molekularna funkcija • nucleotide binding • double-stranded telomeric DNA binding • telomeric DNA binding • GO:0008026 helicase activity • 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity • GO:0004003 DNA helicase activity • protein C-terminus binding • catalytic activity • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • lyase activity • hydrolase activity • ATP binding • vezivanje sa DNK • double-stranded DNA binding • oštećeno vezivanje sa DNK • vezivanje sa RNK • cyclin binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Ćelijska komponenta • citosol • nuclear telomere cap complex • membrana • transcription regulator complex • hromosom • nukleoplazma • nonhomologous end joining complex • jedro • Ku70:Ku80 complex • citoplazma • extracellular region • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • protein-DNA complex • Jedarce • GO:0009327 makromolekulani kompleks Biološki proces • double-strand break repair via classical nonhomologous end joining • protein heterotetramerization • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of smooth muscle cell proliferation • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • DNA ligation • establishment of integrated proviral latency • metabolizam • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • double-strand break repair via nonhomologous end joining • telomere maintenance • positive regulation of type I interferon production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • DNA duplex unwinding • GO:0100026 Popravka DNK • cellular hyperosmotic salinity response • brain development • DNA recombination • neutrophil degranulation • cellular response to gamma radiation • cellular response to X-ray • positive regulation of protein kinase activity • activation of innate immune response • immune system process • Urođeni imunski sistem Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	2547	14375
Ensembl	ENSG00000196419	ENSMUSG00000022471
UniProt	P12956	P23475
RefSeq (mRNK)	NM_001469 NM_001288976 NM_001288977 NM_001288978	NM_010247
RefSeq (bjelančevina)	NP_001275905 NP_001275906 NP_001275907 NP_001460 NP_001275905.1 NP_001460.1	NP_034377
Lokacija (UCSC)	Chr 22: 41.62 – 41.66 Mb	Chr 15: 81.87 – 81.92 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 609 aminokiselina, a molekulska težina 69.843 Da.^[5]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MSGWESYYKT		EGDEEAEEEQ		EENLEASGDY		KYSGRDSLIF		LVDASKAMFE
SQSEDELTPF		DMSIQCIQSV		YISKIISSDR		DLLAVVFYGT		EKDKNSVNFK
NIYVLQELDN		PGAKRILELD		QFKGQQGQKR		FQDMMGHGSD		YSLSEVLWVC
ANLFSDVQFK		MSHKRIMLFT		NEDNPHGNDS		AKASRARTKA		GDLRDTGIFL
DLMHLKKPGG		FDISLFYRDI		ISIAEDEDLR		VHFEESSKLE		DLLRKVRAKE
TRKRALSRLK		LKLNKDIVIS		VGIYNLVQKA		LKPPPIKLYR		ETNEPVKTKT
RTFNTSTGGL		LLPSDTKRSQ		IYGSRQIILE		KEETEELKRF		DDPGLMLMGF
KPLVLLKKHH		YLRPSLFVYP		EESLVIGSST		LFSALLIKCL		EKEVAALCRY
TPRRNIPPYF		VALVPQEEEL		DDQKIQVTPP		GFQLVFLPFA		DDKRKMPFTE
KIMATPEQVG		KMKAIVEKLR		FTYRSDSFEN		PVLQQHFRNL		EALALDLMEP
EQAVDLTLPK		VEAMNKRLGS		LVDEFKELVY		PPDYNPEGKV		TKRKHDNEGS
GSKRPKVEYS		EEELKTHISK		GTLGKFTVPM		LKEACRAYGL		KSGLKKQELL
EALTKHFQD

Funkcija

Ku70 i Ku80 zajeno čine Ku heterodimer, koji se vezuje za krajeve dvolančanog prekida DNK i potreban je za put popravka DNK nehomolognim spajanjem krajevaa (NHEJ). Također potreban je za V(D)J rekombinaciju, koja koristi NHEJ put za promoviranje raznolikosti antigena u imunskom sistemu sisara.

Osim svoje uloge u NHEJ, Ku je također potreban za održavanje dužine telomere i utišavanje subtelomernih gena.^[7]

Ku je prvobitno identificiran kada je otkriveno da pacijenti sa sistemskim eritemskim lupusom imaju visok nivo autoantitijela na protein.^[5]

Starenje

Mišje embrionske matične ćelije sa homozigotnim Ku70 mutacijama, odnosno Ku70^–/– ćelije , imaju značajno povećanu osetljivost na ionizirajuće zračenje u poređenju sa heterozigotnim Ku70^+/– ili divljim tipom Ku70 ^+/+ embrionskih matičnih ćelija.^[8] Mutantni miševi s nedostatkom Ku70 imaju rano starenje.^[9] Koristeći nekoliko specifičnih kriterija starenja, otkriveno je da mutantni miševi pokazuju iste znakove starenja kao kontrolni miševi, ali u znatno ranijoj hronološkoj dobi. Ovi rezultati sugeriraju da smanjena sposobnost popravljanja dvostrukih lanaca DNK uzrokuje rano starenje i da divlji tip gena Ku70 ima važnu ulogu u osiguranju dugovječnosti.^[10]

Klinički značaj

Mutacija ovog gena je opisana u skupu od 24 porodice sa autizmom.^[11] Iako ovo sugeriše da ovaj gen može imati ulogu u razvoju autizma, potrebno je dalje istraživanje.

Nomenklatura

Ku70 se pominje sa nekoliko imena uključujući:

• Lupus Ku autoantigeni protein p70
• Podjedinica 1 ATP-ovisne DNK-helikaze 2
• Rendgenski popravak koji dopunjuje defektnu popravku u ćelijama kineskog hrčka 6
• Rendgenski popravak unakrsnog komplementarnog 6 (XRCC6)

Interakcije

Pokazalo se da Ku70 reaguje sa:

• CBX5,^[12]
• CHEK1,^[13]
• CREBBP,^[14]
• GCN5L2,^[14]
• HOXC4,^[15]
• Ku80,^{[14][16][17][18][19]}
• MRE11A,^[20]
• NCOA6,^[21][22]
• NCF4,^[23]
• PCNA,^[24][25]
• PTTG1,^[26]
• RPA2,^[27]
• TERF2,^[19]
• TERT^[28]
• VAV1,^[29] i
• WRN.^[30][31]