RAD23A

Protein RAD23 homologa A UV ekscizijskog popravka jest protein koji je kod ljudi kodiran genom RAD23A sa p kraka hromosoma 19.^[5]

RAD23A
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 1DV0, 1F4I, 1IFY, 1OQY, 1P98, 1P9D, 1QZE, 1TP4, 2WYQ
Identifikatori
Aliasi	RAD23A
Vanjski ID-jevi	OMIM: 600061 MGI: 105126 HomoloGene: 48322 GeneCards: RAD23A
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 19 (čovjek)[1] Bend 19p13.13 Početak 12,945,855 bp[1] Kraj 12,953,642 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 8 (miš)[2] Bend 8|8 C3 Početak 85,560,648 bp[2] Kraj 85,567,294 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • single-stranded DNA binding • ubiquitin-specific protease binding • oštećeno vezivanje sa DNK • polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • kinase binding • ubiquitin binding • proteasome binding Ćelijska komponenta • Proteasom • nukleoplazma • centar organizacije mikrotubula • citosol • jedro • citoplazma • intracellular membrane-bounded organelle • GO:0009327 makromolekulani kompleks Biološki proces • Popravak ekscizijom nukleotida • positive regulation of viral genome replication • GO:0022415 viral process • GO:0100026 Popravka DNK • cellular response to DNA damage stimulus • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein deubiquitination • protein destabilization • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of cell cycle Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	5886	19358
Ensembl	ENSG00000179262	ENSMUSG00000003813
UniProt	P54725	P54726
RefSeq (mRNK)	NM_001270362 NM_001270363 NM_005053	NM_001297606 NM_001297607 NM_009010 NM_001378894 NM_001378895 NM_001378896
RefSeq (bjelančevina)	NP_001257291 NP_001257292 NP_005044	NP_001284535 NP_001284536 NP_033036 NP_001365823 NP_001365824 NP_001365825
Lokacija (UCSC)	Chr 19: 12.95 – 12.95 Mb	Chr 8: 85.56 – 85.57 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 363 aminokiseline, a molekulska težina 39.609 Da.^[6]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MAVTITLKTL		QQQTFKIRME		PDETVKVLKE		KIEAEKGRDA		FPVAGQKLIY
AGKILSDDVP		IRDYRIDEKN		FVVVMVTKTK		AGQGTSAPPE		ASPTAAPESS
TSFPPAPTSG		MSHPPPAARE		DKSPSEESAP		TTSPESVSGS		VPSSGSSGRE
EDAASTLVTG		SEYETMLTEI		MSMGYERERV		VAALRASYNN		PHRAVEYLLT
GIPGSPEPEH		GSVQESQVSE		QPATEAAGEN		PLEFLRDQPQ		FQNMRQVIQQ
NPALLPALLQ		QLGQENPQLL		QQISRHQEQF		IQMLNEPPGE		LADISDVEGE
VGAIGEEAPQ		MNYIQVTPQE		KEAIERLKAL		GFPESLVIQA		YFACEKNENL
AANFLLSQNF		DDE

Funkcija

Protein kodiran ovim genom je jedan od dva ljudska homologa Saccharomyces cerevisiae Rad23, proteina uključenog u popravak nukleotidnom ekscizijom (NER). Pokazalo se da ovaj protein stupa u interakciju sa i podiže ekscizijsku aktivnost nukleotida 3-metiladenin-DNK glikozilaze (MPG), što ukazuje na ulogu u prepoznavanju oštećenja DNK u ekscizijskoj popravci baza. Ovaj protein sadrži N-terminalni domen sličan ubikvitinu, za koji je objavljeno da interraguje sa proteasomom 265, kao i sa ubikvitinskom protein-ligazom E6AP, i stoga sugeriše da bi ovaj protein mogao biti uključeni u proteolitski put u ćelijama posredovan ubikvitinom^[6]

Interakcije

Pokazano je da RAD23A interraguje sa:

• Ataksin 3,
• Ataxin 3,^[7]
• PSMD4,^[8][9] i
• Sekvestosom 1.^[10]